Job Description P77277 Confidence 99.39% Date Thu Jan 5 12:27:07 GMT 2012 Rank 43 Aligned Residues 234 % Identity 20% Template c3i8bA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:xylulose kinase; PDBTitle: the crystal structure of xylulose kinase from2 bifidobacterium adolescentis Resolution 2.00 Å

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		28	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Query SS confidence																																																																															.	.	.
Query Sequence		S	P	L	W	L	G	V	D	L	G	T	C	D	V	V	S	M	V	V	D	R	D	G	Q	P	V	A	V	C	L	D	W	A	D	V	V	R	D	G	I	V	W	D	F	F	G	A	V	T	I	V	R	R	H	L	D	T	L	E	Q	Q	F	G	R	R	F	S	H	A	A	T	S	F	P	P	G	T	.	.	.
Query Conservation																																																																															.	.	.
Alig confidence																																				.	.																							.	.	.	.																.	.	.
Template Conservation																																				.	.																							.	.	.	.
Template Sequence		R	T	L	V	A	G	V	D	T	S	T	Q	S	C	K	V	R	V	T	D	A	E	T	G	E	L	V	R	F	G	Q	A	K	H	.	.	P	N	G	T	S	V	D	P	S	Y	W	W	S	A	F	Q	E	A	A	E	Q	A	.	.	.	.	G	G	L	D	D	V	S	A	L	A	V	G	G	Q	Q	H	G	X
Template Known Secondary structure		S										S	S									T	T	T												.	.		S	S	S				T														T	.	.	.	.	T		S	T	T										S	S		B
Template Predicted Secondary structure																																				.	.																							.	.	.	.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.			.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.					.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	I	L	D	N	Q	G	N	V	I	R	D	A	X	L	W	N	D	T	S	S	A	P	Q	A	A	A	L	I	E	K	L	G	A	A	P	A	Q	D	G	E	P	E	D	P	I	A	R	G	K	Q	R	W	V	K	A	V	G	S	S	P	V	A	S	Y	T	L	T	K	V	A	W	V	A	E	N	E	P	E	N
Template Known Secondary structure						T	T	S		B		S					T	T			T	T														S				T	T			S	S														S	S				T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
																																																									105	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	P	R	I	S	I	N	V	L	E	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	K	K	I	A	A	I	C	L	P	H	D	W	L	S	W	R	I	A	G	Y	G	P	V	A	E	G	E	D	A	H	L	E	A	L	F	T	D	R	S	D	A	S	G	T	I	Y	Y	D	A	A	S	N	E	Y	R	R	D	L	I	A	X	V	L	E	A	A	E	G	A	K	A	A	Q	S	H	A	E	A	I
Template Known Secondary structure			T	T		S														T	T						T	T	S				G	G	G									T	T	S	S	S			T	T	T	T																											S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.
																												116	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	G	L	E	V	S	H	V	L	D	E	P	T	A	V	A	D	L	L	Q	L	D	N	A	G	V	V	D	I	G	G	G	T	T	G	I	A	I	V	K	K	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	L	P	T	V	L	G	P	R	D	A	A	P	V	K	A	D	P	A	I	A	G	K	N	V	E	G	G	C	L	L	A	P	G	G	G	D	N	A	X	A	S	L	G	L	G	X	A	V	G	D	V	S	I	S	L	G	T	S	G	V	A	A	A	I	S	E	N	P	T	Y	D	L	T	G	A	V	S	G	F
Template Known Secondary structure		B							T	T				S	S				T	T	T	T	T	T	T	S	T	T																		T	T			T	T							S	S	S							B	S	S					T	T	S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.
						158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	K	V	T	Y	S	A	D	E	A	T	G	G	H	H	I	S	L	T	L	A	G	N	R	R	I	S	L	E	E	A	E	Q	Y	K	R	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	G	E	E	I	W
Query Conservation		.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	D	C	T	G	H	Y	L	P	L	A	C	T	I	N	G	S	R	I	L	D	A	G	R	A	A	L	G	V	D	Y	D	E	L	A	K	L	A	F	A	S	K	P	G	A	N	G	I	T	L	V	P	Y	F	D	G	E	R	T	P	N	R	P	N	A	T	A	T	F	S	G	X	T	L	A	N	T	T	R	E
Template Known Secondary structure				S	S	S	S								S		S	T											T													S		T	T	G	G	G							T	T		B	T	T	T	T	B	T	T							S			T	T	T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		317	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.
		200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.						220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.
Query Sequence		P	A	V	K	P	V	Y	E	K	M	A	D	I	V	A	R	H	I	E	G	.	.	.	.	.	Q	G	I	T	D	L	W	L	A	G	G	S	C	M	Q	P	G	V	A	E	L	F	R	K	Q	F	P	A	L	Q	V	H	L	P	Q	H	S	L	F	M	T	P	L	A	I	A	S	S	G	R
Query Conservation																						.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.																											.												.
Template Conservation																																																					.												.
Template Sequence		N	L	A	R	A	F	V	E	G	L	L	C	S	Q	R	D	C	L	E	L	I	R	S	L	G	A	S	I	T	R	I	L	L	I	G	G	G	A	K	S	E	A	I	R	T	L	A	P	S	I	L	.	G	X	D	V	T	R	P	A	T	D	E	.	Y	V	A	I	G	A	A	R	Q	A	A
Template Known Secondary structure																									T	T										S	G	G	G	G													.	T	S										.
Template Predicted Secondary structure																																																					.												.
Template SS confidence
		397	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.		.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.		.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.