Job Description P28903 Confidence 99.11% Date Thu Jan 5 11:45:16 GMT 2012 Rank 13 Aligned Residues 392 % Identity 14% Template d1peqa2 SCOP info PFL-like glycyl radical enzymes PFL-like glycyl radical enzymes R1 subunit of ribonucleotide reductase, C-terminal domain Resolution 2.80

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		184	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.				.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260
Predicted Secondary structure																																																					.	.	.
Query SS confidence																																																					.	.	.
Query Sequence		L	T	Q	G	F	K	M	G	N	A	E	I	E	P	P	K	S	I	S	T	A	T	A	V	T	A	Q	I	I	A	Q	V	A	S	H	I	Y	G	G	T	T	I	N	R	I	D	E	V	L	A	P	.	.	.	F	V	T	A	S	Y	N	K	H	R	K	T	A	E	E	W	N	I	P	D	A	E	G	Y	A	N
Query Conservation																																																					.	.	.
Alig confidence																.	.														.	.	.	.	.										.	.							.	.	.
Template Conservation																.	.														.	.	.	.	.										.	.
Template Sequence		L	V	S	C	F	L	L	R	I	E	D	N	M	E	.	.	S	I	G	R	A	V	N	S	A	L	Q	L	S	.	.	.	.	.	K	R	G	G	G	V	A	F	L	.	.	L	S	N	L	R	E	A	G	A	P	I	K	R	I	E	N	Q	S	S	G	V	I	P	V	M	K	M	L	E	D	A	F	S	Y	A
Template Known Secondary structure												S	S			.	.														.	.	.	.	.	T	T	T							.	.		T	T	S			T	T			B	T	T	B	S	S					S
Template Predicted Secondary structure																.	.														.	.	.	.	.										.	.
Template SS confidence
		175	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.			.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.						.	.	.	.	.	.	.	.	210			.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.
		261	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	R	T	I	K	E	C	Y	D	A	F	Q	S	L	E	Y	E	V	N	T	L	H	T	A	N	G	Q	T	P	F	V	T	F	G	F	G	L	G	T	S	W	E	S	R	L	I	Q	E	S	I	L	R	N	R	I	A	G	L	G	K	N	R	K	T	A	V	F	P	K	L	V	F	A	I	R	D	G	L	N	H
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.																									.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.																									.	.	.
Template Sequence		N	Q	.	.	.	.	.	.	.	G	A	G	A	V	Y	L	H	A	H	H	P	D	I	L	R	F	L	D	T	K	.	.	.	.	.	R	I	K	T	L	S	L	G	V	V	I	P	D	I	T	F	R	L	A	K	E	N	A	Q	.	.	.	M	A	L	F	S	P	Y	D	I	Q	R	R	Y	G	K	P	F	G
Template Known Secondary structure		.		.	.	.	.	.	.	.									T	T	S	T	T						G	G	G	.	.	.	.	.				S									S								T	T			.	.	.														S	S		G	G
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.																									.	.	.
Template SS confidence
		246	.								.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.						.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.				.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310
		341																			.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.									.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	G	D	P	N	Y	D	I	K	Q	L	A	L	E	C	A	S	K	R	M	Y	P	D	I	L	N	Y	D	Q	V	V	K	V	T	G	S	F	K	T	P	M	G	C	R	S	F	L	G	V	W	E	.	.	.	.	.	.	.	.	N	E
Query Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	I	A	I	S	E	R	Y	D	E	L	I	A	D	P	H	V	R	K	T	Y	I	N	A	R	D	F	F	Q	T	L	A	E	I	Q	F	E	S	G	Y	P	Y	I	M	F	E	D	T	V	N	R	A	N	P	I	A	G	R	I	N	M	S	N	L	C	S	E	I	L	Q	V	N	S	A	S	R	Y	D	D	N
Template Known Secondary structure		G	S													T	T	S																						S																S	S	S							T	T	S													T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.
