Job Description P75959 Confidence 98.81% Date Thu Jan 5 12:16:28 GMT 2012 Rank 66 Aligned Residues 261 % Identity 21% Template c2zf5O_ PDB info PDB header:transferase Chain: O: PDB Molecule:glycerol kinase; PDBTitle: crystal structure of highly thermostable glycerol kinase from a2 hyperthermophilic archaeon Resolution 2.40 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.														.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.
Query SS confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.
Query Sequence		M	Y	Y	G	F	D	I	G	G	T	K	I	A	L	G	V	F	D	S	G	R	Q	L	Q	W	E	K	R	V	P	T	P	R	D	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	D	A	F	L	D	A	V	C	E	L	V	A	E	A	D	Q	R	F	G	C	K	G	S	V	G	I	G	I	P	G	.
Query Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.
Alig confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.
Template Conservation
Template Sequence		F	V	L	S	L	D	E	G	T	T	S	A	R	A	I	I	F	D	R	E	S	N	I	H	G	I	G	Q	Y	E	F	P	Q	H	Y	P	R	P	G	W	V	E	H	N	P	E	E	I	W	D	A	Q	L	R	A	I	K	D	A	I	Q	S	A	R	I	E	P	N	Q	I	A	A	I	G	V	T	N	Q	R	E
Template Known Secondary structure										S	S									T	T														B			S	T	T																									T			G	G	G										S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.
				67	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.											.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100																														.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.
Query SS confidence		.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.
Query Sequence		.	.	M	P	E	T	E	D	G	T	L	Y	A	A	N	V	P	A	A	S	G	K	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	R	A	D	L	S	A	R	L	D	R	D	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	L	D	.	.
Query Conservation		.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.
Alig confidence		.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	T	L	V	W	D	K	D	G	K	P	L	Y	N	A	I	V	W	Q	C	R	R	T	A	E	M	V	E	E	I	K	R	E	Y	G	T	M	I	K	E	K	T	G	L	V	P	D	A	Y	F	S	A	S	K	L	K	W	L	L	D	N	V	P	G	L	R	E	K	A	E	K	G	E	V	M	F	G	T	V	D
Template Known Secondary structure								T	T			B	S	S					T	T			T	T																				S	S				T	T	S												S	T	T							T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		84	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
																																																																												104	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	D	A	N	C	F
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	F	L	I	Y	R	L	T	G	E	H	V	T	D	Y	S	N	A	S	R	T	M	L	F	N	I	K	K	L	D	W	D	D	E	L	L	E	L	F	D	I	P	E	S	V	L	P	E	V	R	E	S	S	E	V	Y	G	Y	T	K	K	E	L	L	G	A	E	I	P	V	S	G	D	A	G	D	Q	Q	A	A
Template Known Secondary structure										S										T	T	S	S	S			T	T	T	T										T	T			G	G	G							S													S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
		110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.								.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.
Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																									.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	L	S	E	A	W	D	D	E	F	T	Q	Y	P	L	V	M	G	L	I	L	G	T	G	V	G	G	G	L	I	F	N	G	K	P	I	T	G	K	.	.	.	.	.	.	.	S	Y	I	T	G	E	F	G	H	M	R	L	P	V	D	A	L	T	M	M	G	L	D	F	P	L	R	R	C	G	C	G	Q	H
Query Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	F	G	.	.	.	.	.	Q	A	A	F	E	A	G	M	V	K	A	T	Y	G	T	G	S	F	I	L	V	N	T	D	K	M	V	L	Y	S	D	N	L	L	T	T	I	A	W	G	L	N	G	R	V	S	Y	A	L	E	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					.	.	.	.	.	T	T			S	T	T							S	S	S									T						T	T	S									T	T										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		244	.	.						.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.
		183	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	220	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	C	I	E	N	Y	L	S	G	R	G	F	A	W	L	Y	Q	H	Y	Y	H	Q	P	L	Q	A	P	E	I	I	A	L	Y	D	Q	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	E	Q	A	R	A	H
Query Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	I	F	V	T	G	A	A	V	Q	W	L	R	D	G	I	K	I	I	K	H	A	S	E	T	E	E	L	A	T	K	L	E	S	N	E	G	V	Y	F	V	P	A	F	V	G	L	G	A	P	Y	W	D	Q	F	A	R	G	I	I	I	G	I	T	R	G	T	G	R	E	H	L	A	R	A	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.		S		S										T	S				S		G	G	G						T	T	S	S	S		T	T							T	T		B		T	T	T		B	T	T										T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.
Template SS confidence
							299	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.
		226	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	E	R	Y	L	D	L	L	A	V	C	L	G	N	I	L	T	I	V	D	P	D	L	V	V	I	G	G	G	L	S	N	F	P	A	I	T	T	Q	L	A	D	R	L	P	R	H	L	L	P	V	A	R	V	P	R	I	E	R	A	R	H	G	D	A	G	G	M	R	G	A	A	F	L	H	L
Query Conservation
Alig confidence																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.
Template Conservation																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.
Template Sequence		L	E	A	I	A	Y	L	T	R	D	V	V	D	E	M	E	K	L	V	Q	I	K	E	L	R	V	D	G	G	A	T	A	N	D	F	L	M	Q	F	Q	A	D	I	L	N	R	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	I	R	P	V	V	K	E	.	T	T	A	L	G	A	A	Y	L	A	G
Template Known Secondary structure																	T	T	T	S									S	G	G	G	G													T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.					S		S		.
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.
Template SS confidence
		374	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420										.	.	.	.	.	.	.	.		.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.