Job Description P75959 Confidence 98.98% Date Thu Jan 5 12:16:28 GMT 2012 Rank 62 Aligned Residues 262 % Identity 22% Template c3ifrB_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:carbohydrate kinase, fggy; PDBTitle: the crystal structure of xylulose kinase from rhodospirillum rubrum Resolution 2.30 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.										.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.					.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.												.	.
Query SS confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.												.	.
Query Sequence		Y	Y	G	F	D	I	G	G	T	K	I	A	L	G	V	F	D	S	G	R	Q	L	Q	W	E	K	R	V	P	T	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	D	S	Y	D	A	F	L	D	A	V	C	E	L	V	A	E	A	D	Q	R	F	G	.	.	.	.	C	K	G	S	V	G	I	G	I	P	G	.	.
Query Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.												.	.
Alig confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.												.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	I	G	L	D	I	G	T	T	S	T	I	A	I	L	V	R	L	P	D	T	V	V	A	V	A	S	R	P	T	T	L	S	S	P	H	P	G	W	A	E	E	D	P	A	Q	W	W	D	N	A	R	A	V	L	A	E	L	K	T	T	A	G	E	S	D	W	R	P	G	G	I	C	V	T	G	X	L	P	A
Template Known Secondary structure									S	S									T	T	T													B		S	S	T	T																									T	G	G	G												S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
			67	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	M	P	E	T	E	D	G	T	L	Y	A	A	N	V	P	A	A	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	V	L	L	D	D	R	G	A	V	L	R	P	S	I	Q	Q	S	D	G	R	C	G	D	E	V	A	E	L	R	A	E	V	D	S	E	A	F	L	A	R	T	G	N	G	V	T	Q	Q	L	V	T	A	K	L	R	W	I	E	R	H	E	P	A	V	F	G	A	I	A	T	V	C	G	S	Y	D	Y	I	N
Template Known Secondary structure		B					T	T	S		B		S					T	T			T	T											S										S	S		S	S	T	T	S																		T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		89	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.
																																																										86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.		.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	P	L	R	A	D	L	S	A	R	L	D	R	D	V	R	L	.	D	N	D	A	N	C
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Template Conservation
Template Sequence		X	L	L	T	G	E	R	V	V	D	R	N	W	A	L	E	G	G	F	I	D	L	A	S	G	T	V	E	A	D	L	V	A	L	A	H	I	P	P	S	A	V	P	P	A	H	P	T	H	R	V	L	G	A	V	T	A	E	A	A	A	L	T	G	L	P	T	G	L	P	V	Y	G	G	A	A	D	H	I	A
Template Known Secondary structure																			T				T	T	T	T										T	T	S		G	G	G	S						T	T	S																	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.
		109	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	A	L	S	E	A	W	D	D	E	F	T	Q	Y	P	L	V	M	G	L	I	L	G	T	G	V	G	G	G	L	I	F	N	G	K	P	I	T	G	K	S	Y	I	T	G	E	F	G	H	M	R	L	P	V	D	A	L	T	M	M	G	L	D	F	P	L	R	R	C	G	C	G	Q	H	G	C	I	E	N	Y
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	A	L	A	.	.	.	.	.	A	G	I	T	R	P	G	D	V	L	L	K	F	G	G	A	G	D	I	I	V	A	S	A	T	A	K	S	R	L	Y	L	D	Y	H	L	V	P	G	L	Y	A	P	N	G	C	X	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A
Template Known Secondary structure						.	.	.	.	.	T	T			S	T	T							S	S	S							B	S	S						B			B		S	S	T	T		B							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		249	250	.	.						.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								300
		189	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	S	G	R	G	F	A	W	L	Y	Q	H	Y	Y	H	Q	P	L	Q	A	P	E	I	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	Y	D	Q	G	D	E	Q	A	R	A	H	V	E	R	Y	L	D	L	L	A
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	T	G	S	A	L	N	W	L	A	K	L	L	A	P	E	A	G	E	A	A	H	A	Q	L	D	A	L	A	A	E	V	P	A	G	A	D	G	L	V	C	L	P	Y	F	L	G	D	P	F	A	S	G	T	F	T	G	L	S	L	S	H	T	R	G	H	L	W	R	A	L	L	E	A	V	A	L	A	F	R
Template Known Secondary structure			S	S											S	T	T		T	T												T	S		T	T	G	G	G							T	T			T	T							S			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		303	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.
		235	.	.	.	.	240	.	.	.		.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.
Predicted Secondary structure											.
Query SS confidence											.
Query Sequence		V	C	L	G	N	I	L	T	I	.	V	D	P	D	L	V	V	I	G	G	G	L	S	N	F	P	A	I	T	T	Q	L	A	D	R	L	P	R	H	L	L	P	V	A	R	V	P	R	I	E	R	A	R	H	G	D	A	G	G	M	R	G	A	A	F	L	H	L
Query Conservation											.
Alig confidence											.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.									.
Template Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.									.
Template Sequence		H	H	V	A	V	L	D	D	I	G	H	A	P	Q	R	F	F	A	S	D	G	G	T	R	S	R	V	W	X	G	I	X	A	D	V	L	Q	R	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	Q	L	L	A	N	P	L	.	G	S	A	V	G	A	A	W	V	A	A
Template Known Secondary structure											T										S	G	G	G	G													T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	T	.
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.									.
Template SS confidence
		389	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.										.	.	430	.	.	.	.	.		.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.