Job Description P24169 Confidence 99.87% Date Thu Jan 5 11:40:44 GMT 2012 Rank 54 Aligned Residues 360 % Identity 13% Template d1pmma_ SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases Pyridoxal-dependent decarboxylase Resolution 2.00

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		113	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.				.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.
Query Sequence		R	A	L	V	D	Y	V	N	Q	G	N	S	A	F	D	C	P	G	H	Q	G	G	.	.	.	E	F	F	R	R	H	P	A	G	N	Q	F	V	E	Y	F	G	E	A	L	F	R	A	D	L	C	N	A	D	V	A	M	G	D	L	L	I	H	E	G	A	P	C	I	A	Q	Q	H	A	A	K	V	F	N	A
Query Conservation																								.	.	.
Alig confidence																								.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	V	A	F	Q	I	I	N	D	E	L	Y	L	D	G	N	A	R	Q	N	L	A	T	F	C	Q	T	W	D	D	E	N	V	H	K	L	M	D	L	S	I	N	K	N	W	I	D	K	E	E	Y	P	Q	S	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	D	L	R	C	V	N	M	V	A	D	L	W	H	A
Template Known Secondary structure												G	G	G	S			G	G	G	B		S			S															T	T	T		B	T	T		T	T	T	S						.	.	.	.	.	.	.	.	.													T	T
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.										.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110
		190	.	.							.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210													.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	K	T	.	.	.	.	.	.	Y	F	V	L	N	G	T	S	S	S	N	K	V	V	L	N	A	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	T	P	G	D	L	V	L	F	D	R	N	N	H	K	S	N	H	H	G	A	L	L	Q	A	G	A	T	P	V	Y	L	E	T	A	R	N	P	Y	G	F
Query Conservation					.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.																				.	.
Template Conservation																																																												.																				.	.
Template Sequence		P	A	P	K	N	G	Q	A	V	G	T	N	T	I	G	S	S	E	A	C	M	L	G	G	M	A	M	K	W	R	W	R	K	R	M	E	A	A	G	K	P	T	D	K	P	N	L	V	C	G	P	V	Q	I	C	W	H	K	.	F	A	R	Y	W	D	V	E	L	R	E	I	P	M	R	P	G	Q	L	.	.
Template Known Secondary structure					T	T	S			S					S	S																								T				S							S	S								.					T	T									B	T	T	B		.	.
Template Predicted Secondary structure																																																												.																				.	.
Template SS confidence
		111	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.		.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.
		252	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.		.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.							.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.																					.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																										.																					.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	G	G	I	D	A	H	C	F	E	E	S	Y	L	R	E	L	I	A	E	V	A	P	Q	R	A	K	E	A	R	P	F	R	L	A	V	I	Q	L	G	.	T	Y	D	G	T	I	Y	N	A	R	Q	V	V	D	K	I	G	H	L	C	.	.	.	.	.	.	D	Y	I	L	F	D	S	A	W	V	G	Y	E
Query Conservation																																										.																					.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.																					.	.	.	.	.	.													.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																														.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	F	M	D	P	K	R	M	I	E	A	C	D	E	N	T	I	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	V	P	T	F	G	V	T	Y	T	G	N	Y	E	F	P	Q	P	L	H	D	A	L	D	K	F	Q	A	D	T	G	I	D	I	D	M	H	I	D	A	A	S	G	G	F	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	S												T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				B	B	S		T	T	T		B	B																												T	T	G	G	G	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																														.
Template SS confidence
									188	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.											.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		325	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.		.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.																																																															.	.	.	.
Query SS confidence															.																																																															.	.	.	.
Query Sequence		Q	F	I	P	M	M	A	D	C	S	P	L	L	.	L	D	L	N	E	N	D	P	G	I	L	V	T	Q	S	V	H	K	Q	Q	A	G	F	S	Q	T	S	Q	I	H	K	K	D	S	H	I	K	G	Q	Q	R	Y	V	P	H	K	R	M	N	N	A	F	M	M	H	A	S	T	S	P	F	Y	.	.	.	.
Query Conservation															.																																																															.	.	.	.
Alig confidence		.													.							.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.
Template Conservation		.																				.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	L	A	P	F	V	A	P	D	I	V	W	D	F	R	L	P	R	V	K	.	.	.	.	S	I	S	A	S	G	H	K	F	G	L	A	P	L	G	C	G	W	V	I	W	R	D	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	A	L	P	Q	E	L	V	F	N	V	D	Y	L	G	G	Q
Template Known Secondary structure		.	T						T	T				S	T	T	S	T	T			.	.	.	.						T	T	T	T	T				S	S							S	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	S		G	G	G							T	T
Template Predicted Secondary structure		.																				.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
			250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.					.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.																.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
														400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	L	F	A	A	L	N	I	N	A	K	M	H	E	G	V	S	G	R	N	M	W	M	D	C	V	V	N	G	I	N	A	R	K	L	I	L	D	N	C	Q	H	I	R	P	F	V	P	E	L	V	D	G	K	P	W	Q	S	Y	E	T	A	Q	I	A	V	D	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	G	T	F	A	I	N	F	S	R	P	A	G	Q	V	I	A	Q	Y	Y	E	F	L	R	L	G	R	E	G	Y	T	K	V	Q	N	A	S	Y	Q	V	A	A	Y	L	A	D	E	I	A	K	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							S			S		B	S																																						T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.
		468	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.								.	.	.	.	.	.	.	540
Predicted Secondary structure																																																																			.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																			.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	F	F	Q	F	V	P	G	E	H	W	H	S	F	E	G	Y	A	E	N	Q	Y	F	V	D	P	C	K	L	L	L	T	T	P	G	I	D	A	R	N	G	E	Y	E	A	F	G	V	P	A	T	I	L	A	N	F	L	R	E	N	G	V	V	P	E	.	.	.	.	.	.	.	K	C	D	L	N	S	I	L
Query Conservation																																																																			.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	Y	E	F	I	C	T	G	R	P	D	E	G	I	P	A	V	C	F	K	L	K	D	G	.	.	.	.	.	.	.	E	D	P	G	Y	T	L	Y	D	L	S	E	R	L	R	L	R	G	W	Q	V	P	A	F	T	L	G	G	E	A	T	D	I	V	V	M	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										T	T	T	B	S	S								T	T	.	.	.	.	.	.	.				S	S											T	T	T		B								T	T		T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
														362	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.								.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.
		541	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	L	L	T	P	A	E	D	M	A	K	L	Q	Q	L	V	A	L	L	V	R	F	E	K	L	L	E	S	D
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		I	M	C	R	R	G	F	E	M	D	F	A	E	L	L	L	E	D	Y	K	A	S	L	K	Y	L	S	D	H
Template Known Secondary structure						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		423	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.