Job Description P24169 Confidence 99.87% Date Thu Jan 5 11:40:44 GMT 2012 Rank 55 Aligned Residues 333 % Identity 16% Template c3pj0D_ PDB info PDB header:lyase Chain: D: PDB Molecule:lmo0305 protein; PDBTitle: crystal structure of a putative l-allo-threonine aldolase (lmo0305)2 from listeria monocytogenes egd-e at 1.80 a resolution Resolution 1.80 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		124	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	A	F	D	C	P	G	H	Q	G	G	E	F	F	R	R	H	P	A	G	N	Q	F	V	E	Y	F	G	E	A	L	F	R	A	D	L	C	N	A	D	V	A	M	G	D	L	L	I	H	E	G	A	P	C	I	A	Q	Q	H	A	A	K	V	F	N	A	D	K	T	Y	F	V	L	N	G	T	S	S	S	N
Query Conservation
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.																																					.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.																																					.
Template Sequence		T	P	Y	K	L	G	G	N	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	R	N	V	G	V	L	T	E	A	L	Q	N	I	D	.	.	.	.	D	N	L	E	S	D	I	Y	G	N	G	A	V	I	E	D	F	E	T	K	I	A	K	I	L	G	K	Q	S	A	V	F	F	P	S	G	.	T	X	A	Q
Template Known Secondary structure			S			S	S	B	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S								T	T	T	S		.	.	.	.	T	T					B	T	T	B	S															T		S						S			.
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.																																					.
Template SS confidence
		12	.	.	.	.	.	.	.	20												.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.					.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.		.	.	.	.
		204	.	.	.	.	.	210	.			.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230			.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.																				.	.
Query SS confidence										.	.																				.	.
Query Sequence		K	V	V	L	N	A	L	L	.	.	T	P	G	D	L	V	L	F	D	R	N	N	H	K	S	N	H	H	G	.	.	A	L	L	Q	A	G	A	T	P	V	Y	L	E	T	A	R	N	P	Y	G	F	I	G	G	I	D	A	H	C	F	E	E	S	Y	L	R	E	L	I	A	E	V	A	P	Q	R	A	K	E
Query Conservation										.	.																				.	.
Alig confidence										.	.																				.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	I	A	L	R	I	W	A	D	R	K	E	N	R	R	V	A	Y	H	P	L	S	H	L	E	I	H	E	Q	D	G	L	K	E	L	Q	Q	I	T	P	L	L	L	G	T	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	Q	L	L	T	I	D	D	I	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	L	R	E
Template Known Secondary structure													T								T	T						S	S	T	T														S		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S									.	.	.	.	.	.	.	.	.	T		S	S
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		76	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.												.	.	.	.	.	.	.	.	130	.										.	.	.	.
		280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.				.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.
Query Sequence		A	R	P	F	R	L	A	V	I	Q	L	G	T	Y	D	G	T	I	.	.	.	Y	N	A	R	Q	V	V	D	K	I	G	H	L	C	D	Y	I	L	F	D	S	A	W	V	G	Y	E	Q	F	I	P	M	M	A	D	C	S	P	L	L	L	D	L	N	E	N	D	P	G	I	L	V	T	Q	S	V	H	K	Q
Query Conservation																				.	.	.
Alig confidence																				.	.	.																															.	.	.														.	.	.	.									.
Template Conservation																																																					.	.	.														.	.	.	.									.
Template Sequence		P	V	S	S	V	L	I	E	L	P	Q	R	E	I	G	G	Q	L	P	A	F	E	E	L	E	K	I	S	E	Y	C	H	E	Q	G	I	S	L	H	L	D	G	A	R	L	W	E	I	T	P	F	.	.	.	Y	Q	K	S	A	E	E	I	C	A	L	F	D	.	.	.	.	S	V	Y	V	S	F	Y	G	.
Template Known Secondary structure				S						S	S	B	G	G	G	T	S	B																		T								T	T		G	G	G				.	.	.		T								T	T		S	.	.	.	.									.
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.														.	.	.	.									.
Template SS confidence
		136	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.				.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.					200	.	.	.	.	.	.	.
		357	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	A	G	F	S	Q	T	S	Q	I	H	K	K	D	S	H	I	K	G	Q	Q	R	Y	V	P	H	K	R	M	N	N	A	F	M	M	H	A	S	T	S	P	F	Y	P	L	F	A	A	L	N	I	N	A	K	M	H	E	G	V	S	G	R	N	M	W	M	D	C	V	V	N	G	I	N	A	R	K	L	I	L
Query Conservation
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.
Template Sequence		I	G	G	I	A	G	A	I	L	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	D	D	F	V	Q	E	A	K	I	W	K	R	R	Y	G	G	D	L	I	S	L	Y	P	Y	I	L	S	A	D	Y	Y	F	E	K	.	R	I	G	K	X	A	E	Y	F	E	A	A	K	G	L	A	E	R	F	N
Template Known Secondary structure					S	S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															T	T				S																.		G	G	G
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.
Template SS confidence
		209	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.														220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.		.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.
		437	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	N	C	Q	H	I	R	P	F	V	P	E	L	V	D	G	K	P	W	Q	S	Y	E	T	A	Q	I	A	V	D	L	R	F	F	Q	F	V	P	G	E	H	W	H	S	F	E	G	Y	A	E	N	Q	Y	F	V	D	P	C	K	L	L	L	T	T	P	G	I	D	A	R	N	G	E	Y	E	A	F	G	V	P
Query Conservation
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	C	S	G	V	K	T	V	P	E	V	P	V	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	X	F	H	V	Y	F	E	N	S	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	E	I
Template Known Secondary structure		T	S	T	T					S	S	S		S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S							S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		275	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.												300	.	.
		517	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530					.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.			.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.																			.	.
Query SS confidence																.	.	.	.																			.	.
Query Sequence		A	T	I	L	A	N	F	L	R	E	N	G	V	V	.	.	.	.	P	E	K	C	D	L	N	S	I	L	F	L	L	T	P	A	E	D	.	.	M	A	K	L	Q	Q	L	V	A	L	L	V	R	F	E	K	L	L
Query Conservation																.	.	.	.																			.	.
Alig confidence																.	.	.	.																			.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	A	I	L	T	K	I	Q	D	E	T	G	V	G	I	S	G	Y	L	Q	E	K	S	A	D	V	C	A	F	E	V	S	V	G	D	A	F	A	E	I	P	A	K	N	L	E	L	V	F	R	C	L	E	K	E	L
Template Known Secondary structure																		S							T	T								B		G	G	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		303	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.