Job Description P24169 Confidence 99.93% Date Thu Jan 5 11:40:44 GMT 2012 Rank 23 Aligned Residues 347 % Identity 14% Template c3mafB_ PDB info PDB header:lyase Chain: B: PDB Molecule:sphingosine-1-phosphate lyase; PDBTitle: crystal structure of stspl (asymmetric form) Resolution 2.97 Å

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		110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	F	F	R	A	L	V	D	Y	V	N	Q	G	N	S	A	F	D	C	P	G	H	Q	G	G	E	F	F	R	R	H	P	A	G	N	Q	F	V	E	Y	F	G	E	A	L	F	R	A	D	L	C	N	A	D	V	A	M	G	D	L	L	I	H	E	G	A	P	C	I	A	Q	Q	H	A	A	K	V	F	N	A
Query Conservation
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	R	A	E	I	L	A	E	I	A	A	M	G	A	G	A	V	Y	D	E	H	H	.	.	.	.	.	.	.	I	A	F	L	N	E	V	Y	A	L	Q	S	Q	S	N	P	L	H	P	D	L	W	P	S	T	A	K	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	A	E	V	V	A	M	T	A	H	M	L	G	G
Template Known Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.												T	T			T	T		T	T	T								.	.	.	.	.	.	.	.	.												T	T	T
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		76	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.								.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.										.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		190	.	.	.						.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.									.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	K	T	Y	.	.	.	.	.	F	V	L	N	G	T	S	S	S	N	K	V	V	L	N	A	L	L	.	.	.	.	.	.	.	.	T	P	G	D	L	V	L	F	D	R	N	N	H	K	S	N	H	H	G	A	L	L	Q	A	G	A	T	P	V	Y	L	E	T	A	R	N	P	Y	G	F	I	G	G	I	D
Query Conservation						.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.																			.																			.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																							.																			.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	A	A	G	G	T	V	C	G	T	V	T	S	G	G	T	E	S	L	L	L	A	M	K	T	Y	R	D	W	A	R	A	T	K	G	I	T	A	P	E	A	V	V	P	V	S	A	H	A	A	F	D	K	.	A	A	Q	Y	F	G	I	K	L	V	R	T	P	L	D	A	D	Y	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T	T	T	S								S	S																							S	S							T	T	S		T					.						T								B		T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																							.																			.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		154	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.		.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.
		257	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.		.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																								.
Query SS confidence																																								.
Query Sequence		A	H	C	F	E	E	S	Y	L	R	E	L	I	A	E	V	A	P	Q	R	A	K	E	A	R	P	F	R	L	A	V	I	Q	L	G	T	Y	D	.	G	T	I	Y	N	A	R	Q	V	V	D	K	I	G	H	L	C	D	Y	I	L	F	D	S	A	W	V	G	Y	E	Q	F	I	P	M	M	A	D	C	S	P
Query Conservation																																								.
Alig confidence		.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.
Template Conservation		.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	R	A	D	V	A	A	M	R	E	A	I	T	P	N	T	V	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	A	G	S	A	P	G	Y	P	H	G	V	V	D	P	I	P	E	I	A	A	L	A	A	E	H	G	I	G	C	H	V	D	A	C	L	G	G	F	I	L	P	W	A	E	R	L	G	Y	P	V
Template Known Secondary structure		.	.	S	B											T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T		T	T	T																	T								T	T	T	T	T	T						T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
				225	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.											.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.
		336	.	.	.	340				.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.																																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.																																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	L	L	D	L	.	.	.	N	E	N	D	P	G	I	L	V	T	Q	S	V	H	K	Q	Q	A	G	F	S	Q	T	S	Q	I	H	K	K	D	S	H	I	K	G	Q	Q	R	Y	V	P	H	K	R	M	N	N	A	F	M	M	H	A	S	T	S	P	F	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation							.	.	.																																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.				.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	P	F	D	F	R	L	E	G	V	T	.	.	.	.	S	V	S	A	D	T	H	K	Y	G	Y	G	A	K	G	T	S	V	I	L	Y	R	R	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	L	L	H	Y	Q	Y	F	I	A	A	D	W	P	G	G	L	Y	F	S	P	T	F	A	G	S
Template Known Secondary structure					S	T	T	S	T	T			.	.	.	.						T	T	T	T	T				S	S							S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											S	S		T	T						S	S	S		S	S
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		293	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.					.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.																.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.
					400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.
Query SS confidence		.	.	.
Query Sequence		.	.	.	P	L	F	A	A	L	N	I	N	A	K	M	H	E	G	V	S	G	R	N	M	W	M	D	C	V	V	N	G	I	N	A	R	K	L	I	L	D	N	C	Q	H	I	R	P	F	V	P	E	L	V	D	G	K	P	W	Q	S	Y	E	T	A	Q	I	A	V	D	L	R	F	F	Q	F	V	P	G	E
Query Conservation		.	.	.
Alig confidence		.	.	.																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	P	G	A	L	S	A	T	A	W	A	A	M	L	S	L	G	E	E	G	Y	L	D	A	T	R	R	I	L	Q	A	A	D	R	L	K	A	G	V	R	A	I	P	S	L	K	I	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																																										T	S	T	T				S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		354	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
		477	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.		.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.		.	.	550	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																													.													.
Query SS confidence																																																													.													.
Query Sequence		H	W	H	S	F	E	G	Y	A	E	N	Q	Y	F	V	D	P	C	K	L	L	L	T	T	P	G	I	D	A	R	N	G	E	Y	E	A	F	G	V	P	A	T	I	L	A	N	F	L	R	E	N	G	V	V	P	E	K	C	D	.	L	N	S	I	L	F	L	L	T	P	A	E	.	D	M	A	K	L	Q	Q
Query Conservation																																																													.													.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.													.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	P	L	W	V	I	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	A	S	D	E	L	N	I	Y	Q	V	M	E	E	M	A	G	R	G	W	R	L	N	G	L	H	R	P	P	A	F	H	V	A	L	T	L	R	H	T	E	P	G	V	V	D	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	S	S												T	T							T	T	T	T								G	G	G	S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																	403	.	.	.	.	.	.												410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.
		555	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	V	A	L	L	V	R	F	E	K	L	L	E	S	D
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		F	L	A	D	L	Q	D	A	V	A	Q	V	R	A	H
Template Known Secondary structure															T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		457	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.