Job Description P02918 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:57:34 GMT 2012 Rank 1 Aligned Residues 581 % Identity 29% Template c3dwkC_ PDB info PDB header:transferase Chain: C: PDB Molecule:penicillin-binding protein 2; PDBTitle: identification of dynamic structural motifs involved in2 peptidoglycan glycosyltransfer Resolution 3.10 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		43	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.		.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.
Predicted Secondary structure																						.
Query SS confidence																						.
Query Sequence		R	L	Q	I	P	M	Q	I	Y	S	A	D	G	E	L	I	A	Q	Y	G	.	E	K	R	R	I	P	V	T	L	D	Q	I	P	P	E	M	V	K	A	F	I	A	T	E	D	S	R	F	Y	E	H	H	G	V	D	P	V	G	I	F	R	A	A	S	V	A	L	F	S	G	H	A	S	Q	G	A	S	T	I
Query Conservation																						.
Alig confidence																						.
Template Conservation
Template Sequence		Q	D	P	I	P	A	K	I	Y	D	K	N	G	E	L	V	K	T	L	D	N	G	Q	R	H	E	H	V	N	L	K	D	V	P	K	S	M	K	D	A	V	L	A	T	E	D	N	R	F	Y	E	H	G	A	L	D	Y	K	R	L	F	G	A	I	G	K	N	L	T	G	G	F	G	S	E	G	A	S	T	L
Template Known Secondary structure					B							T	T	S								S	S		B						G	G	G	S														G	G	G	T	T												T	T	T	T	T	T	T	S		S	S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		122	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	Q	Q	L	A	R	N	F	F	L	S	P	E	R	T	L	M	R	K	I	K	E	V	F	L	A	I	R	I	E	Q	L	L	T	K	D	E	I	L	E	L	Y	L	N	K	I	Y	L	G	Y	R	A	Y	G	V	G	A	A	A	Q	V	Y	F	G	K	T	V	D	Q	L	T	L	N	E	M	A	V	I	A	G
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		T	Q	Q	V	V	K	D	A	F	L	S	Q	H	K	S	I	G	R	K	A	Q	E	A	Y	L	S	Y	R	L	E	Q	E	Y	S	K	D	D	I	F	Q	V	Y	L	N	K	I	Y	Y	S	D	G	V	T	G	I	K	A	A	A	K	Y	Y	F	N	K	D	L	K	D	L	N	L	A	E	E	A	Y	L	A	G
Template Known Secondary structure															S		S	S																S													S	B		S	T	T	B	B	S									T				S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		202	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.											.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.
Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	P	K	A	P	S	T	F	N	P	L	Y	S	M	D	R	A	V	A	R	R	N	V	V	L	S	R	M	L	D	E	G	Y	I	T	Q	Q	Q	F	D	Q	T	R	T	E	A	I	N	A	N	Y	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	P	E	I	A	F	S	A	P	Y	L	S	E	M	V	R	Q	E
Query Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	P	Q	V	P	N	N	Y	N	I	Y	D	H	P	K	A	A	E	D	R	K	N	T	V	L	Y	L	M	H	Y	H	K	R	I	T	D	K	Q	W	E	D	A	K	K	I	D	L	K	A	N	L	V	N	R	T	P	E	E	R	Q	N	I	D	T	N	Q	D	S	E	Y	N	S	Y	V	N	F	V	K	S	E
Template Known Secondary structure		G	G	G	S						T	T	T																			T	T	S	S									T	T	S		S	G	G	G						T	T	G	G	G						T	T	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		272	.	.	.	.	.							.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	Y	N	R	Y	G	.	.	.	.	.	.	E	S	A	Y	E	D	G	Y	R	I	Y	T	T	I	T	R	K	V	Q	Q	A	A	Q	Q	A	V	R	N	N	V	L	D	Y	D	M	R	H	G	Y	R	G	P	A	N	V	L	W	K	V	G	E	S	A	W	D	N	N	K	I	T	D	T	L	K	A	L	P	T
Query Conservation								.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	M	N	N	K	A	F	K	D	E	N	L	G	N	V	L	Q	S	G	I	K	I	Y	T	N	M	D	K	D	V	Q	K	T	L	Q	N	D	V	D	N	G	S	F	Y	K	N	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			T	T	S	S	T	T	S	S	S						T	T	B	T																							S			S	S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.
		346	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	G	P	L	L	P	A	A	V	T	S	A	N	P	Q	Q	A	T	A	M	L	A	D	G	S	T	V	A	L	S	M	E	G	V	R	W	A	R	P	Y	R	S	D	T	Q	Q	G	P	T	P	R	K	V	T	D	V	L	Q	T	G	Q	Q	I	W	V	R	Q	V	G	D	A	W	W	L	A	Q	V	P	E	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	Q
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																																357	.
		426	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.		.	.	.	.	.	.	.	.		480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.									.
Query SS confidence																																																.									.
Query Sequence		N	S	A	L	V	S	I	N	P	Q	N	G	A	V	M	A	L	V	G	G	F	D	F	N	Q	S	K	F	N	R	A	T	Q	A	L	R	Q	V	G	S	N	I	K	P	F	L	.	Y	T	A	A	M	D	K	G	.	L	T	L	A	S	M	L	N	D	V	P	I	S	R	W	D	A	S	A	G	S	D	W	Q
Query Conservation																																																.									.
