Job Description P24169 Confidence 99.87% Date Thu Jan 5 11:40:44 GMT 2012 Rank 52 Aligned Residues 373 % Identity 15% Template d2bwna1 SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases GABA-aminotransferase-like Resolution 2.1

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		94	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.					.	.	.	.	.	130	.	.					.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.									.	.	.	.
Query SS confidence																																	.	.	.	.									.	.	.	.
Query Sequence		R	Q	L	E	T	A	A	S	H	Y	E	T	Q	L	R	P	P	F	F	R	A	L	V	D	Y	V	N	Q	G	N	S	.	.	.	.	A	F	D	C	P	G	H	Q	.	.	.	.	G	G	E	F	F	R	R	H	P	A	G	N	Q	F	V	E	Y	F	G	E	A	L	F	R	A	D	L	C	N	A	D	V	A
Query Conservation																																	.	.	.	.									.	.	.	.
Alig confidence																																	.	.	.	.									.	.	.	.																													.	.
Template Conservation																																																																													.	.
Template Sequence		L	A	L	D	K	A	I	Q	K	L	H	D	E	G	R	Y	R	T	F	I	D	I	E	R	E	K	G	A	F	P	K	A	Q	W	N	R	P	D	G	G	K	Q	D	I	T	V	W	C	G	N	D	Y	L	G	M	G	Q	H	P	V	V	L	A	A	M	H	E	A	L	E	A	V	G	A	G	.	.	S	G	G
Template Known Secondary structure														T	T												T	T	S	T	T							T	T	S									S		S		T	T	S	G	G	G																	S		.	.			S
Template Predicted Secondary structure																																																																													.	.
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.			80	.	.
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.			.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.
Query SS confidence																																																			.	.
Query Sequence		M	G	D	L	L	I	H	E	G	A	P	C	I	A	Q	Q	H	A	A	K	V	F	N	A	D	K	T	Y	F	V	L	N	G	T	S	S	S	N	K	V	V	L	N	A	L	L	T	P	G	.	.	D	L	V	L	F	D	R	N	N	H	K	S	N	H	H	G	A	L	L	Q	A	G	A	T	P	V	Y	L	E
Query Conservation																																																			.	.
Alig confidence																																.																			.	.																	.
Template Conservation																																.																																					.
Template Sequence		T	R	N	I	S	G	T	T	A	Y	H	R	R	L	E	A	E	I	A	G	L	H	Q	K	E	A	A	L	V	F	.	S	S	A	Y	N	A	N	D	A	T	L	S	T	L	R	V	L	F	P	G	L	I	I	Y	S	D	S	L	N	H	A	S	M	I	E	G	.	I	K	R	N	A	G	P	K	R	I	F	R
Template Known Secondary structure		B	T	T	T	B																	T	T		S						.	S																	S	T	T							T	T									.				S
Template Predicted Secondary structure																																.																																					.
Template SS confidence
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.		.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.		.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
		244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.		.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
Predicted Secondary structure																																																		.
Query SS confidence																																																		.
Query Sequence		T	A	R	N	P	Y	G	F	I	G	G	I	D	A	H	C	F	E	E	S	Y	L	R	E	L	I	A	E	V	A	P	Q	R	A	K	E	A	R	P	F	R	L	A	V	I	Q	L	G	.	T	Y	D	G	T	I	Y	N	A	R	Q	V	V	D	K	I	G	H	L	C	D	Y	I	L	F	D	S	A	W	V	G
Query Conservation																																																		.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.									.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	V	A	H	L	R	E	L	I	A	A	D	D	P	A	A	P	.	.	.	.	.	.	K	L	I	A	F	E	S	V	Y	S	M	D	G	D	F	G	P	I	K	E	I	C	D	I	A	E	E	F	G	A	L	T	Y	I	D	E	V	H	A	V
Template Known Secondary structure		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												S		T	T	S		.	.	.	.	.	.							S	B		T	T	T			B														T								T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		161	.																.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.							180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	E	Q	F	I	P	M	M	A	D	C	S	P	L	L	L	D	L	N	E	N	D	P	G	I	L	V	T	Q	S	V	H	K	Q	Q	A	G	F	S	Q	T	S	Q	I	H	K	K	D	S	H	I	K	G	Q	Q	R	Y	V	P	H	K	R	M	N	N	A	F	M	M	H	A	S	T	S	P	F	Y	P	L	F
Query Conservation
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	M	Y	G	P	R	G	A	G	V	A	E	R	D	G	L	M	H	R	I	D	.	.	.	.	.	.	.	.	I	F	N	G	T	L	A	A	Y	G	V	F	G	G	Y	I	A	A	S	A	R	.	.	.	.	.	.	.	M	V	D	A	V	R	S	Y	A	P	G	F	I	F	S	T	S	L	P	P	A	I	A
Template Known Secondary structure		T	T	S	S	T	T	S								T		G	G	G		S	.	.	.	.	.	.	.	.											S											.	.	.	.	.	.	.														T	S	B
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240									.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.								.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.
		403	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	A	L	N	I	N	A	K	M	H	E	G	V	S	G	R	N	M	W	M	D	C	V	V	N	G	I	N	A	R	K	L	I	L	D	N	C	Q	H	I	R	P	F	V	P	E	L	V	D	G	K	P	W	Q	S	Y	E	T	A	Q	I	A	V	D	L	R	F	F	Q	F	V	P	G	E	H	W	H	S	F	E
Query Conservation
Alig confidence																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	G	A	Q	A	S	I	A	F	L	K	T	A	E	G	Q	K	L	R	D	A	Q	Q	M	H	A	K	V	L	K	M	R	L	K	A	L	G	M	P	I	I	D	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure												T	S																									T			B				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		286	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.
		483	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.								.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																						.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	Y	A	E	N	Q	Y	F	V	D	P	C	K	L	L	L	T	T	P	G	I	D	A	R	N	G	E	Y	E	A	F	G	V	P	A	T	I	L	A	N	F	L	R	E	N	G	V	V	P	E	K	C	.	.	.	.	.	.	.	D	L	N	S	I	L	F	L	L	T	P	A	E	D	M	A	K	L	Q	Q	L
Query Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	H	I	V	P	V	V	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	P	V	H	T	K	A	V	S	D	M	L	L	S	D	Y	G	V	Y	V	Q	P	I	N	F	P	T	V	P	R	G	T	E	R	L	R	F	T	P	S	P	V	H	D	L	K	Q	I	D	G	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										T	T	T	S		T	T										T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
											329	330	.	.	.	.	.	.	.											.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		556	.	.	.	560	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	A	L	L	V	R	F
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		V	H	A	M	D	L	L
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		390	.	.	.	.	.	.