Job Description P0A6R0 Confidence 99.77% Date Thu Jan 5 11:03:43 GMT 2012 Rank 86 Aligned Residues 310 % Identity 18% Template c2uv8C_ PDB info PDB header:transferase Chain: C: PDB Molecule:fatty acid synthase subunit alpha (fas2); PDBTitle: crystal structure of yeast fatty acid synthase with stalled2 acyl carrier protein at 3.1 angstrom resolution Resolution 3.10 Å

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		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	I	G	T	G	S	Y	L	P	E	Q	V	R	T	N	A	D	L	E	K	M	V	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	D	E	W	I	V	T	R	T	G	I	R	E	R
Query Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template Conservation																																																																																	.
Template Sequence		E	V	I	V	E	E	D	L	E	P	F	E	A	S	K	E	T	A	E	Q	F	K	H	Q	H	G	D	K	V	D	I	F	E	I	P	E	T	G	E	Y	S	V	K	L	L	K	G	A	T	L	Y	I	P	K	A	L	R	F	D	R	L	V	A	G	Q	I	P	T	G	W	N	A	K	T	Y	G	I	S	D	.
Template Known Secondary structure						S	S																				G	G	G							T	T	T	S								T	T												S									T	T			T	T	T	T	T				.
Template Predicted Secondary structure																																																																																	.
Template SS confidence
		1124	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200	.	.
		43	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.		.	70	.	.	.									.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.						.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																												.						.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	I	A	A	P	N	E	T	V	S	T	M	G	F	E	A	A	T	R	A	I	E	M	A	G	I	.	E	K	D	Q	I	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	I	V	V	A	T	T	S	A	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	A	F	P	S
Query Conservation																												.						.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																												.						.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	I	I	S	Q	V	D	P	I	T	L	F	V	L	V	S	V	V	E	A	F	I	A	S	G	I	T	D	P	Y	E	M	Y	K	Y	V	H	V	S	E	V	G	N	C	S	G	S	G	M	G	G	V	S	A	L	R	G	M	F	K	D	R	F	K	D	E	P	V	Q	N	D	I	L	Q	E	S	F	I	N	T
Template Known Secondary structure							S																		T	T			S	G	G	G					S		G	G	G								S	S											T	T	T	T	T	T					T	T						S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1203	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.
		90	.	.	.	.	.		.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Predicted Secondary structure								.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	A	C	Q	I	Q	.	S	M	L	G	I	K	G	C	P	A	F	D	V	A	A	A	C	A	G	F	T	Y	A	L	S	V	A	D	Q	Y	V	K	S	G	A	V	K	Y	A	L	V	V	G	S	D	V	L	A	R	T	C	D	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T
Query Conservation								.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.								.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.
Template Sequence		M	S	A	W	V	N	M	L	L	I	S	S	S	G	.	P	I	K	T	P	V	G	A	C	A	T	S	V	E	S	V	D	I	G	V	E	T	I	L	S	G	K	A	R	I	C	I	V	G	G	Y	D	D	F	Q	E	E	G	S	F	E	F	G	N	M	K	A	T	S	N	T	L	E	E	F	E	H	G	R	T
Template Known Secondary structure										T	T				S	.								G	G	G															T	T	S		S																					T	T		B									T	T
Template Predicted Secondary structure																.
Template SS confidence
		1283	.	.	.	.	.	.	1290	.	.	.	.	.	.		.	.	.	1300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1360	.
		150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	R	G	T	I	I	I	F	G	D	G	A	G	A	A	V	L	A	A	S	E	E	P	G	I	I	S	T	H	L	H	A	D	G	S	Y	G	E	L	L	T	L	P	N	A	D	R	V	N	P	E	N	S	I	H	L	T	M	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	A	E	M	S	R	P	A	T	T	T	R	N	G	F	M	E	A	Q	G	A	G	I	Q	I	I	M	Q	A	D	L	A	L	K	M	G	V	P	I	Y	G	I	V	A	M	A	A	T	A	T	D	K	I	G	R	S	V	P	A	P	G	K	G	I	L	T	T	A	R	E	H	H	S	S	V	K	Y	A	S	P
Template Known Secondary structure		G	G	G	S			T	T	B	T	T			S	B		B	B																		T																	S		S		T	T				S	G	G	G	G	G	G					S			S	S			G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1362	.	.	.	.	.	.	.	1370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1440	.
																																																			210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	E	V	F	K	V	A	V	T	E	L	A	H	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	L	N	M	K	Y	R	K	R	Q	L	V	T	R	E	A	Q	I	K	D	W	V	E	N	E	L	E	A	L	K	L	E	A	E	E	I	P	S	E	D	Q	N	E	F	L	L	E	R	T	R	E	I	H	N	E	A	E	S	Q	L	R	A	A	Q	Q	Q	W	G	N	D	F	Y	K	R	D	P	R	I	A	P
Template Known Secondary structure		G	G																																T	T	S			S																													T	T	S	T	T	T	T		S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1442	.	.	.	.	.	.	.	1450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1520	.
		224	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.									.	.	.	.	.	260	.	.	.	.				.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.																										.	.	.
Query SS confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.																										.	.	.
Query Sequence		V	D	E	T	L	A	A	N	N	L	D	R	S	Q	L	D	W	L	V	P	H	Q	A	N	L	R	I	I	S	A	T	.	.	.	.	.	.	.	.	A	K	K	L	G	M	S	M	D	N	.	.	.	V	V	V	T	L	D	R	H	G	N	T	S	A	A	S	V	P	C	A	L	D	E	A	V	R	.	.	.
Query Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.																										.	.	.
Alig confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.																										.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	R	G	A	L	A	T	Y	G	L	T	I	D	D	L	G	V	A	S	F	H	G	T	S	T	K	A	N	D	K	N	E	S	A	T	I	N	E	M	M	K	H	L	G	R	S	E	G	N	P	V	I	G	V	F	Q	K	F	L	T	G	H	P	K	G	A	A	G	A	W	M	M	N	G	A	L	Q	I	L	N
Template Known Secondary structure								T	T	T			G	G	G										S																				T			T	T								T						B		G	G	G														T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1522	.	.	.	.	.	.	.	1530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1600	.
																														290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	R	I	K	P	G	Q	L	V	L	L	E	A	F	G	G	G	F	T	W	G	S	A	L	V	R
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	G	I	I	P	G	N	R	N	A	D	N	V	D	K	I	L	E	Q	F	E	Y	V	L	Y	P	S	K	T	L	K	T	D	G	V	R	A	V	S	I	T	S	F	G	F	G	Q	K	G	G	Q	A	I	V	V
Template Known Secondary structure		T							T	T		S	S	B		G	G	G	G	G		T	T					S	S					S												T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1602	.	.	.	.	.	.	.	1610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1650	.	.	.	.	.	.