Job Description P24169 Confidence 99.89% Date Thu Jan 5 11:40:44 GMT 2012 Rank 38 Aligned Residues 361 % Identity 16% Template d1js3a_ SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases Pyridoxal-dependent decarboxylase Resolution 2.25

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		111	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.				130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.
Query Sequence		F	F	R	A	L	V	D	Y	V	N	Q	G	N	S	A	F	D	C	P	.	.	.	G	H	Q	G	G	E	F	F	R	R	H	P	A	G	N	Q	F	V	E	Y	F	G	E	A	L	F	R	A	D	L	C	N	A	D	V	A	M	G	D	L	L	I	H	E	G	A	P	C	I	A	Q	Q	H	A	A	K	V	F
Query Conservation																					.	.	.
Alig confidence																					.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	L	Q	D	V	E	K	I	I	M	P	G	V	T	H	W	H	S	P	Y	F	F	A	Y	F	P	T	A	S	S	Y	P	A	M	L	A	D	M	L	C	G	A	I	G	C	I	G	F	S	W	A	A	S	P	A	C	T	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	E	T	V	M	M	D	W	L	G	K	M	L
Template Known Secondary structure									T	T	G	G	G				T	T	S	T	T	B		S	S	S																							S	S	G	G	G							.	.	.	.	.	.	.	.	.													T
Template Predicted Secondary structure																																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		56	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.										.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.
		188	.	190	.	.	.	.											.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	A	D	K	T	Y	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	L	N	G	T	S	S	S	N	K	V	V	L	N	A	L	L	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	G	D	L	V	L	F	D	R	N	N	H	K	S	N	H	H	G	A	L	L	Q	A	G	A	T
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Template Conservation																																																																									.
Template Sequence		Q	L	P	E	A	F	L	A	G	E	A	G	E	G	G	G	V	I	Q	G	S	A	S	E	A	T	L	V	A	L	L	A	A	R	T	K	V	V	R	R	L	Q	A	A	S	P	G	L	T	Q	G	A	V	L	E	K	L	V	A	Y	A	S	D	Q	A	H	S	S	V	E	R	.	A	G	L	I	G	G	V	K
Template Known Secondary structure		T			G	G	G			T	T	T		S							S																									S	T	T																T	T								.						T
Template Predicted Secondary structure																																																																									.
Template SS confidence
		127	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.		.	.	200	.	.	.	.	.
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.		.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																										.
Query SS confidence																																																										.
Query Sequence		P	V	Y	L	E	T	A	R	N	P	Y	G	F	I	G	G	I	D	A	H	C	F	E	E	S	Y	L	R	E	L	I	A	E	V	A	P	Q	R	A	K	E	A	R	P	F	R	L	A	V	I	Q	L	G	T	Y	D	.	G	T	I	Y	N	A	R	Q	V	V	D	K	I	G	H	L	C	D	Y	I	L	F	D
Query Conservation																																																										.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.																			.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.
Template Sequence		L	K	A	I	P	S	D	G	K	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	M	R	A	S	A	L	Q	E	A	L	E	R	D	.	.	.	.	K	A	A	G	L	I	P	F	F	V	V	A	T	L	G	T	T	S	C	C	S	F	D	N	L	L	E	V	G	P	I	C	H	E	E	D	I	W	L	H	V	D
Template Known Secondary structure									T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.			T	T										B	S		T	T	T			B													T	T
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.
Template SS confidence
		206	.	.	.	210	.	.	.	.	.											.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.					230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	A	W	V	G	Y	E	Q	F	I	P	M	M	A	D	C	S	P	L	L	L	D	L	N	E	N	D	P	G	I	L	V	T	Q	S	V	H	K	Q	Q	A	G	F	S	Q	T	S	Q	I	H	K	K	D	S	H	I	K	G	Q	Q	R	Y	V	P	H	K	R	M	N	N	A	F	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.														.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.														.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	A	Y	A	G	S	A	F	I	C	P	.	.	E	F	R	H	L	L	N	G	V	E	F	A	D	.	.	.	.	S	F	N	F	N	P	H	K	W	L	L	V	N	F	D	C	S	A	M	W	V	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	R	T	D	L	T	G	A	F	K	S	G	L	I	T	D	Y
Template Known Secondary structure			T	T	G	G	G	G	G	G	S	T	.	.	T	T	G	G	G	G	T	T	G	G	G		S	.	.	.	.										S	S			S	S							S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							G	G	G				S				G
Template Predicted Secondary structure													.	.														.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		272	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.			.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.					.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.												.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.
				390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.
Query SS confidence		.	.
Query Sequence		.	.	M	M	H	A	S	T	S	P	F	Y	P	L	F	A	A	L	N	I	N	A	K	M	H	E	G	V	S	G	R	N	M	W	M	D	C	V	V	N	G	I	N	A	R	K	L	I	L	D	N	C	Q	H	I	R	P	F	V	P	E	L	V	D	G	K	P	W	Q	S	Y	E	T	A	Q	I	A	V	D	L
Query Conservation		.	.
Alig confidence		.	.													.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	H	W	Q	L	P	L	G	R	R	F	R	S	L	.	.	K	M	W	F	V	F	R	M	Y	G	V	K	G	L	Q	A	Y	I	R	K	H	V	Q	L	S	H	E	F	E	A	F	V	L	Q	D	P	R	F	E	V	C	A	E	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		G	G	S	S	S		S					T			.	.																																				T	T					S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		347	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360			.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.
		468	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.					.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.	.
Query SS confidence																																																																		.	.	.	.
Query Sequence		R	F	F	Q	F	V	P	G	E	H	W	H	S	F	E	G	Y	A	E	N	Q	Y	F	V	D	P	C	K	L	L	L	T	T	P	G	I	D	A	R	N	G	E	Y	E	A	F	G	V	P	A	T	I	L	A	N	F	L	R	E	N	G	V	V	P	.	.	.	.	E	K	C	D	L	N	S	I	L	F	L	L
Query Conservation																																																																		.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	L	G	L	V	C	F	R	L	K	G	S	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	N	E	A	L	L	E	R	I	N	S	A	R	K	I	H	L	V	P	C	R	L	R	G	Q	F	V	L	R	F	A	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S							S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														T	S		B							T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																										405	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.											.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450
			544	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.
Query SS confidence		.
Query Sequence		.	T	P	A	E	D	M	A	K	L	Q	Q	L	V	A	L	L	V	R	F	E	K	L	L	E	S
Query Conservation		.
Alig confidence		.
Template Conservation
Template Sequence		C	S	R	K	V	E	S	G	H	V	R	L	A	W	E	H	I	R	G	L	A	A	E	L	L	A
Template Known Secondary structure				T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		451	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.