Job Description P71243 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:12:38 GMT 2012 Rank 3 Aligned Residues 378 % Identity 21% Template c2r60A_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:glycosyl transferase, group 1; PDBTitle: structure of apo sucrose phosphate synthase (sps) of2 halothermothrix orenii Resolution 1.80 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.			.	10	.													.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	K	V	G	F	F	L	L	.	.	K	F	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	S	S	E	T	F	V	L	N	Q	I	T	A	F	I	D	M	G	F	E	V	E	I	L	A	L	Q	K	G	D	T	Q	N	T	H	A	A	W	T	K	Y	N	L	A	A	R	T	R	W	L	Q	D	E	P	T
Query Conservation										.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																												.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	H	V	A	F	L	N	P	Q	G	N	F	D	P	A	D	S	Y	W	T	E	H	P	D	F	G	G	Q	L	V	Y	V	K	E	V	S	L	A	L	A	E	M	G	V	Q	V	D	I	I	T	R	R	I	K	D	E	N	W	P	E	F	S	G	E	I	D	Y	Y	Q	E	T	N	K	V	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										S	S				T	T		T	T	T	T	S	B	T	T	B	S																T	T												B	T	T	B	G	G	G			S					T	T		S	S		.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																												.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
		67	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.			.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																						.	.
Query SS confidence																																																						.	.
Query Sequence		G	K	V	A	K	L	R	H	R	A	S	Q	T	L	R	G	I	H	R	K	N	T	W	Q	A	L	N	L	K	R	Y	G	A	E	S	R	N	L	I	L	S	A	I	C	G	Q	V	A	T	P	F	R	.	.	A	D	V	F	I	A	H	F	G	P	A	G	V	T	A	A	K	L	R	E	L	G	V	I	R	G
Query Conservation																																																						.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	I	V	R	I	P	F	G	G	D	K	F	L	P	K	E	E	L	W	P	Y	L	H	E	Y	V	N	K	I	I	N	F	Y	R	E	E	G	K	F	P	Q	V	V	T	T	H	Y	G	D	G	G	L	A	G	V	L	L	K	N	I	K	G	L	P	F
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								S		S	S				G	G	G		G	G	G																T				S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																	82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.
		145	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.															160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.									.	.	.	.	.	.	.	200	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	I	A	T	I	F	H	G	I	D	I	S	S	R	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	L	N	H	Y	T	P	E	Y	Q	Q	L	F	R	R	G	D	L	M	L	P	I	S	D	L	W	A	G	R	L	Q	K	M	.	.	.	.	.	.	.	.	G	C	P	R	E	K	I	A	V	S
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	F	T	G	H	S	L	G	A	Q	K	M	E	K	L	N	V	N	T	S	N	F	K	E	M	D	E	R	F	K	F	H	R	R	I	I	A	E	R	L	T	M	S	Y	A	D	K	I	I	V	S	T	S	Q	E	R	F	G	Q	Y	S	H	D	L	Y	R	G	A	V	N	V	E	D	D	D	K	F	S	V	I
Template Known Secondary structure						S	S								T	T				S	T	T	S																								S					S	S							T	T	T	S	G	G	G	T	T	T			T	T		G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		147	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.
		203	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.
Query Sequence		R	M	G	V	D	M	T	R	F	S	P	R	P	V	K	A	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	T	P	L	E	I	I	S	V	A	R	L	T	E	K	K	G	L	H	V	A	I	E	A	C	R	Q	L	K	E	Q	G	V	A	F	R	Y	R	I	L	G	I	G	P	W	E	.
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.
Template Conservation
Template Sequence		P	P	G	V	N	T	R	V	F	D	G	E	Y	G	D	K	I	K	A	K	I	T	K	Y	L	E	R	D	L	G	S	E	R	M	E	L	P	A	I	I	A	S	S	R	L	D	Q	K	K	N	H	Y	G	L	V	E	A	Y	V	Q	N	K	E	L	Q	D	K	A	N	L	V	L	T	L	R	G	I	E	N	P
Template Known Secondary structure					B		T	T	T	S	S	S																		S		G	G	G	T	T	S							S				G	G	G											T															S	S		S	B	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		227	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.
																	266	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.					.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	R	L	R	T	L	I	E	Q	Y	Q	L	E	D	V	V	E	M	P	G	F	K	P	S	H	E	V	K	A	M	.	.	.	.	L	D	D	A	D	V	F	L	L	P	S	V	T	G	A	D	G	D	M	E	G	I	P	V	A	L	M	E	A	M	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.														.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	E	D	Y	S	R	A	G	Q	E	E	K	E	I	L	G	K	I	I	E	L	I	D	N	N	D	C	R	G	K	V	S	M	F	P	L	N	S	Q	Q	E	L	A	G	C	Y	A	Y	L	A	S	K	G	S	V	F	A	L	T	S	F	Y	.	.	.	.	.	.	E	P	F	G	L	A	P	V	E	A	M	A
Template Known Secondary structure		T	T	B		T	T	S																		T	T		B	T	T								S														T	T								S		.	.	.	.	.	.	B				S
Template Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		307	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.							.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380
		327	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	G	I	P	V	V	S	T	L	H	S	G	I	P	E	L	V	E	A	D	K	S	G	W	L	V	P	E	N	D	A	R	A	L	A	Q	R	L	A	A	F	S	Q	L	D	T	D	E	L	A	P	V	V	K	R	A	R	E	K	V	E	H	D	F	N	Q	Q	V	I	N	R	E	L	A	S	L	L	Q	A	L
Query Conservation
Alig confidence																																													.
Template Conservation																																													.
Template Sequence		S	G	L	P	A	V	V	T	R	N	G	G	P	A	E	I	L	D	G	G	K	Y	G	V	L	V	D	P	E	D	P	E	D	I	A	R	G	L	L	K	A	F	E	.	S	E	E	T	W	S	A	Y	Q	E	K	G	K	Q	R	V	E	E	R	Y	T	W	Q	E	T	A	R	G	Y	L	E	V	I	Q	E	I
Template Known Secondary structure		T	T							S	S	B						T	G	G	G	T	S	S					T	T														S	.																				S	B
Template Predicted Secondary structure																																													.
Template SS confidence
		381	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.		.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.