Job Description P0A6R0 Confidence 99.80% Date Thu Jan 5 11:03:43 GMT 2012 Rank 85 Aligned Residues 310 % Identity 19% Template c2uv9B_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:fatty acid synthase alpha subunits; PDBTitle: crystal structure of fatty acid synthase from thermomyces2 lanuginosus at 3.1 angstrom resolution. this file contains3 the alpha subunits of the fatty acid synthase. the entire4 crystal structure consists of one heterododecameric fatty5 acid synthase and is described in remark 400 Resolution 3.1 Å

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		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	I	G	T	G	S	Y	L	P	E	Q	V	R	T	N	A	D	L	E	K	M	V	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	D	E	W	I	V	T	R	T	G	I	R	E	R
Query Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template Conservation																																																																																	.
Template Sequence		E	V	V	I	E	Q	D	L	E	P	F	E	A	S	K	E	Q	A	E	E	F	K	R	E	H	G	D	K	V	E	I	F	E	I	P	E	T	G	Q	Y	T	V	R	L	R	K	G	A	T	L	L	I	P	K	A	L	Q	F	D	R	L	V	A	G	Q	I	P	T	G	W	D	A	R	R	Y	G	V	P	E	.
Template Known Secondary structure							S																				G	G	G							T	T	T	S								T	T												S									T	T							T				.
Template Predicted Secondary structure																																																																																	.
Template SS confidence
		1099	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.
		43	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.											70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.																								.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	I	A	A	P	N	E	T	V	S	T	M	G	F	E	A	A	T	R	A	I	E	M	A	G	I	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	D	Q	I	G	L	I	V	V	A	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	A	T	H	A	F	P	S
Query Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	I	I	Q	Q	V	D	P	V	T	L	Y	V	L	V	S	V	A	E	A	L	L	S	S	G	I	T	D	P	Y	E	F	Y	K	Y	V	H	L	S	E	V	G	N	C	I	G	S	G	V	G	G	T	S	A	L	R	G	M	Y	K	D	R	Y	L	D	K	P	V	Q	K	D	I	L	Q	E	S	F	V	N	T
Template Known Secondary structure							S																	T	T	T		S	S	G	G	G					S		G	G	G								S	S											T	T	T	T	T	T					S		T	T	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1178	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.
		90	.	.	.	.	.		.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Predicted Secondary structure								.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	A	C	Q	I	Q	.	S	M	L	G	I	K	G	C	P	A	F	D	V	A	A	A	C	A	G	F	T	Y	A	L	S	V	A	D	Q	Y	V	K	S	G	A	V	K	Y	A	L	V	V	G	S	D	V	L	A	R	T	C	D	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T
Query Conservation								.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.								.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.
Template Sequence		M	A	A	W	V	N	M	L	L	L	S	S	T	G	.	P	I	K	T	P	V	G	A	C	A	T	A	V	E	S	L	D	V	G	Y	D	T	I	M	Q	G	K	A	R	V	C	L	V	G	G	F	D	D	F	Q	E	E	G	S	Y	E	F	A	N	M	G	A	T	S	N	A	K	E	E	F	A	R	G	R	E
Template Known Secondary structure										T						.		B						G	G	G														T	T	T	S		S																						T		B								T	T	T
Template Predicted Secondary structure																.
Template SS confidence
		1258	.	1260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1270	.		.	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1330	.	.	.	.	.	.
		150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	R	G	T	I	I	I	F	G	D	G	A	G	A	A	V	L	A	A	S	E	E	P	G	I	I	S	T	H	L	H	A	D	G	S	Y	G	E	L	L	T	L	P	N	A	D	R	V	N	P	E	N	S	I	H	L	T	M	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	G	E	M	S	R	P	T	S	T	T	R	N	G	F	M	E	S	Q	G	C	G	V	Q	V	I	M	T	A	Q	L	A	L	E	M	G	V	P	I	Y	G	I	V	A	M	T	S	T	A	T	D	K	I	G	R	S	V	P	A	P	G	Q	G	V	L	T	T	A	R	E	K	S	G	N	F	P	S	P	L	L
Template Known Secondary structure		T	T	S	S			S	S	B	T	T				B		B	B																		T																	S		S		S	S				S		G	G	G	G	G						S	S			G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1337	.	.	1340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1410	.	.	.	.	.	.
																																											210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	E	V	F	K	V	A	V	T	E	L	A	H	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	I	K	Y	R	R	R	Q	L	E	L	R	R	Q	Q	I	K	Q	W	K	E	S	E	Y	L	Y	L	Q	E	E	V	A	A	I	K	S	Q	R	S	E	E	D	G	P	F	D	E	T	A	Y	L	R	E	R	T	E	H	I	E	R	E	A	R	R	Q	E	A	E	A	Q	T	S	F	G	N	E	F	W	R	R
Template Known Secondary structure		S																																	T	T	S	S			S	S	S																																	T	S	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1417	.	.	1420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1490	.	.	.	.	.	.
								224	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.									.	.	.	.	260	.	.	.	.				.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	V	D	E	T	L	A	A	N	N	L	D	R	S	Q	L	D	W	L	V	P	H	Q	A	N	L	R	I	I	S	A	T	A	.	.	.	.	.	.	.	.	K	K	L	G	M	S	M	D	N	.	.	.	V	V	V	T	L	D	R	H	G	N	T	S	A	A	S	V	P	C	A	L	D	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	S	R	I	A	P	L	R	G	A	L	A	T	W	G	L	T	I	D	D	L	G	V	A	S	F	H	G	T	S	T	V	A	N	D	K	N	E	S	D	V	I	C	Q	Q	L	K	H	L	G	R	T	K	G	N	A	V	L	G	I	F	Q	K	Y	L	T	G	H	P	K	G	A	A	G	A	W	M	L	N	G
Template Known Secondary structure			T	T	S									T	T	T			G	G	G										S																				T			T	T								T						B		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1497	.	.	1500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1570	.	.	.	.	.	.
		287	.	.																																290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	V	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	R	I	K	P	G	Q	L	V	L	L	E	A	F	G	G	G	F	T	W	G	S	A	L	V	R
Query Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		C	L	Q	V	L	N	T	G	I	V	P	G	N	R	N	A	D	N	V	D	K	V	M	E	Q	F	D	Y	I	V	Y	P	S	R	S	I	K	T	D	G	I	K	A	F	S	V	T	S	F	G	F	G	Q	K	G	A	Q	A	I	G	V
Template Known Secondary structure							T	T							T	T			S	B		G	G	G	G	G		T	T					S	S					S												T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1577	.	.	1580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1630	.	.	.	.	.	.	.