Job Description P24169 Confidence 99.84% Date Thu Jan 5 11:40:44 GMT 2012 Rank 66 Aligned Residues 327 % Identity 13% Template c3lwsF_ PDB info PDB header:lyase Chain: F: PDB Molecule:aromatic amino acid beta-eliminating PDBTitle: crystal structure of putative aromatic amino acid beta-2 eliminating lyase/threonine aldolase. (yp_001813866.1) from3 exiguobacterium sp. 255-15 at 2.00 a resolution Resolution 2.00 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		125	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	F	D	C	P	G	H	Q	G	G	E	F	F	R	R	H	P	A	G	N	Q	F	V	E	Y	F	G	E	A	L	F	R	A	D	L	C	N	A	D	V	A	M	G	D	L	L	I	H	E	G	A	P	C	I	A	Q	Q	H	A	A	K	V	F	N	A	D	K	T	Y	F	V	L	N	G	T	S	S	S	N	K
Query Conservation
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.
Template Sequence		T	G	Q	I	S	G	H	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	R	N	V	G	V	L	K	T	A	F	A	A	V	A	.	.	.	.	D	E	X	A	S	D	Q	Y	G	T	G	A	I	I	E	P	F	E	Q	K	F	A	D	V	L	G	X	D	D	A	V	F	F	P	S	G	T	X	A	Q	Q	V
Template Known Secondary structure		S			S	S	B	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												T	T	S		.	.	.	.	T	T						T	T			T	T												T	T		S						S
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.
Template SS confidence
		12	.	.	.	.	.	.	.												20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.					.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.
		205	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.		.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230			.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.
Predicted Secondary structure													.																.	.
Query SS confidence													.																.	.
Query Sequence		V	V	L	N	A	L	L	T	P	G	D	.	L	V	L	F	D	R	N	N	H	K	S	N	H	H	G	.	.	A	L	L	Q	A	G	A	T	P	V	Y	L	E	T	A	R	N	P	Y	G	F	I	G	G	I	D	A	H	C	F	E	E	S	Y	L	R	E	L	I	A	E	V	A	P	Q	R	A	K	E	A	R
Query Conservation													.																.	.
Alig confidence													.																.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	L	R	I	W	S	D	E	T	D	N	R	T	V	A	Y	H	P	L	C	H	L	E	I	H	E	Q	D	G	L	K	E	L	H	P	I	E	T	I	L	V	G	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	R	L	X	T	L	D	E	I	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	P	D	I
Template Known Secondary structure											T								T	T						S	S	T	T						S	S							S		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S
Template Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120												.	.	.	.	.	.	.	.	.	130											.	.	.	.	.
		282	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.				.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.
Query Sequence		P	F	R	L	A	V	I	Q	L	G	T	Y	D	G	T	I	.	.	.	Y	N	A	R	Q	V	V	D	K	I	G	H	L	C	D	Y	I	L	F	D	S	A	W	V	G	Y	E	Q	F	I	P	M	M	A	D	C	S	P	L	L	L	D	L	N	E	N	D	P	G	I	L	V	T	Q	S	V	H	K	Q	Q	A
Query Conservation																		.	.	.
Alig confidence																		.	.	.																																.	.	.													.	.	.	.
Template Conservation																																																				.	.	.													.	.	.	.
Template Sequence		A	C	L	L	L	E	L	P	Q	R	E	I	G	G	V	A	P	A	F	S	E	L	E	T	I	S	R	Y	C	R	E	R	G	I	R	L	H	L	D	G	A	R	L	F	E	X	L	P	Y	Y	.	.	.	E	K	T	A	A	E	I	A	G	L	F	D	.	.	.	.	S	I	Y	I	S	F	Y	G	L	G	G
Template Known Secondary structure		S						S	S	B	G	G	G	T	S	B																		T								T	T									.	.	.	T								T	T		S	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.	.													.	.	.	.
Template SS confidence
		136	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.				.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.					.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.
		359	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	F	S	Q	T	S	Q	I	H	K	K	D	S	H	I	K	G	Q	Q	R	Y	V	P	H	K	R	M	N	N	A	F	M	M	H	A	S	T	S	P	F	Y	P	L	F	A	A	L	N	I	N	A	K	M	H	E	G	V	S	G	R	N	M	W	M	D	C	V	V	N	G	I	N	A	R	K	L	I	L	D	N
Query Conservation
Alig confidence			.	.											.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.											.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.
Template Sequence		I	.	.	A	G	A	I	L	A	G	P	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	F	C	Q	T	A	R	I	W	K	R	R	Y	G	G	D	L	I	S	L	Y	P	Y	I	V	S	A	D	Y	Y	Y	E	L	R	K	D	R	.	.	.	.	.	X	G	Q	Y	Y	E	Q	A	K	Q	L	A	E	Q	F	N	A	L
Template Known Secondary structure		S	.	.	S										.	.	.	.	.	.	.	.													T				S																	T	T		.	.	.	.	.																		S
Template Predicted Secondary structure			.	.											.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.
Template SS confidence
		210			.	.	.	.	.	.	.	.	.	220									.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.						.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.
		439	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		C	Q	H	I	R	P	F	V	P	E	L	V	D	G	K	P	W	Q	S	Y	E	T	A	Q	I	A	V	D	L	R	F	F	Q	F	V	P	G	E	H	W	H	S	F	E	G	Y	A	E	N	Q	Y	F	V	D	P	C	K	L	L	L	T	T	P	G	I	D	A	R	N	G	E	Y	E	A	F	G	V	P	A	T
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	G	V	H	T	T	P	E	V	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	S	N	X	F	H	L	H	F	D	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	A	A	D	I	S	P
Template Known Secondary structure		T	T					S	S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S								S	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		275	.	.	.	.	280	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.										.	.	.	.	300	.	.
		519	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.				.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.						.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.
Predicted Secondary structure															.	.	.																.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.																.	.	.	.	.
Query Sequence		I	L	A	N	F	L	R	E	N	G	V	V	P	.	.	.	E	K	C	D	L	N	S	I	L	F	L	L	T	P	A	.	.	.	.	.	E	D	M	A	K	L	Q	Q	L	V	A	L	L	V	R
Query Conservation															.	.	.																.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.																.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	L	E	Q	V	Q	E	E	T	G	L	G	F	V	G	Y	L	V	D	K	D	G	Y	C	S	T	E	I	S	V	G	D	A	Y	G	E	L	D	Q	Q	T	R	D	A	G	F	A	R	L	R	Q
Template Known Secondary structure														S		S						S	S								B						T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		303	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.