Job Description P02918 Confidence 99.72% Date Thu Jan 5 10:57:34 GMT 2012 Rank 49 Aligned Residues 232 % Identity 18% Template d1e25a_ SCOP info beta-lactamase/transpeptidase-like beta-lactamase/transpeptidase-like beta-Lactamase/D-ala carboxypeptidase Resolution 1.9

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		426	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.				.	.	.		480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.
Predicted Secondary structure																																																					.	.	.				.
Query SS confidence																																																					.	.	.				.
Query Sequence		N	S	A	L	V	S	I	N	P	Q	N	G	A	V	M	A	L	V	G	G	F	D	F	N	Q	S	K	F	N	R	A	T	Q	A	L	R	Q	V	G	S	N	I	K	P	F	L	Y	T	A	A	M	.	.	.	D	K	G	.	L	T	L	A	S	M	L	N	D	V	P	I	S	R	W	D	A	S	A	G	S	D
Query Conservation																																																					.	.	.				.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.				.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	V	G	V	A	V	W	G	P	D	D	L	E	P	L	L	I	N	P	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	K	F	P	M	Q	S	V	F	K	L	H	L	A	M	L	V	L	H	Q	V	D	Q	G	K	L	D	L	N	Q	T	V	I	V	N	R	A	K	V	L	Q	N	T	W	A	P	I
Template Known Secondary structure										T	T		S	S					S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						G	G	G															T	T	S	S		T	T							T	T	T	S			S	S			T
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		43	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.														.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		502	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.					520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.		.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.							.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.																		.																						.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.																		.																						.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	Q	P	K	N	S	P	P	Q	Y	A	G	P	I	R	L	R	Q	.	.	.	.	G	L	G	Q	S	K	N	V	V	M	V	R	A	M	R	A	M	.	G	V	D	Y	A	A	E	Y	L	Q	R	F	G	F	P	A	Q	N	I	V	H	.	.	.	.	.	.	T	E	S	L	A	L	G	S	A	S	F	T	P
Query Conservation																				.	.	.	.																		.																						.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																.	.	.	.																		.																						.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.
Template Sequence		.	.	.	M	K	A	Y	Q	G	D	E	F	S	V	P	V	Q	Q	L	L	Q	Y	S	V	S	H	S	D	N	V	A	C	D	L	L	F	E	L	V	G	G	P	A	A	L	H	D	Y	I	Q	S	M	G	I	K	E	T	A	V	V	A	N	E	A	Q	M	H	A	D	D	Q	V	Q	Y	Q	N	W	T	S	M
Template Known Secondary structure		.	.	.				S		S	S																														T												T	T			S	B													T	T	G	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.
Template SS confidence
					109	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.
		571	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	Q	V	A	R	G	Y	A	V	M	A	N	G	G	F	L	V	D	P	W	F	I	S	K	I	E	N	D	Q	G	G	V	I	F	E	A	K	P	K	V	A	C	P	E	C	D	I	P	V	I	Y	G	D	T	Q	K	S	N	V	L	E	N	N	D	V	E	D	V	A	I	S	R	E	Q	Q	N	V	S	V	P
Query Conservation
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	G	A	A	E	I	L	K	K	F	E	Q	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure													T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		184	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.
		651	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																														.	.	.	.
Query SS confidence																																																																														.	.	.	.
Query Sequence		M	P	Q	L	E	Q	A	N	Q	A	L	V	A	K	T	G	A	Q	E	Y	A	P	H	V	I	N	T	P	L	A	F	L	I	K	S	A	L	N	T	N	I	F	G	E	P	G	W	Q	G	T	G	W	R	A	G	R	D	L	Q	R	R	D	I	G	G	K	T	G	T	T	N	S	S	K	D	A	.	.	.	.
Query Conservation																																																																														.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.										.																					.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.										.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	Q	L	S	E	T	S	Q	A	L	L	W	K	W	M	V	E	T	T	.	.	.	.	.	T	G	P	E	R	L	K	G	L	.	L	P	A	G	T	V	V	A	H	K	T	G	T	S	Q	I	K	A	G	K	T	A	A	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S														S			.	.	.	.	.	S		T	T	S	T	T	T	T	.	S		T	T														T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.										.
Template SS confidence
																								197	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.						.	.	.	.	220	.	.	.	.		.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.
		727	.	.	730	.	.						.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.
Query Sequence		W	F	S	G	Y	G	.	.	.	.	.	P	G	V	V	T	S	V	W	I	G	F	D	D	H	R	R	N	L	G	H	T	T	A	S	G	A	I	K	D	Q	I	S	G	Y	E	G	G	A	K	S	A	Q	P	A	W	D	A	Y	M	K	A	V	L	E
Query Conservation								.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	D	L	G	I	I	L	L	P	D	G	R	P	L	L	V	A	V	F	V	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	S	A	E	S	S	R	T	N	E	A	I	I	A	Q	V	A	Q	T	A	Y	Q	F	E	L	K
Template Known Secondary structure										T	T	S											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		245	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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