Job Description P24169 Confidence 99.67% Date Thu Jan 5 11:40:44 GMT 2012 Rank 150 Aligned Residues 340 % Identity 14% Template d1ax4a_ SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases Beta-eliminating lyases Resolution 2.10

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		167	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.							.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	D	L	L	I	H	E	G	A	P	C	I	A	Q	Q	H	A	A	K	V	F	N	A	D	K	T	Y	F	V	L	N	G	T	S	S	S	N	K	V	V	L	N	A	L	L	T	.	.	.	.	.	.	P	G	D	L	V	L	F	D	R	N	N	H	K	S	N	H	H	G	A	L	L	Q	A	G	A	T	P	V
Query Conservation																																																.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																		.														.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																		.
Template Sequence		D	E	A	Y	A	G	S	R	N	Y	Y	D	L	K	D	K	A	K	E	L	F	N	Y	D	Y	I	I	P	A	H	Q	G	.	R	G	A	E	N	I	L	F	P	V	L	L	K	Y	K	Q	K	E	G	K	A	K	N	P	V	F	I	S	N	F	H	F	D	T	T	A	A	H	V	E	L	N	G	C	K	A	I
Template Known Secondary structure					S	S	S																								S	S		.																		T	T			S	S						S	S												T	T
Template Predicted Secondary structure																																		.
Template SS confidence
		69	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100		.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.				.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																												.	.	.
Query SS confidence																																																												.	.	.
Query Sequence		Y	L	E	T	A	R	N	P	Y	G	F	I	G	G	I	D	A	H	C	F	E	E	S	Y	L	R	E	L	I	A	E	V	A	P	Q	R	A	K	E	A	R	P	F	R	L	A	V	I	Q	L	G	T	Y	D	G	T	I	Y	.	.	.	N	A	R	Q	V	V	D	K	I	G	H	L	C	D	Y	I	L	F	D
Query Conservation																																																												.	.	.
Alig confidence																																							.	.	.	.																		.	.	.
Template Conservation																																							.	.	.	.
Template Sequence		N	I	V	T	E	K	A	F	D	S	E	T	Y	D	D	W	K	G	D	F	D	I	K	K	L	K	E	N	I	A	Q	H	G	A	D	N	I	.	.	.	.	V	A	I	V	S	T	V	T	C	N	S	A	G	G	Q	P	V	S	M	S	N	L	K	E	V	Y	E	I	A	K	Q	H	G	I	F	V	V	M	D
Template Known Secondary structure				B		G	G	G	G		T	T	S			T	T	T	T		B														G	G	G		.	.	.	.							S	S	B	T	T	T	T	S	B																		T
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.
Template SS confidence
		148	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.					.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
		318	.	320	.						.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.					340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.																			.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.																			.	.	.	.
Query Sequence		S	A	W	V	.	.	.	.	.	G	Y	E	Q	F	I	P	M	M	A	D	C	S	P	L	L	L	D	.	.	.	.	L	N	E	N	D	P	G	I	L	V	T	Q	S	V	H	K	Q	Q	A	G	F	S	Q	T	S	Q	I	H	K	K	D	S	H	I	K	G	Q	Q	R	Y	V	P	H	K	R	M	N	N	A
Query Conservation						.	.	.	.	.																			.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.																			.	.	.	.					.	.	.	.															.	.										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.															.	.										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	A	R	F	C	E	N	A	Y	F	I	K	A	R	D	P	K	Y	K	N	A	T	I	K	E	V	I	F	D	M	Y	K	Y	A	D	.	.	.	.	A	L	T	M	S	A	K	D	P	L	L	N	I	G	.	.	G	L	V	A	I	R	D	N	E	.	.	.	.	.	.	.	.	E	I	F	T	L	A	R	Q
Template Known Secondary structure			T	T													G	G	G	T	T											G	G	G		S	.	.	.	.												S	S		.	.						S	S			.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.															.	.										.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		224	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.					.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.			.	.	.	.	.	.	.	280	.									.	.	.	.	.	.	.	.
		389	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.			.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.
Query SS confidence																														.	.
Query Sequence		F	M	M	H	A	S	T	S	P	F	Y	P	L	F	A	A	L	N	I	N	A	K	M	H	E	G	V	S	.	.	G	R	N	M	W	M	D	C	V	V	N	G	I	N	A	R	K	L	I	L	D	N	C	Q	H	I	R	P	F	V	P	E	L	V	D	G	K	P	W	Q	S	Y	E	T	A	Q	I	A	V	D
Query Conservation																														.	.
Alig confidence																														.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	C	V	P	M	E	G	F	V	T	Y	G	G	L	A	G	R	D	M	A	A	M	V	Q	G	L	E	E	G	T	E	E	E	Y	L	H	Y	R	I	G	Q	V	K	Y	L	G	D	R	L	R	E	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							T		S	T	T	T	T	T																T	T																						T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		291	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.
		467	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.		.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																												.													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																												.													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	R	F	F	Q	F	V	P	G	E	H	W	H	S	F	E	G	Y	A	E	N	Q	Y	F	V	D	P	C	K	L	L	L	T	T	P	G	I	D	A	R	N	G	E	Y	E	A	F	G	V	P	A	T	I	L	A	N	F	L	.	R	E	N	G	V	V	P	E	K	C	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																												.													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	I	P	I	Q	Y	P	T	G	G	H	A	V	F	V	D	C	K	K	L	V	P	Q	I	P	G	D	Q	F	P	A	Q	A	V	I	N	A	L	Y	L	E	S	G	V	R	A	V	E	I	G	S	F	L	L	G	R	D	P	A	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T			B		S	S			S	S						S	T	T	T		T	T	S		G	G	G																						S						B		T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																						343	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
										537	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.		.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.												.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.												.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	N	S	I	L	F	L	L	T	P	A	E	.	D	M	A	K	L	Q	Q	L	V	A	L	L	V	R	F	E	K	L	L	E	S	D	A	P	L	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.												.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.												.
Template Conservation
Template Sequence		G	E	Q	K	H	A	D	M	E	F	M	R	L	T	I	A	R	R	V	Y	T	N	D	H	M	D	Y	I	A	D	A	L	I	G	L	K	E	K	F	A	T	L	K	G	L	E
Template Known Secondary structure			S	B				S										T	T	S	S														T	T					T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		403	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.