Job Description P02918 Confidence 97.23% Date Thu Jan 5 10:57:34 GMT 2012 Rank 80 Aligned Residues 163 % Identity 17% Template c2pbyB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:glutaminase; PDBTitle: probable glutaminase from geobacillus kaustophilus hta426 Resolution 2.07 Å

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		465	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.		.		480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.
Predicted Secondary structure																.		.
Query SS confidence																.		.
Query Sequence		S	N	I	K	P	F	L	Y	T	A	A	M	D	K	.	G	.	L	T	L	A	S	M	L	N	D	V	P	I	S	R	W	D	A	S	A	G	S	D	W	Q	P	K	N	S	P	P	Q	Y	A	G	P	I	R	L	R	Q	G	L	G	Q	S	K	N	V	V	M	V	R	A	M	R	A	M	G	V	D	Y	A	A
Query Conservation																.		.
Alig confidence																.		.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.
Template Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.
Template Sequence		S	I	S	K	I	I	A	L	A	L	V	L	I	D	R	G	E	D	E	V	F	H	K	V	G	M	E	P	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	P	L	N	P	M	I	N	A	G	A	L	V	V	T	S	M	I	Q	G	G	S	V	S	E	R	L	.	.	E	R	L	L
Template Known Secondary structure		G																						S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S		S	S	S										T				S	S						.	.
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.
Template SS confidence
		65	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120			.	.	.	.
		543	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.							.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	Y	L	Q	R	F	G	F	P	A	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	I	V	H	T	E	S	L	A	L	G	.	.	.	.	.	.	S	A	S	F	T	P	M	Q	V	A	R	G	Y	A	V	M	A	N	G	G	F	L	V
Query Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.																					.	.	.
Template Conservation																																																																															.	.	.
Template Sequence		A	F	V	R	R	L	A	G	N	E	R	I	S	Y	S	D	E	V	A	R	S	E	F	E	T	A	F	L	N	R	S	L	C	Y	F	L	K	Q	H	R	I	I	D	E	D	V	E	E	L	M	E	L	Y	T	K	Q	C	A	I	E	M	T	C	I	D	L	A	R	I	G	L	V	L	A	L	D	G	.	.	.
Template Known Secondary structure									T		T	T			B																									T	T	S			S														T	B																T	T	T	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Template SS confidence
		140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.
		588	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	P	W	F	I	S	K	I	E	N	D	Q	G	G	V	I	F	E	A	K	P	K	V	A	C	P	E	C	D	I	P	V	I	Y	G	D	T	Q	K	S	N	V	L	E	N	N	D	V	E	D	V	A	I	S	R	E	Q	Q	N	V	S	V	P	M	P	Q	L	E	Q	A	N	Q	A	L	V	A	K	T	G	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																																217	.
		668	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	E	Y	A	P	H	V	I	N	T	P	L	A	F	L	I	K	S	A	L	N	T	N	I	F	G	E	P	G	W	Q	G	T	G	W	R	A	G	R	D	L	Q	R	R	D	I	G	G	K	T	G	T	T	N	S	S	K	D	A	W	F	S	G	Y	G	P	G	V	V	T	S	V	W
Query Conservation
Alig confidence																								.	.	.	.															.	.				.	.									.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.															.	.				.	.									.	.	.	.
Template Sequence		P	H	S	S	E	P	L	M	P	L	D	V	A	R	I	C	K	T	F	M	V	T	.	.	.	.	C	G	M	Y	N	S	S	G	E	F	A	I	K	V	.	.	G	I	P	.	.	A	K	S	G	V	S	G	G	.	.	.	.	I	L	A	A	V	P	G	R	C	G	I	G	V	F
Template Known Secondary structure		T	T	T			B	S	S															.	.	.	.	S	T	T	G	G	G								T	.	.		S		.	.					T	T	S		.	.	.	.						T	T	T
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.															.	.				.	.									.	.	.	.
Template SS confidence
		219	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240					.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.			.	.	.			.	.	260	.	.	.	.	.					.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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