Job Description P71243 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:12:38 GMT 2012 Rank 18 Aligned Residues 395 % Identity 13% Template c3nb0A_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:glycogen [starch] synthase isoform 2; PDBTitle: glucose-6-phosphate activated form of yeast glycogen synthase Resolution 2.41 Å

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		2	.	.	.		.	.	.	.	10	.				.	.	.	.	.	.	.	.	20		.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.
Predicted Secondary structure						.							.	.	.										.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.							.	.	.										.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	V	G	F	.	F	L	L	K	F	P	.	.	.	L	S	S	E	T	F	V	L	N	.	Q	I	T	A	F	I	D	M	G	F	E	V	E	I	L	A	L	Q	K	G	D	T	Q	N	T	H	A	A	W	T	K	Y	N	L	A	A	R	T	R	W	L	Q	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation						.							.	.	.										.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.							.	.	.										.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	L	L	F	E	T	A	T	E	V	A	N	R	V	G	G	I	Y	S	V	L	K	S	K	A	P	I	T	V	A	Q	Y	K	D	H	Y	H	L	I	G	P	L	N	K	A	T	Y	Q	N	E	V	D	I	L	D	W	K	K	P	E	A	F	S	D	E	M	R	P	V	Q	H	A	L	Q	T	M	E	S	R	G
Template Known Secondary structure									T	T	T	T	S		S	S																		G	G	G									T	T	T										S	S	S	G	G	G	S		S	T	T												T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
															64	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.							.	.	120	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	P	T	G	K	V	A	K	L	R	H	R	A	S	Q	T	L	R	G	I	H	R	K	N	T	W	Q	A	L	N	L	K	R	Y	G	A	E	S	R	N	L	I	L	S	A	I	C	G	Q	V	A	T	P	F	.	.	.	.	.	.	R	A	D	V	F	I	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	H	F	V	Y	G	R	W	L	I	E	G	A	P	K	V	I	L	F	D	L	D	S	V	R	G	Y	S	N	E	W	K	G	D	L	W	S	L	V	G	I	P	S	P	E	N	D	F	E	T	N	D	A	I	L	L	G	Y	T	V	A	W	F	L	G	E	V	A	H	L	D	S	Q	H	A	I	V	A	H	F
Template Known Secondary structure										S	S	T	T									S	G	G	G	G	G	G																		S	S																											S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
		125	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	F	G	P	A	G	V	T	A	A	K	L	R	E	L	G	V	I	R	G	K	I	A	T	I	F	H	G	I	D	I	S	S	R	E	V	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	H	Y	T	P	E	Y	Q	Q	L	F	R	R	G	D	L	M	L	P
Query Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.
Template Sequence		H	E	W	L	A	G	V	A	L	P	L	C	R	K	.	R	R	I	D	V	V	T	I	F	T	T	H	A	T	L	L	G	R	Y	L	C	A	S	G	S	F	D	F	Y	N	C	L	E	S	V	D	V	D	H	E	A	G	R	F	G	I	Y	H	R	Y	C	I	E	R	A	A	A	H	S	A	D	V	F	T	T
Template Known Secondary structure			S	G	G	G		T								.	T	T		S								S	S								T	S	S	S		S						G	G	G										T	T															S	S
Template Predicted Secondary structure																.
Template SS confidence
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.		.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.
		181	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.		.	.
Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Query SS confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Query Sequence		I	S	D	L	W	A	G	R	L	Q	K	M	G	C	P	R	E	K	I	A	V	S	R	M	G	V	D	M	T	R	F	S	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	P	V	K	A	P	A	T	P	L	E	I	I	S	V	A	R	L	T	.	E	K
Query Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Alig confidence																					.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template Conservation																					.
