Job Description P24169 Confidence 99.46% Date Thu Jan 5 11:40:44 GMT 2012 Rank 205 Aligned Residues 317 % Identity 15% Template c3a8uX_ PDB info PDB header:transferase Chain: X: PDB Molecule:omega-amino acid--pyruvate aminotransferase; PDBTitle: crystal structure of omega-amino acid:pyruvate aminotransferase Resolution 1.40 Å

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		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.			.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.									210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.																												.
Query SS confidence																						.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.																												.
Query Sequence		D	L	L	I	H	E	G	A	P	C	I	A	Q	Q	H	A	A	K	V	F	.	.	N	A	D	K	T	Y	F	V	L	N	G	T	S	S	S	N	K	V	V	L	N	A	.	.	.	.	.	.	.	.	L	L	T	P	G	D	L	V	L	F	D	R	N	N	H	K	S	N	H	H	G	A	L	L	Q	A	G	.
Query Conservation																						.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.																												.
Alig confidence																						.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.																					.							.
Template Conservation																																																																										.
Template Sequence		G	F	Q	Y	G	H	P	L	S	F	Q	L	A	E	K	I	T	D	L	T	P	G	N	L	N	H	V	F	F	T	D	S	G	S	E	C	A	L	T	A	V	K	M	V	R	A	Y	W	R	L	K	G	Q	A	T	K	T	K	M	I	G	R	A	R	G	Y	H	G	V	N	I	A	.	G	T	S	L	G	G	V
Template Known Secondary structure		S	S	S															T	T	S	S	T	T								S	S																			T	T		T	T								T	T					S	S			.
Template Predicted Secondary structure																																																																										.
Template SS confidence
		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.		.	160	.	.	.	.	.
												237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.						.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.			.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.																							.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.																							.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	T	P	V	Y	L	E	T	A	R	N	P	Y	G	F	I	G	G	I	D	A	H	C	F	E	E	S	Y	L	R	E	L	I	A	E	.	.	.	.	.	V	A	P	Q	R	A	K	E	A	R	P	F	R	L	A	V	I	Q	L	G	T	Y	.	.	D	G	T	I	Y	N
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.																							.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.									.	.
Template Conservation																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	G	N	R	K	L	F	G	Q	P	M	Q	D	V	D	H	L	P	H	T	L	L	A	S	N	A	Y	S	R	G	M	P	K	E	G	G	I	A	L	A	D	E	L	L	K	L	I	E	L	H	D	A	S	N	I	A	.	.	.	.	.	.	.	.	A	V	F	V	E	P	L	A	G	S	A	G	V	L	V	P
Template Known Secondary structure						T	T	T				S		S										G	G	G	T	T		S	S	S		S	S	S																	G	G	G			.	.	.	.	.	.	.	.						S	S	B	T	T	T	T		B
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.									.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
						300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	A	R	Q	V	V	D	K	I	G	H	L	C	D	Y	I	L	F	D	S	A	W	V	G	Y	E	Q	F	I	P	M	M	A	D	C	S	P	L	L	L	D	L	N	E	N	D	P	G	I	L	V	T	Q	S	V	H	K	Q	Q	A	G	F	S	Q	T	S	Q	I	H	K	K	D	S	H	I	K	G
Query Conservation		.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																													.	.	.														.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																		.	.	.														.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	E	G	Y	L	K	R	N	R	E	I	C	N	Q	H	N	I	L	L	V	F	D	E	V	I	T	G	F	G	R	T	G	.	.	.	S	M	F	G	A	D	S	F	G	V	T	P	D	.	.	.	.	L	M	C	I	A	K	Q	V	T	N	G	A	I	P	M	G	A	V	I	A	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			T	T													T								T	T	T	T	T	T	T	T	S	.	.	.	S	S	S						T				S	.	.	.	.						G	G	G	G	T	T	S	S								.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.														.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		238	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.				270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.					.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.
		376	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.													390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	Q	R	Y	V	P	H	K	R	M	N	N	A	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	M	H	A	S	T	S	P	F	Y	P	L	F	A	A	L	N	I	N	A	K	M	H	E	G	V	S	G	R	N	M	W	M	D	C	V	V	N	G	I	N	A	R	K	L	I	L	D	N	C	Q	H	I	R
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.																																													.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	S	T	E	I	Y	Q	T	F	M	N	Q	P	T	P	E	Y	A	V	E	F	P	H	G	Y	T	Y	S	A	H	P	V	A	C	A	A	G	L	A	A	L	C	L	L	Q	.	.	.	K	E	N	L	V	Q	S	V	A	E	V	A	P	H	F	E	K	A	L	H	G	I	K	G	A	K	N
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.										T		S	S		T	T	S		S	S					T	T	T	T																	.	.	.		T	T																		T	T	T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																																													.	.	.
Template SS confidence
								303	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.				.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.
		444	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	F	V	P	E	L	V	D	G	K	P	W	Q	S	Y	E	T	A	Q	I	A	V	D	L	R	F	F	Q	F	V	P	G	E	H	W	H	S	F	E	G	Y	A	E	N	Q	Y	F	V	D	P	C	K	L	L	L	T	T	P	G	I	D	A	R	N	G	E	Y	E	A	F	G	V	P	A	T	I	L	A	N	F
Query Conservation
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	I	D	I	R	N	F	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	G	A	I	Q	I	A	P	R	D	.	.	.	.	.	.	G	D	A	I	V	R	P	F	E	A	G	M	A
Template Known Secondary structure									T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T									B	T	.	.	.	.	.	.	T	B	S	S
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		374	.	.	.	.	.	380	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.							.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.
		524	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	R	E	N	G	V	V	P	E	K	C	D	L	N	S	I	L	F	L	L	T	P	A	E	D	M	A	K	L	Q	Q	L	V	A	L	L	V	R	F	E	K	L	L
Query Conservation
Alig confidence										.
Template Conservation										.
Template Sequence		L	W	K	A	G	F	Y	V	.	R	F	G	G	D	T	L	Q	F	G	P	T	F	N	S	K	P	Q	D	L	D	R	L	F	D	A	V	G	E	V	L	N	K	L
Template Known Secondary structure						T				.				T	T								T	T
Template Predicted Secondary structure										.
Template SS confidence
		406	.	.	.	410	.	.	.		.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.