Job Description P24169 Confidence 99.84% Date Thu Jan 5 11:40:44 GMT 2012 Rank 67 Aligned Residues 308 % Identity 12% Template d1b9ha_ SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases GABA-aminotransferase-like Resolution 2.00

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	I	H	E	G	A	P	C	I	A	Q	Q	H	A	A	K	V	F	N	A	D	K	T	Y	F	V	L	N	G	T	S	S	S	N	K	V	V	L	N	A	L	L	T	P	G	D	L	V	L	F	D	R	N	N	H	K	S	N	H	H	G	A	L	L	Q	A	G	A	T	P	V	Y	L	E	T	A	R	N	P	Y
Query Conservation
Alig confidence																																																														.																		.	.
Template Conservation																																																														.																		.	.
Template Sequence		R	M	G	G	D	E	V	N	S	F	E	R	E	F	A	A	H	H	G	A	A	H	A	L	A	V	T	N	G	T	H	A	L	E	L	A	L	Q	V	M	G	V	G	P	G	T	E	V	I	V	P	A	F	T	F	I	S	S	S	Q	.	A	A	Q	R	L	G	A	V	T	V	P	V	D	V	D	A	A	.	.
Template Known Secondary structure		T	T	T		S													T	T		S						S													T	T			T	T							S	S	S		T					.					T	T								B		T	T	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																														.																		.	.
Template SS confidence
		34	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.		.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110
		250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	F	I	G	G	I	D	A	H	C	F	E	E	S	Y	L	R	E	L	I	A	E	V	A	P	Q	R	A	K	E	A	R	P	F	R	L	A	V	I	Q	L	G	T	Y	D	G	T	I	Y	N	A	R	Q	V	V	D	K	I	G	H	L	C	D	Y	I	L	F	D	S	A	W	V	G	Y	E	Q	F	I	P	M
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.						.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.						.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	T	Y	N	L	D	P	E	A	V	A	A	A	V	T	P	R	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	V	I	M	P	V	H	M	A	G	L	M	A	D	M	D	A	L	A	K	I	S	A	D	T	G	V	P	L	L	Q	D	A	A	H	A	.	.	H	G	A	R	W	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	T			B											T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						B		G	G	G																T			B					T	T		.	.	T	T				.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.						.
Template SS confidence
									111	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.													.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.			.	.	.	.	.
		330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	A	D	C	S	P	L	L	L	D	L	N	E	N	D	P	G	I	L	V	T	Q	S	V	H	K	Q	Q	A	G	F	S	Q	T	S	Q	I	H	K	K	D	S	H	I	K	G	Q	Q	R	Y	V	P	H	K	R	M	N	N	A	F	M	M	H	A	S	T	S	P	F	Y	P	L	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.													.	.	.	.														.											.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.													.	.	.	.														.											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	Q	G	K	R	V	G	E	L	D	S	I	A	.	.	.	.	T	F	S	F	Q	N	G	K	L	M	T	A	G	.	E	G	G	A	V	V	F	P	D	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	T	E	K	Y	E	T	A	F	L	R	H	S	C	G	R	P	R	D	D	R	R	Y	F	H	K	I	A	G
Template Known Secondary structure		.	.	T	T			G	G	G	S	S	S			.	.	.	.						T	T	S	S	S		S	S	.	S								T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.												T	B	T	T			T	T		S	S					S
Template Predicted Secondary structure		.	.													.	.	.	.														.											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
				169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180					.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.		.	.	.	.	.	.	200	.	.	.										.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.
						402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	F	A	A	L	N	I	N	A	K	M	H	E	G	V	S	G	R	N	M	W	M	D	C	V	V	N	G	I	N	A	R	K	L	I	L	D	N	C	Q	H	I	R	P	F	V	P	E	L	V	D	G	K	P	W	Q	S	Y	E	T	A	Q	I	A	V	D	L	R	F	F	Q	F	V	P	G	E	H
Query Conservation		.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	N	M	R	L	N	E	F	S	A	S	V	L	R	A	Q	L	A	R	L	D	E	Q	I	A	V	R	D	E	R	W	T	L	L	S	R	L	L	G	A	I	D	G	V	V	P	Q	G	G	D	V	R	A	D	R	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			B		B		B												T	T																					T	S	T	T								T	T			B		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		233	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.
		478	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	H	S	F	E	G	Y	A	E	N	Q	Y	F	V	D	P	C	K	L	L	L	T	T	P	G	I	D	A	R	N	G	E	Y	E	A	F	G	V	P	A	T	I	L	A	N	F	L	R	E	N	G	V	V	P	E	K	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	H	Y	M	A	M	F	R	I	P	G	L	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	R	R	N	A	L	V	D	R	L	V	E	A	G	L	P	A	F	A	A	F	R	A	I	Y	R	T	D	A	F	W	E	L	G	A	P	D	E	S	V	D	A	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S							T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.														T	T										G	G	G	S						S	S			S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																289	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.										.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.
												535	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.		.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	L	N	S	I	L	F	L	L	T	P	A	.	E	D	M	A	K	L	Q	Q	L	V	A	L	L	V	R	F	E	K	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.
Template Conservation
Template Sequence		A	R	R	C	P	N	T	D	A	I	S	S	D	C	V	W	L	H	H	R	V	L	L	A	G	E	P	E	L	H	A	T	A	E	I	I	A	D	A	V	A	R
Template Known Secondary structure				T																G	G	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		346	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.