Template Sequence		V	S	Q	I	T	A	F	E	A	E	H	L	L	K	R	K	P	D	G	.	I	L	P	N	G	L	N	V	I	K	F	Q	A	F	H	E	F	Q	N	L	H	A	L	K	K	E	K	I	N	D	F	V	R	G	H	F	H	G	C	F	D	F	D	L	D	N	T	L	Y	F	F	I	A	G	R	Y	E	Y	K	N
Template Known Secondary structure		S	S											T	S	S			S		.						B						S	S	T	T																					T	T	T				S		G	G	G								S	S			T	T	T
Template Predicted Secondary structure																					.
Template SS confidence
		247	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.		.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
		235	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.								.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	G	L	H	V	A	I	E	A	C	R	Q	L	K	E	Q	G	V	A	.	.	.	.	.	.	.	F	R	Y	R	I	L	G	I	G	P	W	E	R	R	L	R	T	L	I	E	Q	Y	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																					.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	G	A	D	M	F	I	E	A	L	A	R	L	N	Y	R	L	K	V	S	G	S	K	K	T	V	V	A	F	I	V	M	P	A	K	N	N	S	F	T	V	E	A	L	K	G	Q	A	E	V	R	A	L	E	N	T	V	H	E	V	T	T	S	I	G	K	R	I	F	D	H	A	I	R	Y	P	H	N	G	L
Template Known Secondary structure		T	T																		T	T																																																						T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		326	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.
																																																																									277	.	.	280	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	E	D	V	V	E	M	P	G
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	T	E	L	P	T	D	L	G	E	L	L	K	S	S	D	K	V	M	L	K	R	R	I	L	A	L	R	R	P	E	G	Q	L	P	P	I	V	T	H	N	M	V	D	D	A	N	D	L	I	L	N	K	I	R	Q	V	Q	L	F	N	S	P	S	D	R	V	K	M	I	F	H	P	E	F	L	N	A	N	N
Template Known Secondary structure			S	S	S																											T	T					S	B	S				T	T	G	G	G											T					T	T		S								S				T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		406	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.
		286	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.								.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.	.	.	.												.	.
Query SS confidence																																																														.	.	.	.	.	.	.												.	.
Query Sequence		F	K	P	S	H	E	V	K	A	M	L	D	D	A	D	V	F	L	L	P	S	V	T	G	A	D	G	D	M	E	G	I	P	V	A	L	M	E	A	M	A	V	G	I	P	V	V	S	T	L	H	S	G	I	P	E	L	V	E	A	.	.	.	.	.	.	.	D	K	S	G	W	L	V	P	E	N	D	.	.
Query Conservation																																																														.	.	.	.	.	.	.												.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.												.	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	I	L	G	L	D	Y	D	E	F	V	R	G	C	H	L	G	V	F	P	.	.	.	.	.	.	S	Y	Y	E	P	W	G	Y	T	P	A	E	C	T	V	M	G	V	P	S	I	T	T	N	V	S	G	F	G	S	Y	M	E	D	L	I	E	T	N	Q	A	K	D	Y	G	I	Y	I	V	D	R	R	F	K
Template Known Secondary structure		S	S	S												S						.	.	.	.	.	.		S	S	B	S	S										T	T							T	T	B								T	T	S								T	T							S	S	S
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		486	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.							.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.
							357	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	A	R	A	L	A	Q	R	L	A	A	F	S	Q	L	D	T	D	E	L	A	P	V	V	K	R	A	R	E	K	V	E	H	D	F	N	Q	Q	V	I	N	R	E	L	A	S	L	L	Q	A
Query Conservation		.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.														.
Template Conservation																				.
Template Sequence		A	P	D	E	S	V	E	Q	L	V	D	Y	M	E	E	F	V	K	.	K	T	R	R	Q	R	I	N	Q	R	N	A	T	E	A	L	S	D	L	L	D	W	K	R	M	G	L	E	Y	V	K	A	R	Q	L
Template Known Secondary structure																			T	.																G	G	G	G	G	B
Template Predicted Secondary structure																				.
Template SS confidence
		560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.		.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.