Job Description P28903 Confidence 99.34% Date Thu Jan 5 11:45:16 GMT 2012 Rank 10 Aligned Residues 440 % Identity 16% Template d1h16a_ SCOP info PFL-like glycyl radical enzymes PFL-like glycyl radical enzymes PFL-like Resolution 1.53

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		180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.		.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.
Query SS confidence																																												.
Query Sequence		L	K	G	M	L	T	Q	G	F	K	M	G	N	A	E	I	E	P	P	K	S	I	S	T	A	T	A	V	T	A	Q	I	I	A	Q	V	A	S	H	I	Y	G	.	G	T	T	I	N	R	I	D	E	V	L	A	P	F	V	T	A	S	Y	N	K	H	R	K	T	A	E	E	W	N	I	P	D	A	E	G	Y
Query Conservation																																												.
Alig confidence																																												.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	G	Q	M	K	E	M	A	A	K	Y	G	Y	D	I	S	G	P	A	T	N	A	Q	E	A	I	Q	W	T	Y	F	G	Y	L	A	A	V	K	S	Q	N	G	A	A	M	S	F	G	R	T	S	T	F	L	D	V	Y	I	E	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure												T	T				S	S				S																					B	S					B	S												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		259	260					.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.										.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300								.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	N	.	.	.	.	S	R	T	I	K	E	C	Y	D	A	F	Q	S	L	E	Y	E	V	N	T	L	H	T	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	G	Q	T	P	F	V	T	F	G	F	G	L	G	T	S	.	.	.	.	.	.	.	W	E	S	R	L	I	Q	E	S	I	L	R	N	R	I	A	G	L
Query Conservation				.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.		.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	D	L	K	A	G	K	I	T	E	Q	E	A	Q	E	M	V	D	H	L	V	M	K	L	R	M	V	R	F	L	R	T	P	E	Y	D	E	L	F	S	G	D	P	I	W	A	T	E	S	I	G	G	M	G	L	D	G	R	T	L	V	T	K	N	S	F	R	F	L	N	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.				T	T	S	S																	T	T													S		S	S											B		T	T	S		B													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
			290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		319	320	.	.	.		.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.		.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.																																																					.
Query SS confidence							.																																																					.
Query Sequence		G	K	N	R	K	.	T	A	V	F	P	K	L	V	F	A	I	R	D	G	L	N	H	K	K	G	D	P	N	Y	D	I	K	Q	L	A	L	E	C	A	S	K	R	M	Y	P	D	I	L	N	Y	D	Q	V	V	K	V	T	.	G	S	F	K	T	P	M	G	C	R	S	F	L	G	V	W	E	N	E	N	G
Query Conservation							.																																																					.
Alig confidence		.					.												.	.	.	.	.	.							.																													.																	.	.	.	.	.
Template Conservation		.																	.	.	.	.	.	.							.																																														.	.	.	.	.
Template Sequence		.	L	Y	T	M	G	P	S	P	E	P	N	M	T	I	L	W	.	.	.	.	.	.	S	E	K	L	P	L	.	N	F	K	K	F	A	A	K	V	S	I	D	T	S	S	L	Q	Y	E	N	D	D	L	M	R	P	D	F	N	N	D	D	Y	A	I	A	C	C	V	S	P	M	I	V	G	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.				S				S		S							.	.	.	.	.	.		T	T	S			.																													T		S						T	T	T					T	T	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.																	.	.	.	.	.	.							.																																														.	.	.	.	.
Template SS confidence
			360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.							.	.	.	.	380	.		.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.
		397	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	Q	I	H	D	G	R	N	N	L	G	V	I	S	L	N	L	P	R	I	A	L	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	K	G	D	E	A	T	F	W	K	L	L	D	E	R	L	V	L	A	R	K	A	L	M	T	R	I	A	R	L	E	G	V	K
Query Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	K	Q	M	Q	F	F	G	A	R	A	N	L	A	K	T	M	L	Y	A	I	N	G	G	V	D	E	K	L	K	M	Q	V	G	P	K	S	E	P	I	K	G	D	V	L	N	Y	D	E	V	M	E	R	M	D	H	F	M	D	W	L	A	K	Q	Y	I	T	A	L	N	I	I	H	Y	M	H
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	T																				T	T	T	B		T	T	T			B		S								S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.