		395	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	G	E	Q	I	H	D	G	R	N	N	L	G	V	I	S	L	N	L	P	R	I	A	L	E	A	K	G	D	E	A	T	F	W	K	L	L	D	E	R	L	V	L	A	R	K	A	L	M	T	R	I	A	R	L	E	G	V	K	A	R	V	A	P	I	L	Y	M	E	G	A	C	G	V	R	L	N	A	D	D
Query Conservation
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	D	Y	T	H	I	G	H	D	I	S	C	N	L	G	S	L	N	I	A	H	V	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	S	P	D	I	G	R	T	V	E	T	A	I	R	G	L	T	A	V	S	D	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	H	I	R	S	V	P
Template Known Secondary structure		S																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	T		S																			T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		404	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.										.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	450	.	.	.	.	.
		475	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.					.	.	.	.	.	.	.	540	.	.
Predicted Secondary structure																																																												.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																												.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	V	S	E	I	F	K	N	G	R	A	S	I	S	L	G	Y	I	G	I	H	E	T	I	N	A	L	F	G	G	E	H	V	Y	D	N	E	Q	L	R	A	K	G	I	A	I	V	E	R	L	R	Q	A	V	D	Q	W	K	.	.	.	.	E	E	T	G	Y	G	F	S	L	Y	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																												.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.																.	.	.																													.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.																.	.	.
Template Sequence		S	I	A	A	G	N	A	A	S	H	A	.	I	G	L	G	Q	M	N	L	H	G	Y	L	A	R	E	.	.	.	G	I	A	Y	G	S	P	E	A	L	D	F	T	N	L	Y	F	Y	T	I	T	W	H	A	V	H	T	S	M	R	L	A	R	E	R	G	K	T	F	A	G	F	A	Q	S	R	Y	A	S	G
Template Known Secondary structure													.															T	.	.	.	T			T	T	S																														T				T	T	G	G	G	S					S
Template Predicted Secondary structure													.																.	.	.
Template SS confidence
		456	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.		.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.				.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.
																												543	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.																	.	.	.	.	.			.	570	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T	P	S	E	N	L	C	D	R	F	C	R	L	D	T	A	E	F	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	P	G	V	T	.	.	D	K	G	Y	Y	T	N	S	F	H
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	Y	F	T	Q	Y	L	Q	D	D	W	Q	P	K	T	A	K	V	R	A	L	F	A	R	S	G	I	T	L	P	T	R	E	M	W	L	K	L	R	D	D	V	M	R	Y	G	I	Y	N	Q	N	L	Q	A	V	P	P	T	G	S	I	S	Y	I	N	H	A	T	S	S	I	H	P	I	V	A	K	I	E	I
Template Known Secondary structure									S	S			S		S	S											T																						S		S			B		B					T						T			S	S	S	S			S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		532	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.
														579	580	.	.	.	.												.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630		.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	D	V	E	K	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	N	P	Y	D	K	I	D	F	E	A	P	Y	P	P	L	A	N	G	G	F	I	C	Y	G	E	Y	P	N	I	Q	H	N	L	K	A	L	E	D	V	W	D	Y	S	Y	Q	.	H	V
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.																	.
Template Conservation																																																												.
Template Sequence		R	K	E	G	K	T	G	R	V	Y	Y	P	A	P	F	M	T	N	E	N	L	D	M	Y	Q	D	A	Y	D	I	G	P	E	K	I	I	D	T	Y	A	E	A	T	R	H	V	D	Q	G	L	S	L	T	L	F	F	P	D	.	T	A	T	T	R	D	I	N	K	A	Q	I	Y	A	W	R	K	G	I
Template Known Secondary structure					S	T	T	S							T	T			T	T	S	G	G	G																					T	T		S	S		B								T	.	T																	T
Template Predicted Secondary structure																																																												.
Template SS confidence
		612	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.		670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.