Job Description P24169 Confidence 99.97% Date Thu Jan 5 11:40:44 GMT 2012 Rank 19 Aligned Residues 376 % Identity 18% Template d1kl1a_ SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases GABA-aminotransferase-like Resolution 1.93

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		102	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170									.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	Y	E	T	Q	L	R	P	P	F	F	R	A	L	V	D	Y	V	N	Q	G	N	S	A	F	D	C	P	G	H	Q	G	G	E	F	F	R	R	H	P	A	G	N	Q	F	V	E	Y	F	G	E	A	L	F	R	A	D	L	C	N	A	D	V	A	M	G	D	L	L	.	.	.	.	.	.	.	.	I	H	E
Query Conservation																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.								.							.	.	.	.	.	.	.	.								.										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.								.							.	.	.	.	.	.	.	.								.
Template Sequence		K	Y	L	P	Q	Q	D	P	Q	V	F	A	A	I	E	Q	E	R	K	R	Q	H	A	K	I	E	L	.	.	.	I	A	S	E	N	F	V	.	S	R	A	V	M	E	.	.	.	.	.	.	.	.	A	Q	G	S	V	L	T	.	N	K	Y	A	E	G	Y	P	G	R	R	Y	Y	G	G	C	E	Y	V	D
Template Known Secondary structure																									S				.	.	.		T	T					.							.	.	.	.	.	.	.	.			T	S	G	G	G	.	G							T	T			S	S	S
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.								.							.	.	.	.	.	.	.	.								.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.				.	30	.	.	.	.	.		.	.	.	.	40	.									.	.	.	.	.	.	.		.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.
		174	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.				.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250
Predicted Secondary structure																																																					.	.	.
Query SS confidence																																																					.	.	.
Query Sequence		G	A	P	C	I	A	Q	Q	H	A	A	K	V	F	N	A	D	K	T	Y	F	V	L	N	G	T	S	S	S	N	K	V	V	L	N	A	L	L	T	P	G	D	L	V	L	F	D	R	N	N	H	.	.	.	K	S	N	H	H	G	A	L	L	Q	A	G	A	T	P	V	Y	L	E	T	A	R	N	P	Y	G
Query Conservation																																																					.	.	.
Alig confidence																																																					.	.	.							.
Template Conservation																																																														.
Template Sequence		I	V	E	E	L	A	R	E	R	A	K	Q	L	F	G	A	E	H	A	N	V	Q	P	H	S	G	A	Q	A	N	M	A	V	Y	F	T	V	L	E	H	G	D	T	V	L	G	M	N	L	S	H	G	G	H	L	T	H	G	S	P	.	V	N	F	S	G	V	Q	Y	N	F	V	A	Y	G	V	D	P	E	T
Template Known Secondary structure																		S							S	S															T	T								G	G	G	T			G	G	G	T		T	.	T	S						S							B		T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																														.
Template SS confidence
		69	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.		.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.
		251	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	I	G	G	I	D	A	H	C	F	E	E	S	Y	L	R	E	L	I	A	E	V	A	P	Q	R	A	K	E	A	R	P	F	R	L	A	V	I	Q	L	G	T	Y	D	G	T	I	Y	N	A	R	Q	V	V	D	K	I	G	H	L	C	D	Y	I	L	F	D	S	A	W	V	G	Y	E	Q	F	I	P	M	M
Query Conservation
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	.	.	.	.	.	.	.	V	I	D	Y	D	D	V	R	E	K	A	R	L	H	R	P	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	I	V	A	A	A	S	A	Y	P	R	I	I	D	F	A	K	F	R	E	I	A	D	E	V	G	A	Y	L	M	V	D	M	A	H	I	A	G	L	V	A	A	G	L	H
Template Known Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	S	B															S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							S	S			S															T								T	T	T						T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		148								.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.											.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210
		331	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	D	C	S	P	L	L	L	D	L	N	E	N	D	P	G	I	L	V	T	Q	S	V	H	K	Q	Q	A	G	F	S	Q	T	S	Q	I	H	K	K	D	S	H	I	K	G	Q	Q	R	Y	V	P	H	K	R	M	N	N	A	F	M	M	H	A	S	T	S	P	F	Y	P	L	F	A	A	L	N	I	N	A	K
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.							.	.	.	.																.									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.							.	.	.	.																.									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	N	.	.	.	.	.	P	V	P	Y	A	H	.	.	.	.	F	V	T	T	T	T	H	K	T	L	R	G	P	R	G	.	G	M	I	L	C	Q	E	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	A	K	Q	I	D	K	A	I	F	P	G	I	Q	G	G	P	L	M	H	V	I	A	A	K	A	V	A	F	G
Template Known Secondary structure				.	.	.	.	.	S	T	T	T		S	.	.	.	.						S	S	S	T	T				S		.									.	.	.	.	.	.	.	.	.										T	T	T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.							.	.	.	.																.									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		211	.						.	.	.	.	.	.					.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.		.	.	.	.	.	.	240	.										.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.
		411	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	H	E	G	V	S	G	R	N	M	W	M	D	C	V	V	N	G	I	N	A	R	K	L	I	L	D	N	C	Q	H	I	R	P	F	V	P	E	L	V	D	G	K	P	W	Q	S	Y	E	T	A	Q	I	A	V	D	L	R	F	F	Q	F	V	P	G	E	H	W	H	S	F	E	G	Y	A	E	N	Q	Y	F
Query Conservation
Alig confidence																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	A	L	Q	D	D	F	K	A	Y	A	K	R	V	V	D	N	A	K	R	L	A	S	A	L	Q	N	E	G	F	T	L	V	S	G	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					S																								T	T				G	G	G	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		272	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
		491	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.											.	.	.	540	.					.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.
Query SS confidence																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.
Query Sequence		V	D	P	C	K	L	L	L	T	T	P	G	I	D	A	R	N	G	E	Y	E	A	F	G	V	P	A	T	I	L	A	N	F	L	R	E	N	G	V	V	P	E	K	C	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	S	I	L	F	.	.	.	.	L	L	T	P	A	E	D	M	A	K	L	Q	Q	L	V
Query Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.
Alig confidence		.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.
Template Conservation		.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	D	N	H	L	L	L	V	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	P	Q	Q	L	T	G	K	T	A	E	K	V	L	D	E	V	G	I	T	V	N	K	N	T	I	P	Y	D	P	E	S	P	F	V	T	S	G	I	R	I	G	T	A	A	V	T	T	R	G	F	G	L	E	E	M	D	E	I	A
Template Known Secondary structure		.	S	S	S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	T														T									T	T		S	S		T	T	T		S												T	T
Template Predicted Secondary structure		.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
			309	310	.	.	.	.	.	.	.											.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.
		557	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	L	L	V	R	F	E	K	L	L	E	S	D	A	P	L	A	E	V	L	P	S	I	Y	K
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		A	I	I	G	L	V	L	K	N	V	G	S	E	Q	A	L	E	E	A	R	Q	R	V	A	A
Template Known Secondary structure									T		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		378	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.