Template SS confidence
							427	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.
		454	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.																										.	.	.
Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	R	V	A	P	I	L	Y	M	E	G	A	C	G	V	R	L	N	A	D	D	D	V	S	E	I	F	K	N	G	R	A	S	I	S	L	G	Y	I	G	I	H	E	T	I	N	A	L	F	G	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	V	Y
Query Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	K	Y	S	Y	E	A	S	L	M	A	L	H	D	R	D	V	I	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	M	A	C	G	I	A	G	L	S	V	A	A	D	S	L	S	A	I	K	Y	A	K	V	K	P	I	R	D	E	D	G	L	A	I	D	F	E	I	E	G	E	Y	P	Q	F	G	N
Template Known Secondary structure					S							T	T	S		S	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						S								T	T	S									S					T	T	S
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		502	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520														.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.
		509	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.							.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.
Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	N	E	Q	L	R	A	K	G	I	A	I	V	E	R	L	R	Q	A	V	D	Q	W	K	E	E	T	G	Y	G	F	S	L	Y	S	T	P	S	E	N	L	C	D	R	F	C	R	L	D	T	A	E	F	G	V	V	P	G	V	T	D	K	G	.	.	.	.	.	.	Y	Y	T	N	S	F	H	L	D	V	E
Query Conservation																																																																	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	D	P	R	V	D	D	L	A	V	D	L	V	E	R	F	M	K	K	I	Q	K	L	H	T	Y	R	D	A	I	P	T	Q	S	V	L	T	I	T	S	N	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	Y	G	K	K	T	G	N	T	P	D	G	R	R	A	G	A	P	F	G	P	G	A	N	P	M	H	G	R
Template Known Secondary structure																							T	S			G	G	G										T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.					T					T	T	S			T	T					S	T	T			S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		569	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610										.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		583	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.		.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.							.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.																.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.																.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	K	V	N	P	Y	D	K	I	D	F	E	A	P	Y	.	P	P	L	A	N	G	G	F	I	C	Y	G	E	Y	P	.	.	.	.	.	.	N	I	Q	H	N	L	K	A	L	E	D	V	W	D	Y	S	Y	Q	H	V	P	Y	Y	G	T	N	T	P	I	D	E	C	Y	E	C	G	F	T	G	E	F	E	C
Query Conservation																	.																.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.																.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	Q	K	G	A	V	A	S	L	T	S	V	A	K	L	P	F	A	Y	A	K	D	G	I	S	Y	T	F	S	I	V	P	N	A	L	G	K	D	D	E	V	R	K	T	N	L	A	G	L	M	D	G	Y	F	H	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	A	S	I	E	G	G	Q	H	L	N	V	N	V
Template Known Secondary structure				S											T	S		G	G	G		T	T															S	S																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B	T	T	B
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.											.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		656	.	.	.	660						.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.	.
Query Sequence		T	S	K	G	F	.	.	.	.	.	T	C	P	K	C	G	N	H	D	A	S	R	V	S	V	T	R	R	V	C	G	Y	L	G	S	P	D	A	R	P	F	N	A	G	K	Q	E	E	V	K	R	R	V	K	H	L	G
Query Conservation							.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.															.	.
Template Conservation																				.	.	.	.	.	.															.	.
Template Sequence		M	N	R	E	M	L	L	D	A	M	E	N	P	E	K	Y	P	Q	.	.	.	.	.	.	L	T	I	R	V	S	G	Y	A	V	R	F	N	S	.	.	L	T	K	E	Q	Q	Q	D	V	I	T	R	T	F	T	Q	S
Template Known Secondary structure														G	G	G		T	T	.	.	.	.	.	.						S	S	S				G	G	G	.	.	S										T	S			B
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.															.	.
Template SS confidence
		710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.							.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.			.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.