Job Description P24169 Confidence 99.92% Date Thu Jan 5 11:40:44 GMT 2012 Rank 26 Aligned Residues 361 % Identity 16% Template c3f9tB_ PDB info PDB header:lyase Chain: B: PDB Molecule:l-tyrosine decarboxylase mfna; PDBTitle: crystal structure of l-tyrosine decarboxylase mfna (ec 4.1.1.25)2 (np_247014.1) from methanococcus jannaschii at 2.11 a resolution Resolution 2.11 Å

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		111	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	F	R	A	L	V	D	Y	V	N	Q	G	N	S	A	F	D	C	P	G	H	Q	G	G	E	F	F	R	R	H	P	A	G	N	Q	F	V	E	Y	F	G	E	A	L	F	R	A	D	L	C	N	A	D	V	A	M	G	D	L	L	I	H	E	G	A	P	C	I	A	Q	Q	H	A	A	K	V	F	N	A	D
Query Conservation
Alig confidence																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	L	E	E	L	K	K	Y	R	S	L	D	L	K	Y	E	D	G	N	I	F	G	S	X	C	S	N	V	L	P	I	T	R	K	I	V	D	I	F	L	E	T	N	L	G	D	P	G	L	F	K	G	T	K	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	E	E	K	A	V	A	L	L	G	S	L	L	N	N	K
Template Known Secondary structure											T	T	S			G	G	G	S		B		S		S						T										T	T			T	T	S	G	G	G							.	.	.	.	.	.	.	.	.													T	T		T
Template Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		14	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.										.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
		191	.	.		.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.														.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	T	Y	.	F	V	L	N	G	T	S	S	S	N	K	V	V	L	N	A	L	L	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	G	D	L	V	L	F	D	R	N	N	H	K	S	N	H	H	G	A	L	L	Q	A	G	A	T	P	V	Y	L	E	T	A	R	N	P	Y	G	F	I	G	G	I	D
Query Conservation					.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.																		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																								.																		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	A	Y	G	H	I	V	S	G	G	T	E	A	N	L	X	A	L	R	C	I	K	N	I	W	R	E	K	R	R	K	G	L	S	K	N	E	H	P	K	I	I	V	P	I	T	A	H	F	S	F	E	K	G	.	R	E	X	X	D	L	E	Y	I	Y	A	P	I	K	E	D	Y	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T							S																							T	T					S	S							T	T			T						.					T								B		T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																								.																		.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.		.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.
		257	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.
Predicted Secondary structure																																																																														.	.	.	.
Query SS confidence																																																																														.	.	.	.
Query Sequence		A	H	C	F	E	E	S	Y	L	R	E	L	I	A	E	V	A	P	Q	R	A	K	E	A	R	P	F	R	L	A	V	I	Q	L	G	T	Y	D	G	T	I	Y	N	A	R	Q	V	V	D	K	I	G	H	L	C	D	Y	I	L	F	D	S	A	W	V	G	Y	E	Q	F	I	P	M	M	A	D	.	.	.	.
Query Conservation																																																																														.	.	.	.
Alig confidence		.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.
Template Conservation		.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	T	I	D	E	K	F	V	K	D	A	V	E	D	Y	D	V	D	G	I	.	.	.	.	.	.	.	.	I	G	I	A	G	T	T	E	L	G	T	I	D	N	I	E	E	L	S	K	I	A	K	E	N	N	I	Y	I	H	V	D	A	A	F	G	G	L	V	I	P	F	L	D	D	K	Y	K	K	K	G
Template Known Secondary structure		.	.	S	B												S						.	.	.	.	.	.	.	.				B	S		T	T	T			B														T								T	T	G	G	G	T	G	G	G			G	G	G			T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
				156	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.									.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.
			333	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.
Predicted Secondary structure		.
Query SS confidence		.
Query Sequence		.	C	S	P	L	L	L	D	L	N	E	N	D	P	G	I	L	V	T	Q	S	V	H	K	Q	Q	A	G	F	S	Q	T	S	Q	I	H	K	K	D	S	H	I	K	G	Q	Q	R	Y	V	P	H	K	R	M	N	N	A	F	M	M	H	A	S	T	S	P	F	Y	P	L	F	A	A	L	N	I	N	A	K	M
Query Conservation		.
Alig confidence		.												.	.	.	.																																.
Template Conservation														.	.	.	.																																.
Template Sequence		V	N	Y	K	F	D	F	S	L	G	V	D	.	.	.	.	S	I	T	I	D	P	H	K	X	G	H	C	P	I	P	S	G	G	I	L	F	K	D	I	G	Y	K	R	Y	L	D	.	V	D	A	P	Y	L	T	E	T	R	Q	A	T	I	L	G	T	R	V	G	F	G	G	A	C	T	Y	A	V	L	R	Y
Template Known Secondary structure							S	G	G	G	T		S	.	.	.	.						T	T	T	T	T				S	S							S	S	G	G	G	G	G	G	T		.				T	T	S	S	S	S				S	S		S	S			S
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.																																.
Template SS confidence
		226	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.					.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.		.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
		412	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	E	G	V	S	G	R	N	M	W	M	D	C	V	V	N	G	I	N	A	R	K	L	I	L	D	N	C	Q	H	I	R	P	F	V	P	E	L	V	D	G	K	P	W	Q	S	Y	E	T	A	Q	I	A	V	D	L	R	F	F	Q	F	V	P	G	E	H	W	H	S	F	E	G	Y	A	E	N	Q	Y	F	V
Query Conservation
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	G	R	E	G	Q	R	K	I	V	N	E	C	X	E	N	T	L	Y	L	Y	K	K	L	K	E	N	N	F	K	P	V	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																												T	T			B	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		301	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.
		492	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.
Query SS confidence																																																			.
Query Sequence		D	P	C	K	L	L	L	T	T	P	G	I	D	A	R	N	G	E	Y	E	A	F	G	V	P	A	T	I	L	A	N	F	L	R	E	N	G	V	V	P	E	K	C	D	L	N	S	I	L	.	F	L	L	T	P	A	E	D	M	A	K	L	Q	Q	L	V	A	L	L	V	R	F	E
Query Conservation																																																			.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	P	I	L	N	I	V	A	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	D	E	D	Y	K	E	V	C	K	K	L	R	D	R	G	I	Y	V	S	V	C	N	C	V	K	A	L	R	I	V	V	X	P	H	I	K	R	E	H	I	D	N	F	I	E	I	L	N	S	I	K
Template Known Secondary structure				S	S	S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T											T	T		B					S	S	S	S								T	T
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		334	.	.	.	.	.	340	.	.													.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.