Job Description P24169 Confidence 99.92% Date Thu Jan 5 11:40:44 GMT 2012 Rank 25 Aligned Residues 322 % Identity 12% Template d1o69a_ SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases GABA-aminotransferase-like Resolution 1.84

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		168	.	170	.	.	.	.	.		.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210		.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.																																				.
Query SS confidence										.																																				.
Query Sequence		D	L	L	I	H	E	G	A	.	P	C	I	A	Q	Q	H	A	A	K	V	F	N	A	D	K	T	Y	F	V	L	N	G	T	S	S	S	N	K	V	V	L	N	A	L	.	L	T	P	G	D	L	V	L	F	D	R	N	N	H	K	S	N	H	H	G	A	L	L	Q	A	G	A	T	P	V	Y	L	E	T	A
Query Conservation										.																																				.
Alig confidence										.																				.																.																				.
Template Conservation																														.																																				.
Template Sequence		N	Y	I	A	P	L	G	E	F	V	N	R	F	E	Q	S	V	K	D	Y	S	K	S	E	N	A	L	A	.	L	N	S	A	T	A	A	L	H	L	A	L	R	V	A	G	V	K	Q	D	D	I	V	L	A	S	S	F	T	F	I	A	S	V	A	.	P	I	C	Y	L	K	A	K	P	V	F	I	D	C	D
Template Known Secondary structure		T	T	T	S		T	T																	S					.		S													T	T			T	T							S	S	S		G	G	G	T		.					T	T								B
Template Predicted Secondary structure																														.																																				.
Template SS confidence
		25	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.		.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.		.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.
		246	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	N	P	Y	G	F	I	G	G	I	D	A	H	C	F	E	E	S	Y	L	R	E	L	I	A	E	V	A	P	Q	R	A	K	E	A	R	P	F	R	L	A	V	I	Q	L	G	T	Y	D	G	T	I	Y	N	A	R	Q	V	V	D	K	I	G	H	L	C	D	Y	I	L	F	D	S	A	W	V	G	Y	E	Q
Query Conservation
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	T	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	I	D	V	D	L	L	K	L	A	I	K	E	C	E	K	K	P	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	I	L	T	H	L	Y	G	N	A	A	K	M	D	E	I	V	E	I	C	K	E	N	D	I	V	L	I	E	D	A	A	E	A	L	G	S	F
Template Known Secondary structure		T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	B													S	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.							G	G	G															T	T								T	T		T	T
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		103	.	.											.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.										.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
		326	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.			.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	I	P	M	M	A	D	C	S	P	L	L	L	D	L	N	E	N	D	P	G	I	L	V	T	Q	S	.	.	V	H	K	Q	Q	A	G	F	S	Q	T	S	Q	I	H	K	K	D	S	H	I	K	G	Q	Q	R	Y	V	P	H	K	R	M	N	N	A	F	M	M	H	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																													.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.						.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	K	.	.	.	.	.	.	.	N	K	A	L	G	T	F	G	E	.	.	.	.	F	G	V	Y	S	Y	N	G	N	K	I	I	T	T	S	G	G	G	M	L	I	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	N	K	E	K	I	E	K	A	R	F	Y	S	T	Q	A	R	E	N	C	L	H	Y	E
Template Known Secondary structure			T	.	.	.	.	.	.	.	T			T	T	S	S	S	S	.	.	.	.								T	T	S	S	S			S	S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S												T	B	T				S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		164	.								.	.	.	.	170	.	.	.	.					.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.													.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
			394	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.
Predicted Secondary structure		.
Query SS confidence		.
Query Sequence		.	S	T	S	P	F	Y	P	L	F	A	A	L	N	I	N	A	K	M	H	E	G	V	S	G	R	N	M	W	M	D	C	V	V	N	G	I	N	A	R	K	L	I	L	D	N	C	Q	H	I	R	P	F	V	P	E	L	V	D	G	K	P	W	Q	S	Y	E	T	A	Q	I	A	V	D	L	R	F	F	Q	F
Query Conservation		.
Alig confidence		.																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	L	D	Y	G	Y	N	Y	R	L	S	N	V	L	G	A	I	G	V	A	Q	M	E	V	L	E	Q	R	V	L	K	K	R	E	I	Y	E	W	Y	K	E	F	L	G	E	Y	F	S	F	L	D	E	L	E	N	S	R	S	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S	S				B		B														T	T																				T	T	T								T	T					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		473	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.
Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	P	G	E	H	W	H	S	F	E	G	Y	A	E	N	Q	Y	F	V	D	P	C	K	L	L	L	T	T	P	G	I	D	A	R	N	G	E	Y	E	A	F	G	V	P	A	T	I	L	A	N	F	L	R	E	N	G	V	V	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	R	W	L	S	T	A	L	I	N	F	D	K	N	E	L	N	A	C	Q	K	D	I	N	I	S	Q	K	N	.	.	.	.	.	.	I	T	L	H	P	K	I	S	K	L	I	E	D	L	K	N	K	Q	I	E	T	R	P	L	W	K	A	M	H	T	Q	E	V	F	K	G	A	K	A	Y	L	N
Template Known Secondary structure		.	.	.	.		S	S						S			G	G	G	S														.	.	.	.	.	.																	T	T				B						G	G	G		G	G	G	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
						280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.							.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.
					532	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.
Query SS confidence		.	.	.
Query Sequence		.	.	.	E	K	C	D	L	N	S	I	L	F	L	L	T	P	A	E	D	M	A	K	L	Q	Q	L	V	A	L	L	V	R	F	E	K
Query Conservation		.	.	.
Alig confidence		.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	N	S	E	L	F	F	Q	K	G	I	C	L	P	S	G	T	A	M	S	K	D	D	V	Y	E	I	S	K	L	I	L	K	S	I	K
Template Known Secondary structure		S																T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low