Job Description P37747 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:57:23 GMT 2012 Rank 26 Aligned Residues 360 % Identity 13% Template c1h83A_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:polyamine oxidase; PDBTitle: structure of polyamine oxidase in complex with2 1,8-diaminooctane Resolution 1.9 Å

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.		.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.																																																			.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.																																																			.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	Y	I	I	V	G	S	G	L	F	G	A	V	C	A	N	E	L	K	K	L	N	.	K	K	V	L	V	I	E	K	R	N	H	I	G	G	N	A	Y	T	E	D	C	E	G	I	Q	I	H	K	Y	G	A	H	I	F	H	T	N	D	K	Y	I	W	D	Y	V	N	D	L	V	E	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																								.																																																			.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.																												.																							.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																				.
Template Sequence		R	V	I	V	V	G	A	G	M	S	G	I	S	A	A	K	R	L	S	E	A	G	I	T	D	L	L	I	L	E	A	T	D	H	I	G	G	R	M	H	K	T	N	F	A	G	I	N	V	E	.	L	G	A	N	W	V	E	G	V	N	G	G	K	M	N	P	I	W	P	I	V	N	S	T	L	K	L	R	N
Template Known Secondary structure									B													T	T									S	S	S	S	S	B	T	T	S						T	T					.	S	S								S	S	S	S			T							T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																																				.
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.		.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
			75	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.				.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150
Predicted Secondary structure		.																																																																	.	.	.
Query SS confidence		.																																																																	.	.	.
Query Sequence		.	F	N	R	F	T	N	S	P	L	A	I	Y	K	D	K	L	F	N	L	P	F	N	M	N	T	F	H	Q	M	W	G	V	K	D	P	Q	E	A	Q	N	I	I	N	A	Q	K	K	K	Y	G	D	K	V	P	E	N	L	E	E	Q	A	I	S	L	.	.	.	V	G	E	D	L	Y	Q	A	L	I	K	G
Query Conservation		.																																																																	.	.	.
Alig confidence		.																																																																	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	R	S	D	F	D	Y	L	A	Q	N	V	Y	K	E	D	G	G	V	Y	D	E	D	Y	V	Q	K	R	I	E	L	A	D	S	V	E	E	M	G	E	K	L	S	A	T	L	H	A	S	G	R	D	D	M	S	I	L	A	M	Q	R	L	N	E	H	Q	P	N	G	P	A	T	P	V	D	M	V	V	D	Y
Template Known Secondary structure							T	T	G	G	G					S	S	S	S	B																										T	S		T	T	S	T	T			B										T	S	S	S	S			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
		151	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.									.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.			.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.													.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.													.	.	.
Query Sequence		Y	T	E	K	Q	W	G	R	S	A	K	E	L	P	A	.	.	.	.	.	.	.	.	F	I	I	K	R	I	P	V	R	F	T	F	D	N	N	Y	F	S	D	R	Y	Q	G	I	P	V	G	G	Y	T	K	L	I	E	K	M	L	E	G	V	.	.	D	V	K	L	G	I	D	F	L	K	D	K	.	.	.
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.													.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.													.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	K	F	D	Y	E	F	A	E	P	P	R	V	T	S	L	Q	N	T	V	P	L	A	T	F	S	D	F	G	D	D	V	Y	F	V	A	D	Q	R	G	Y	E	A	V	V	Y	Y	L	A	G	Q	Y	L	K	T	D	D	K	S	G	K	I	V	D	P	R	L	Q	L	N	K	V	V	R	E	I	K	Y	S	P
Template Known Secondary structure				T					S	S		G	G	G	B	B	S	T	T	T	S	S									S								T	T		T	T									T	T	S		B		T	T	T			B			T	T			S	S										S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.
										218	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.															.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.				.	.	.	.	.	270	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	D	S	L	A	S	K	A	H	R	I	I	Y	T	G	P	I	D	Q	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	D	Y	R	F	G	A	L	E	Y	R	S	L	K	F	E	T	E	R	H	E	F	P	N	F	Q	G	N	.	.	.	A	V	I	N	F	T	D	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	G	V	T	V	K	T	E	D	N	S	V	Y	S	A	D	Y	V	M	V	S	A	S	L	G	V	L	Q	S	D	L	I	Q	F	K	P	K	L	P	T	W	K	V	R	A	I	Y	Q	F	D	M	A	V	Y	T	K	I	F	L	K	F	P	R	K	F	W	P	E	G	K	G	R	E	F	F	L	Y	A	S	S
Template Known Secondary structure		S							T	T	S						S						S							T	T	S	S				S													S													S	S			S			S	T	T		S							S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		245	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.
		273	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.				310	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.
Query Sequence		N	V	P	Y	T	R	I	I	E	H	K	H	F	D	Y	V	E	T	K	H	T	V	V	T	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	Y	P	L	E	W	K	V	G	D	E	P	.	.	.	Y	Y	P
Query Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	R	G	Y	Y	G	V	W	Q	E	F	E	K	Q	Y	P	D	A	N	V	L	L	V	T	V	T	D	E	E	S	R	R	I	E	Q	Q	S	D	E	Q	T	K	A	E	I	M	Q	V	L	R	K	M	F	P	G	K	D	V	P	D	A	T	D	I	L	V	P	R	W	W	S	D	R	F	Y	K	G	T	F	S
Template Known Secondary structure		S	T	T	S	S							T	T	T	S	T	T																		T	S																		T	T	S						S							T	T	T		T	T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		325	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.
		313	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.		.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																						.
Query SS confidence																																						.
Query Sequence		V	N	D	N	K	N	M	E	L	F	K	K	Y	R	E	L	A	S	R	E	D	K	V	I	F	G	G	R	L	A	E	Y	K	Y	Y	D	.	M	H	Q	V	I	S	A	A	L	Y	Q	V	K	N	I	M	S
Query Conservation																																						.
Alig confidence																	.	.																				.
Template Conservation																	.	.
Template Sequence		N	W	P	V	G	V	N	R	Y	E	Y	D	Q	L	R	.	.	A	P	V	G	R	V	Y	F	T	G	E	H	T	S	E	H	Y	N	G	Y	V	H	G	A	Y	L	S	G	I	D	S	A	E	I	L	I	N
Template Known Secondary structure				B	T	T											.	.			B	T	T					S	G	G	G		T	T	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																	.	.
Template SS confidence
		405	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.			420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.