Job Description P24169 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:40:44 GMT 2012 Rank 11 Aligned Residues 329 % Identity 22% Template d2a7va1 SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases GABA-aminotransferase-like Resolution 2.04

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		179	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.					.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.
Query Sequence		A	Q	Q	H	A	A	K	V	F	N	A	D	K	T	Y	F	V	L	N	.	.	.	.	G	T	S	S	S	N	K	V	V	L	N	A	L	L	T	P	G	D	L	V	L	F	D	R	N	N	H	K	S	N	H	H	G	A	L	L	Q	A	G	A	T	P	V	Y	L	E	T	A	R	N	P	Y	G	F	I	G	G
Query Conservation																					.	.	.	.
Alig confidence																					.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		C	Q	R	R	A	L	E	A	F	D	L	D	P	A	Q	W	G	V	N	V	Q	P	Y	S	G	S	P	A	N	L	A	V	Y	T	A	L	L	Q	P	H	D	R	I	M	G	Y	K	L	N	P	K	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										T	T			T	T	T								S	S															S									B		T	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		103	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.
		255	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	D	A	H	C	F	E	E	S	Y	L	R	E	L	I	A	E	V	A	P	Q	R	A	K	E	A	R	P	F	R	L	A	V	I	Q	L	G	T	Y	D	G	T	I	Y	N	A	R	Q	V	V	D	K	I	G	H	L	C	D	Y	I	L	F	D	S	A	W	V	G	Y	E	Q	F	I	P	M	M	A	D	C	S
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	L	I	D	Y	N	Q	L	A	L	T	A	R	L	F	R	P	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	I	I	A	G	T	S	A	Y	A	R	L	I	D	Y	A	R	M	R	E	V	C	D	E	V	K	A	H	L	L	A	D	M	A	H	I	S	G	L	V	A	A	.	.	.	.	K	V	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	S	B															S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							S	S			S														T	T								G	G	G						T	.	.	.	.	T	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.
Template SS confidence
						187	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.											.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.					.	.	.
		335	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370						.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.
Query SS confidence																																						.	.	.	.	.
Query Sequence		P	L	L	L	D	L	N	E	N	D	P	G	I	L	V	T	Q	S	V	H	K	Q	Q	A	G	F	S	Q	T	S	Q	I	H	K	K	D	.	.	.	.	.	S	H	I	K	G	Q	Q	R	Y	V	P	H	K	R	M	N	N	A	F	M	M	H	A	S	T	S	P	F	Y	P	L	F	A	A	L	N	I	N	A
Query Conservation																																						.	.	.	.	.
Alig confidence							.				.	.	.	.																								.	.	.	.	.
Template Conservation							.				.	.	.	.
Template Sequence		P	S	P	F	K	.	H	A	D	.	.	.	.	I	V	T	T	T	T	H	K	T	L	R	G	A	R	S	G	L	I	F	Y	R	K	G	V	K	A	V	D	P	K	T	G	R	E	I	P	Y	T	F	E	D	R	I	N	F	A	V	F	P	S	L	Q	G	G	P	H	N	H	A	I	A	A	V	A	V	A	L
Template Known Secondary structure				G	G	G	.	T		S	.	.	.	.						S	S	G	G	G		S		S									S						T	T	T																	T	T	T	T			S
Template Predicted Secondary structure							.				.	.	.	.
Template SS confidence
		249	250	.	.	.		.	.	.					.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
		410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	M	H	E	G	V	S	G	R	N	M	W	M	D	C	V	V	N	G	I	N	A	R	K	L	I	L	D	N	C	Q	H	I	R	P	F	V	P	E	L	V	D	G	K	P	W	Q	S	Y	E	T	A	Q	I	A	V	D	L	R	F	F	Q	F	V	P	G	E	H	W	H	S	F	E	G	Y	A	E	N	Q	Y
Query Conservation
Alig confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	Q	A	C	T	P	M	F	R	E	Y	S	L	Q	V	L	K	N	A	R	A	M	A	D	A	L	L	E	R	G	Y	S	L	V	S	G	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						S																								T	T				G	G	G	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.
		490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.														.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	V	D	P	C	K	L	L	L	T	T	P	G	I	D	A	R	N	G	E	Y	E	A	F	G	V	P	A	T	I	L	A	N	F	L	R	E	N	G	V	V	P	E	K	C	D	L	N	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	L	F	L	L	T	P	A	E	D	M	A	K	L	Q	Q	L	V
Query Conservation																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	D	N	H	L	V	L	V	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	P	K	G	L	D	G	A	R	A	E	R	V	L	E	L	V	S	I	T	A	N	K	N	T	C	P	G	D	R	S	A	I	T	P	G	G	L	R	L	G	A	P	A	L	T	S	R	Q	F	R	E	D	D	F	R	R	V	V
Template Known Secondary structure		.	.	S	S	S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T	T													T	T									T	T				S	S	S		S						S						T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
				362	.	.	.	.	.	.	.	370											.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		557	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	L	L	V	R	F	E	K	L	L	E	S	D	A	P	L	A	E	V	L	P	S	I	Y	K	Q	H	E	E	R	Y	A	G	Y	T	L	R	Q	L	C	Q	E	M	H	D	L	Y	A	R	H	N	V	K	Q	L	Q	K	E	M	F	R	K	E	H	F	P	R	V	S	M	N	P	Q	E	A	N	Y	A	Y	L
Query Conservation
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	F	I	D	E	G	V	N	I	G	L	E	V	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	K	T	A	K	L	Q	D	F	K	S	F	L	L
Template Known Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					S
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.																																																					.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.
		637	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.		.	.	.
Predicted Secondary structure																											.
Query SS confidence																											.
Query Sequence		R	G	E	V	E	L	V	R	L	P	D	A	E	G	R	I	A	A	E	G	A	L	P	Y	P	.	P	G	V
Query Conservation																											.
Alig confidence																			.								.
Template Conservation																			.
Template Sequence		K	D	S	E	T	S	Q	R	L	A	N	L	R	Q	R	V	E	.	Q	F	A	R	A	F	P	M	P	G	F
Template Known Secondary structure																			.				T	T	S			S	S
Template Predicted Secondary structure																			.
Template SS confidence
		458	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.		.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.