Alig confidence																																																.									.																		.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																											.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	V	G	A	T	I	L	D	S	K	T	G	G	L	V	A	I	S	G	G	R	D	F	K	D	V	V	N	R	N	Q	A	T	D	P	H	P	T	G	S	S	L	K	P	F	L	A	Y	G	P	A	I	E	N	M	K	W	A	T	N	H	A	I	Q	D	E	S	S	Y	Q	V	D	G	.	.	.	.	.	S	T
Template Known Secondary structure										T	T	T		B							S	T	T			T	T	T	S			T	T	T	S					G	G	G	G					T								S				T	T	B						S			B	S	S	S	.	.	.	.	.		B
Template Predicted Secondary structure																																																																											.	.	.	.	.
Template SS confidence
		359	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.						.	.
		504	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.					.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.			.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.																													.	.
Query SS confidence																																			.	.	.	.																													.	.
Query Sequence		P	K	N	S	P	P	Q	Y	A	G	P	I	R	L	R	Q	G	L	G	Q	S	K	N	V	V	M	V	R	A	M	R	A	M	.	.	.	.	G	V	D	Y	A	A	E	Y	L	Q	R	F	G	F	P	A	Q	N	I	V	H	T	E	S	L	A	L	G	.	.	S	A	S	F	T	P	M	Q	V	A	R	G	Y
Query Conservation																																			.	.	.	.																													.	.
Alig confidence																																			.	.	.	.																	.												.	.
Template Conservation																																																							.
Template Sequence		F	R	N	Y	D	T	K	S	H	G	T	V	S	I	Y	D	A	L	R	Q	S	F	N	I	P	A	L	K	A	W	Q	S	V	K	Q	N	A	G	N	D	A	P	K	K	F	A	A	K	L	G	L	N	Y	.	E	G	D	I	G	P	S	E	V	L	G	G	S	A	S	E	F	S	P	T	Q	L	A	S	A	F
Template Known Secondary structure					T	T															T	T																S		T	T									T	T				.	S	S								T	T		T	T
Template Predicted Secondary structure																																																							.
Template SS confidence
		434	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.		.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.
		578	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	V	M	A	N	G	G	F	L	V	D	P	W	F	I	S	K	I	E	N	D	Q	G	G	V	I	F	E	A	K	P	K	V	A	C	P	E	C	D	I	P	V	I	Y	G	D	T	Q	K	S	N	V	L	E	N	N	D	V	E	D	V	A	I	S	R	E	Q	Q	N	V	S	V	P	M	P	Q	L	E	Q	A
Query Conservation
Alig confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	A	I	A	N	G	G	T	Y	N	N	A	H	S	I	Q	K	V	V	T	R	D	G	E	T	I	E	Y	D	H	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					T	T	T	S						B								S	S	S									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		513	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.
		658	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.															720	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	Q	A	L	V	A	K	T	G	A	Q	E	Y	A	P	H	V	I	N	T	P	L	A	F	L	I	K	S	A	L	N	T	N	I	F	G	E	P	G	W	Q	G	T	G	W	R	A	G	R	D	L	Q	R	R	D	I	G	G	K	T	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	N	S	S
Query Conservation																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.							.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.							.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	H	K	A	M	S	D	Y	T	A	Y	M	L	A	E	M	L	K	G	T	F	K	P	Y	.	.	.	.	G	S	A	Y	G	H	.	.	G	V	S	G	V	N	M	G	A	K	T	G	T	G	T	Y	G	A	E	T	Y	S	Q	Y	N	L	P	D	N	A	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					S														T	T	S	S	T	T	.	.	.	.	S	T	T	T	T		.	.	S		S	S														T	T					T	T			T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.							.	.
Template SS confidence
															544	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.					.	.	570	.	.	.			.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.
		724	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.
Predicted Secondary structure																																																																																	.
Query SS confidence																																																																																	.
Query Sequence		K	D	A	W	F	S	G	Y	G	P	G	V	V	T	S	V	W	I	G	F	D	D	H	R	R	N	L	G	H	T	T	A	S	G	A	I	K	D	Q	I	S	G	Y	E	G	G	A	K	S	A	Q	P	A	W	D	A	Y	M	K	A	V	L	E	G	V	P	E	Q	P	L	T	P	P	P	G	I	V	T	V	.
Query Conservation																																																																																	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.																		.
Template Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.
Template Sequence		K	D	V	W	I	N	G	F	T	P	Q	Y	T	M	S	V	W	M	G	F	S	K	V	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	Y	G	E	N	S	F	V	G	H	S	Q	Q	E	Y	P	Q	F	L	Y	E	N	V	M	S	K	I	.	S	S	R	D	G	E	D	F	K	R	P	S	S	V	S	G	S	I
Template Known Secondary structure											S	S										S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	T	T	S								T														.	S			S								T	T					T
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.
Template SS confidence
		605	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.											.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.		.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.
		803	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	I	D	R	S	T	G	Q	L	A	N	G	G	N	S	R	E
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		P	S	I	N	V	S	G	S	Q	D	N	N	T	T	N	R	S
Template Known Secondary structure		T					T	T	B			S	S	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		674	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690