Job Description P28903 Confidence 99.50% Date Thu Jan 5 11:45:16 GMT 2012 Rank 9 Aligned Residues 430 % Identity 18% Template d1r9da_ SCOP info PFL-like glycyl radical enzymes PFL-like glycyl radical enzymes PFL-like Resolution 1.80

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		195	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.		.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.
Query SS confidence																													.
Query Sequence		I	E	P	P	K	S	I	S	T	A	T	A	V	T	A	Q	I	I	A	Q	V	A	S	H	I	Y	G	.	G	T	T	I	N	R	I	D	E	V	L	A	P	F	V	T	A	S	Y	N	K	H	R	K	T	A	E	E	W	N	I	P	D	A	E	G	Y	A	N	S	R	T	I	K	E	C	Y	D	A	F	Q	S
Query Conservation																													.
Alig confidence																													.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	E	G	A	K	S	F	Y	E	A	C	Q	L	F	W	F	I	H	A	I	I	N	I	E	S	N	G	H	S	I	S	P	A	R	F	D	Q	Y	M	Y	P	Y	Y	E	N	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	N	I	T	D	K	F	A	Q	E	L	I	D	C
Template Known Secondary structure		T	S				S																						S		B			B	S													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		254	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.
		274	.	.	.	.	.	280	.	.										.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.								300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	E	Y	E	V	N	T	L	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	A	N	G	Q	T	P	F	V	T	F	G	F	G	L	G	T	.	.	.	.	.	.	.	S	W	E	S	R	L	I	Q	E	S	I	L	R	N	R	I	A	G	L	G	K	N	R	K	T	A	V	F	P	K	L	V	F	A	I	R	D	G
Query Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.
Template Conservation																																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.
Template Sequence		I	W	I	K	L	N	D	I	N	K	V	R	D	E	I	S	T	K	H	F	G	G	Y	P	M	Y	Q	N	L	I	V	G	G	Q	N	S	E	G	K	D	A	T	N	K	V	S	Y	M	A	L	E	A	A	V	H	V	K	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	Q	P	S	L	S	V	R	.	.
Template Known Secondary structure						T	T	T	B						T	T					S		S	S											B		T	T	S		B																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		S						.	.
Template Predicted Secondary structure																																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.
Template SS confidence
		314	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.													.	.	.	.	.	.	.	.
		338	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.		360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.										.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.			.	.
Predicted Secondary structure																								.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.
Query SS confidence																								.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.
Query Sequence		L	N	H	K	K	G	D	P	N	Y	D	I	K	Q	L	A	L	E	C	A	S	K	.	R	M	Y	P	D	I	L	N	Y	D	Q	V	V	K	V	T	G	S	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	T	P	M	G	C	R	S	F	L	G	V	W	E	N	E	N	G	E	Q	I	H	D	G	R	.	.	N	N
Query Conservation																								.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.
Alig confidence		.	.								.													.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			.	.
Template Conservation		.	.								.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	I	W	N	K	T	P	D	.	E	F	L	L	R	A	A	E	L	T	R	E	G	L	G	L	P	A	Y	Y	N	D	E	V	I	I	P	A	L	V	S	R	G	L	T	L	E	D	A	R	D	Y	G	I	I	G	C	V	E	P	Q	K	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	K	T	E	G	W
Template Known Secondary structure		.	.			T	T				.												T	T	S																		T	T								T					T	T	T					T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.								.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
				380	.	.	.	.	.	.		.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.												440	.	.	.	.	.
		406	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	G	V	I	S	L	N	L	P	R	I	A	L	E	A	K	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	A	T	F	W	K	L	L	D	E	R	L	V	L	A	R	K	A	L	M	T	R	I	A	R	L	E	G	V	K	A	R	V	A	P	I	L	Y	M	E	G	A
Query Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	D	S	A	F	F	N	L	A	R	I	V	E	L	T	I	N	S	G	F	D	K	N	K	Q	I	G	P	K	T	Q	N	F	E	E	M	K	S	F	D	E	F	M	K	A	Y	K	A	Q	M	E	Y	F	V	K	H	M	C	C	A	D	N	C	I	D	I	A	H	A	E	R	A	P	L	P	F	L	S	S	M
Template Known Secondary structure		T	T	S														T	T	T	B		S	S	S	B		S						G	G	G			S																																										T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		446	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.
