Job Description P75959 Confidence 99.31% Date Thu Jan 5 12:16:28 GMT 2012 Rank 53 Aligned Residues 286 % Identity 20% Template c3hz6A_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:xylulokinase; PDBTitle: crystal structure of xylulokinase from chromobacterium violaceum Resolution 1.65 Å

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		1	.		.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.										.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.				.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.														.
Query SS confidence				.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.														.
Query Sequence		M	Y	.	Y	G	F	D	I	G	G	T	K	I	A	L	G	V	F	D	S	G	R	Q	L	Q	W	E	K	R	V	P	T	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	D	S	Y	D	A	F	L	D	A	V	C	E	L	V	A	E	A	D	Q	R	.	.	.	F	G	C	K	G	S	V	G	I	G	I	P	G	.
Query Conservation				.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.														.
Alig confidence				.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.														.
Template Conservation
Template Sequence		F	Y	I	A	T	F	D	I	G	T	T	E	V	K	A	A	L	A	D	R	D	G	G	L	H	F	Q	R	S	I	A	L	E	T	Y	G	D	G	N	G	P	V	E	Q	D	A	G	D	W	Y	D	A	V	Q	R	I	A	S	S	W	W	Q	S	G	V	D	A	R	R	V	S	A	I	V	L	S	G	Q	X	Q
Template Known Secondary structure											S	S									T	T	S													B	S	T	T	S	S																						T	T	T			G	G	G											S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
				67	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	M	P	E	T	E	D	G	T	L	Y	A	A	N	V	P	A	A	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	F	L	P	L	D	Q	D	H	E	P	L	H	R	A	V	L	Y	S	D	K	R	P	L	K	E	A	E	E	I	N	A	R	H	G	A	D	N	L	W	S	A	L	E	N	P	X	T	A	A	S	I	L	P	K	L	V	F	W	R	A	S	F	P	Q	A	F	G	R	L	R	H	V	V	L	G	A	K	D	Y
Template Known Secondary structure			B					T	T	S		B	S	S					T	T																									S	S			S	T	T	S																	T	T							S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
																																																												86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.		.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	P	L	R	A	D	L	S	A	R	L	D	R	D	V	R	L	.	D	N	D	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Template Conservation
Template Sequence		V	V	L	R	L	T	G	R	H	A	T	D	R	T	N	A	S	T	T	G	L	Y	R	P	K	D	D	A	W	H	V	E	L	L	A	D	Y	G	F	S	L	D	L	X	P	R	L	L	E	P	G	E	Q	V	G	G	V	S	A	L	A	A	R	Q	T	G	F	V	S	G	T	P	V	L	C	G	L	G	D	A
Template Known Secondary structure								S												T	T				T	T	T	T										T	T			G	G	G	S						T	T	S																	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.
		107	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.								.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																		.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	C	F	A	L	S	E	A	W	D	D	E	F	T	Q	Y	P	L	V	M	G	L	I	L	G	T	G	V	G	G	G	L	I	F	N	G	K	P	I	T	G	K	S	Y	I	T	G	E	.	.	.	.	.	.	.	F	G	H	M	R	L	P	V	D	A	L	T	M	M	G	L	D	F	P	L	R	R	C	G	C
Query Conservation																																																		.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.
Template Sequence		G	A	A	T	L	G	.	.	.	.	.	V	G	V	L	D	D	E	D	A	Y	L	H	L	G	T	T	G	W	L	A	R	L	T	Q	T	D	P	V	G	D	X	P	V	G	T	I	F	R	L	A	G	I	I	A	G	K	T	L	Q	V	A	P	V	L	N	A	G	N	I	L	Q	W	A	L	T	L	V	G	H
Template Known Secondary structure								.	.	.	.	.	T	T			S	T	T							S	S	S														S			S	S							S	S	S	T	T									S	S	S								G	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.
Template SS confidence
		243	.	.	.	.	.						.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
		180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	Q	H	G	C	I	E	N	Y	L	S	G	R	G	F	A	W	L	Y	Q	H	Y	Y	H	Q	P	L	Q	A	P	E	I	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	Y	D	Q	G	D	E	Q	A	R	A	H	V	E	R	Y	L	D	L	L	A	V	C	L	G	N	I	L
Query Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	P	G	E	D	C	A	E	Y	F	H	X	A	A	A	E	V	Q	G	V	T	V	P	D	G	L	L	F	V	P	Y	L	H	A	E	R	C	P	V	E	L	P	A	P	R	G	A	L	L	G	V	T	G	A	T	T	R	A	Q	I	L	L	A	V	L	E	G	A	A	L	S	L	R	W	C	A	E	L	L	G
Template Known Secondary structure			T	T	S		S												T	T					T	T							S	S		B		S	S	S		B	S	S										T	T																										T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	I	V	D	P	D	L	V	V	I	G	G	G	L	S	N	F	P	A	I	T	T	Q	L	A	D	R	L	P	R	H	L	L	P	V	A	R	V	P	R	I	E	R	A	R	H	G	D	A	G	G	M	R	G	A	A	F	L	H	L
Query Conservation
Alig confidence				.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		X	E	.	K	V	G	L	L	K	V	V	G	G	G	A	R	S	E	A	W	L	R	X	I	A	D	N	L	N	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	L	L	V	K	P	D	A	H	L	H	P	L	R	G	L	A	A	L	A	A
Template Known Secondary structure		G	G	.	G								S	G	G	G	G													T		.	.	.	.	.	.	.	.	.								G	G	G
Template Predicted Secondary structure				.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		398	.		400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.										.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.