Job Description P28903 Confidence 99.26% Date Thu Jan 5 11:45:16 GMT 2012 Rank 12 Aligned Residues 410 % Identity 13% Template d1l1la_ SCOP info PFL-like glycyl radical enzymes PFL-like glycyl radical enzymes B12-dependent (class II) ribonucleotide reductase Resolution 1.75

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		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	L	D	Y	S	P	F	F	P	M	F	N	C	M	L	I	D	L	K	G	M	L	T	Q	G	F	K	M	G	N	A	E	I	E	P	P	K	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	S	T	A	T	A	V	T	A	Q	I	I	A	Q	V	A	S	H	I	Y	G	G	T
Query Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.
Template Conservation																						.	.																																																.	.	.	.	.
Template Sequence		G	L	G	A	T	P	S	G	R	N	L	W	I	S	G	T	D	Y	Q	R	.	.	R	T	G	D	S	L	N	N	C	W	F	V	A	I	R	P	Q	K	Y	G	D	S	K	I	V	P	S	Y	L	G	K	Q	E	K	A	V	S	M	P	F	S	F	L	F	D	E	L	.	.	.	.	.	M	K	G	G	G	V
Template Known Secondary structure		T	T	S											T	T	S					.	.	T	S	T	T	T	T									S						S		S				T	T	S		S	S				T	T											.	.	.	.	.		T	T
Template Predicted Secondary structure																						.	.																																																.	.	.	.	.
Template SS confidence
		91	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110			.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.						.	.	160	.	.	.
		224	.	.																																																																.	.	.	230	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	I	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	I	D	E	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	F	S	V	A	R	S	N	I	S	Q	I	P	R	V	D	F	A	I	D	L	Q	L	V	V	D	E	T	S	E	S	Y	D	A	S	V	K	V	G	A	V	G	K	N	E	L	V	Q	D	A	D	S	I	Y	Y	R	L	P	D	T	R	E	G	W	V	L	A	N	A	L	L	I	D	L	H	F	A	Q	T	N
Template Known Secondary structure											T	T	S															T	T	S	T	T							T	T		B		T	T	T					T	T								S	S														T	T	S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
															232	.	.				.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	P	.	.	.	F	V	T	A	S	Y	N	K	H	R	K	T	A	E	E	W	N	I	P	D	A	E	G	Y	A	N	S	R	T	I	K	E	C	Y	D	A	F	Q	S	L	E	Y	E	V	N	T	L	H	T	A	N	G	Q	T	P	F	V	T	F	G	F
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.	.																																									.	.
Template Conservation																																																													.	.
Template Sequence		P	D	R	K	Q	K	L	I	L	D	L	S	D	I	R	P	Y	G	A	E	I	H	G	F	G	G	T	A	S	G	P	M	P	L	I	S	M	L	L	D	V	N	E	V	L	N	N	K	A	G	G	R	L	T	A	V	D	A	A	.	.	D	I	C	N	L	I	G	K	A	V	V	A	G	N	A	E	L	A	L
Template Known Secondary structure		T	T										T	T	S			T	T		B		T	T	S	S	S	B				S																T	T	T	T	S									.	.												T	T
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.
Template SS confidence
		244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.			.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
		296	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	L	G	T	S	W	E	S	R	L	I	Q	E	S	I	L	R	N	R	I	A	G	L	G	K	N	R	K	T	A	V	F	P	K	L	V	F	A	I	R	D	G	L	N	H	K	K	G	D	P	N	Y	D	I	K	Q	L	A	L	E	C	A	S	K	R	M	Y	P	D	I	L	N	Y	D	Q	V	V	K	V	T
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.											.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.											.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	S	N	D	D	Q	D	.	.	.	.	.	.	.	F	I	S	M	K	Q	D	Q	E	K	.	.	.	L	M	H	H	R	W	A	S	N	N	S	V	A	V	D	S	A	F	.	.	.	.	.	.	.	S	G	Y	Q	P	I	A	A	G	I	R	E	N	G	E	P	G	I	V	N	L	D	L	S	K	N	Y	G
Template Known Secondary structure				T	T				.	.	.	.	.	.	.				G	G	G					.	.	.				T	G	G	G									T	T		.	.	.	.	.	.	.														S														S
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.											.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		326	.	.	.	330	.	.								.	.	.	.	.	.	.	340	.	.				.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360								.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.