		466	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.																																										.	.	.
Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		C	G	V	R	L	N	A	D	D	D	V	S	E	I	F	K	N	G	R	A	S	I	S	L	G	Y	I	G	I	H	E	T	I	N	A	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	G	G
Query Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.
Template Sequence		V	D	N	C	I	G	K	G	K	S	L	Q	D	.	G	G	A	E	Y	N	F	S	G	P	Q	G	V	G	V	A	N	I	G	D	S	L	V	A	V	K	K	I	V	F	D	E	N	K	I	T	P	S	E	L	K	K	T	L	N	N	D	F	K	N	S	E	E	I	Q	A	L	L	K	N	A	P	K	F	G	N
Template Known Secondary structure		S	T	T					T			T	T	T	.	T		S	S																									T	T	T	S		S	S											T	T	T	T	T										T	S			T	T	S
Template Predicted Secondary structure															.
Template SS confidence
		526	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.		.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.
		505	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.							.	570	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																		.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	H	V	Y	D	N	E	Q	L	R	A	K	G	I	A	I	V	E	R	L	R	Q	A	V	D	Q	W	K	E	E	T	G	Y	G	F	S	L	Y	S	T	P	S	E	N	L	C	D	R	F	C	R	L	D	T	A	E	F	G	V	V	P	G	V	T	.	.	.	.	.	.	D	K	G	Y	Y	T	N	S	F	H
Query Conservation																																																																		.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	D	I	D	E	V	D	N	L	A	R	E	G	A	L	V	Y	C	R	E	V	N	K	Y	T	N	P	R	G	G	N	F	Q	P	G	L	Y	P	S	S	I	N	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	F	G	S	L	T	G	A	T	P	D	G	R	K	S	G	Q	P	L	A	D	G	V	S	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.																					T	T		B		T	T	S						B	B			T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.					T					T	T	S			T	T						T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
						605	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.										.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.
		579	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.		.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.		.	.	.	.	.	.	.	.	620				.	.	.	.	.	.	.	.	.	630		.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.
Predicted Secondary structure																					.															.										.	.	.											.
Query SS confidence																					.															.										.	.	.											.
Query Sequence		L	D	V	E	K	K	V	N	P	Y	D	K	I	D	F	E	A	P	Y	.	P	P	L	A	N	G	G	F	I	C	Y	G	E	Y	.	P	N	I	Q	H	N	L	K	A	.	.	.	L	E	D	V	W	D	Y	S	Y	Q	.	H	V	P	Y	Y	G	T	N	T	P	I	D	E	C	Y	E	C	G	F	T	G	E
Query Conservation																					.															.										.	.	.											.
Alig confidence																					.															.										.	.	.											.																				.	.	.
Template Conservation																																																																															.	.	.
Template Sequence		S	R	G	C	D	V	S	G	P	T	A	A	C	N	S	V	S	K	L	D	H	F	I	A	S	N	G	T	L	F	N	Q	K	F	H	P	S	A	L	K	G	D	N	G	L	M	N	L	S	S	L	I	R	S	Y	F	D	Q	K	G	F	H	V	Q	F	N	V	I	D	K	K	I	L	L	A	A	Q	.	.	.
Template Known Secondary structure			T	T	T			S										T	T	S		T	T	T		T	T		B								G	G	G	G																			T	T																			.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Template SS confidence
		672	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.
		653	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	E	C	T	S	K	G	F	T	C	P	K	C	G	N	H	D	A	S	R	V	S	V	T	R	R	V	C	G	Y	L	G	S	P	D	A	R	P	F	N	A	G	K	Q	E	E	V	K	R	R	V	K	H
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.															.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.															.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	K	N	P	E	K	Y	Q	D	.	.	.	.	.	.	L	I	V	R	V	A	G	Y	S	A	Q	F	I	S	.	.	L	D	K	S	I	Q	N	D	I	I	A	R	T	E	H
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.			G	G	G	G	T	T	.	.	.	.	.	.						S	S	S				G	G	G	.	.	S											S			B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.															.	.
Template SS confidence
										749	750	.	.	.	.	.	.							.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770			.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.