		376	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	S	F	K	T	P	M	G	C	R	S	F	L	G	V	W	E	N	E	N	G	E	Q	I	H	D	G	R	N	N	L	G	V	I	S	L	N	L	P	R	I	A	L	E	A	K	G	D	E	A	T	F	W	K	L	L	D	E	R	L	V	L	A	R	K	A	L	M	T	R	I	A	R	L	E	G	V	K	A	R
Query Conservation
Alig confidence																																												.	.	.						.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																												.	.	.						.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	I	V	D	G	Y	Q	A	G	I	D	G	D	V	E	G	T	N	P	C	G	E	I	S	L	A	N	G	E	P	C	N	L	F	E	V	F	P	L	I	A	E	.	.	.	E	Q	G	W	D	.	.	.	.	.	L	Q	E	V	F	A	L	A	A	R	Y	A	K	R	V	T	F	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S	G	G	G				T	T	T	T	T	T						T	T			S				T	T		B													.	.	.		T	T			.	.	.	.	.																T	T	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.						.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		389	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430				.	.	.	.	.						.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.
		456	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	510	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	A	P	I	L	Y	M	E	G	A	C	G	V	R	L	N	A	D	D	D	V	S	E	I	F	K	N	G	R	A	S	I	S	L	G	Y	I	G	I	H	E	T	I	N	A	L	F	G	G	E	H	V	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	N	E	Q	L	R	A	K	G
Query Conservation																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	P	Y	D	W	E	I	S	R	E	I	I	Q	K	N	R	R	.	I	G	I	S	M	S	G	I	Q	D	W	L	L	T	R	L	G	N	R	V	V	T	G	F	K	D	D	F	D	P	E	T	H	E	A	I	K	V	P	V	Y	D	K	R	A	I	K	M	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S			S														.							S										S	S		S										T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Template SS confidence
															453	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.		470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.
		518	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.				.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.			.	570	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.																									.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.																									.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	A	I	V	E	R	L	R	Q	A	V	D	Q	W	K	E	E	T	G	Y	G	F	S	L	Y	S	T	.	.	.	P	S	E	N	L	C	D	R	F	C	R	L	D	T	A	E	F	G	V	V	P	G	V	T	.	.	D	K	G	Y	Y	T	N	S	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																													.	.	.																									.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	Q	L	Y	K	A	V	V	K	A	D	Q	D	Y	S	K	T	L	G	C	N	E	S	I	K	H	T	T	V	K	P	S	G	T	V	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	L	A	G	A	S	E	G	M	H	F	H	Y	G	A	Y	L	I	Q	R	I	R	F	Q	D	S	D	P	L	L	P	A
Template Known Secondary structure																				T					S					B								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T				T	T			B	S		S										T	T		T
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		519	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.													.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.
																										578	.	580	.	.									.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.		600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	L	D	V	E	.	.	.	.	.	.	.	.	K	K	V	N	P	Y	D	K	I	D	F	E	A	P	Y	P	P	.	L	A	N	G	G	F	I	C	Y	G	E	Y	P	N	I	Q	H	N	L	K	A	L	E	D	V
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.																		.																.	.
Template Conservation																																																																								.	.
Template Sequence		L	K	A	C	G	Y	R	T	E	A	D	I	Y	T	E	N	T	T	C	V	E	F	P	I	K	A	V	G	A	D	N	P	N	F	A	S	A	G	T	V	S	I	A	E	Q	F	A	T	Q	A	F	L	Q	T	Y	W	S	D	N	A	V	S	C	T	I	T	F	Q	D	S	.	.	E	G	D	Q	V	E	S	L
Template Known Secondary structure					T	T							S	S	S	T	T											T	T	T	T		T	T			B	T	T	T	S																T		S	S		B								G	G	.	.	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																																								.	.
Template SS confidence
		587	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.			.	.	.	660	.	.	.	.
		625	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	D	Y	S	Y	Q	H	V	P	Y	Y	G	T	N	T	P	I	D
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		L	R	Q	Y	R	F	I	T	K	S	T	S	L	L	P	Y	F	G
Template Known Secondary structure					T	T	T	T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		665	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.