Job Description P32132 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:49:17 GMT 2012 Rank 3 Aligned Residues 465 % Identity 30% Template c3b8hA_ PDB info PDB header:biosynthetic protein/transferase Chain: A: PDB Molecule:elongation factor 2; PDBTitle: structure of the eef2-exoa(e546a)-nad+ complex Resolution 2.50 Å

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.		40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure																																							.
Query SS confidence																																							.
Query Sequence		E	K	L	R	N	I	A	I	I	A	H	V	D	H	G	K	T	T	L	V	D	K	L	L	Q	Q	S	G	T	F	D	S	R	A	E	T	Q	.	E	R	V	M	D	S	N	D	L	E	K	E	R	G	I	T	I	L	A	K	N	T	A	I	K	W	N	D	Y	R	I	N	I	V	D	T	P	G	H	A	D	F
Query Conservation																																							.
Alig confidence																																							.																					.	.	.
Template Conservation																																																												.	.	.
Template Sequence		T	N	V	R	N	M	S	V	I	A	H	V	D	H	G	K	S	T	L	T	D	S	L	V	Q	R	A	G	I	I	S	A	G	I	T	I	K	S	T	A	I	S	L	Y	S	E	M	S	D	E	D	V	K	E	I	K	Q	K	.	.	.	T	D	G	N	S	F	L	I	N	L	I	D	S	P	G	H	V	D	F
Template Known Secondary structure		G	G										G	G	G	T													B								B																				S	S		.	.	.			S	S											S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																												.	.	.
Template SS confidence
		17	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.				.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.
Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	G	E	V	E	R	V	M	S	M	V	D	S	V	L	L	V	V	D	A	F	D	G	P	M	P	Q	T	R	F	V	T	K	K	A	F	A	Y	G	L	K	P	I	V	V	I	N	K	V	D	R	P	G	A	R	P	D	W	V	V	D	Q	V	F	D	L	F	V	N	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	S	E	V	T	A	A	L	R	V	T	D	G	A	L	V	V	V	D	T	I	E	G	V	C	V	Q	T	E	T	V	L	R	Q	A	L	G	E	R	I	K	P	V	V	V	I	N	K	V	D	R	A	L	L	E	L	Q	V	S	K	E	D	L	Y	Q	T	F	A	R	T	V	E	S	V	N	V	I	V	S	T
Template Known Secondary structure											T		S								T	T	T	B	S														T	T																T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		112	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.
									152	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	D	A	T	D	E	Q	L	D	F	P	I	V	Y	A	S	A	L	N	G	I	A	G	L	D	H	E	D	M	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	A	D	E	V	L	G	D	V	Q	V	Y	P	A	R	G	T	V	A	F	G	S	G	L	H	G	W	A	F	T	I	R	Q	F	A	T	R	Y	A	K	K	F	G	V	D	K	A	K	M	M	D	R	L	W	G	D	S	F	F	N	P	K	T	K	K	W	T	N	K	D	T	D	A	E	G	K	P	L	E	R
Template Known Secondary structure			S		G	G	G							G	G	G	T							T	T	T	T													T	T	T	T	T										S	S	S	S					T	T	T	T				S		S	B		T	T	S		B			B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		192	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.
																																																												182	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	M	T	P	L	Y	Q	A	I	V	D	H	V	P	A	P	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	F	N	M	F	I	L	D	P	I	F	R	L	F	T	A	I	M	N	F	K	K	D	E	I	P	V	L	L	E	K	L	E	I	V	L	K	G	D	E	K	D	L	E	G	K	A	L	L	K	V	V	M	R	K	F	L	P	A	A	D	A	L	L	E	M	I	V	L	H	L	P	S	P	V	T	A	Q	A	Y
Template Known Secondary structure							T													T	T		T	T									T	T					G	G	G	G	G															S	B													S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		272	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.
																					198	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220		.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.							.	.	.	.	.	.	250	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.																								.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.																								.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	V	D	L	D	G	P	F	Q	M	Q	I	S	Q	L	D	Y	N	S	Y	V	G	V	.	I	G	I	G	R	I	K	R	G	K	V	K	P	N	Q	Q	V	T	I	I	D	S	E	.	.	.	.	.	.	G	K	T	R	N	A	K	V
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.																								.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.																								.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	A	E	Q	L	Y	E	G	P	A	D	D	A	N	C	I	A	I	K	N	C	D	P	K	A	D	L	M	L	Y	V	S	K	M	V	P	T	S	D	K	G	R	F	Y	A	F	G	R	V	F	A	G	T	V	K	S	G	Q	K	V	R	I	Q	G	P	N	Y	V	P	G	K	K	D	D	L	F	I	K	A	I
Template Known Secondary structure							B	S	S		T	T	S								T	T		S	S	S	S											B	S	S	T	T											S				T	T								T	T			S	S	S		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		352	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.
		252	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.		.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.		.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.																				.
Query SS confidence																																			.																				.
Query Sequence		G	K	V	L	G	H	L	G	L	E	R	I	E	T	D	L	A	E	A	G	D	I	V	A	I	T	G	L	G	E	L	N	I	.	S	D	T	V	C	D	T	Q	N	V	E	A	L	P	A	L	S	V	D	.	E	P	T	V	S	M	F	F	C	V	N	T	S	P	F	C	G	K	E	G	K	F	V	T	S	R
Query Conservation																																			.																				.
Alig confidence																																			.																				.													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	R	V	V	L	M	M	G	R	F	V	E	P	I	D	D	C	P	A	G	N	I	I	G	L	V	G	I	D	Q	F	L	L	K	T	G	T	L	T	T	S	E	T	A	H	N	M	K	V	M	K	F	S	V	S	P	V	V	Q	V	A	V	E	V	K	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	N	D	L	P
Template Known Secondary structure		S							T	T						S				T	T							S		T	T	T		S	S						S		T	T				B	S																	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		432	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.										.	.	500	.	.
		330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.			.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.
Predicted Secondary structure																																																	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	I	L	D	R	L	N	K	E	L	V	H	N	V	A	L	R	V	E	E	T	E	D	A	D	A	F	R	V	S	G	R	G	E	L	H	L	S	V	L	I	E	N	M	R	R	E	.	.	G	F	E	L	A	V	S	R	P	K	V	I	F	R	E	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.																										.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.
Template Sequence		K	L	V	E	G	L	K	R	L	S	K	S	D	P	C	V	L	T	Y	M	S	.	E	S	G	E	H	I	V	A	G	T	G	E	L	H	L	E	I	C	L	Q	D	L	E	H	D	H	A	G	V	P	L	K	I	S	P	P	V	V	A	Y	R	E	T	V	E	S	E	S	S	Q	T	A	L	S	K	S	P	N
Template Known Secondary structure															T	T							.	T	T								S	S														T	T	S		S																S	S			S	S							T	T
Template Predicted Secondary structure																							.
Template SS confidence
		503	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.		.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	H	N	R	I	Y	L	K	A	E	P	I	D	E	E	V	S	L	A	I	E	N	G	I	I	N	P	R	D	D	F	K	A	R	A	R	I	M	A	D	D	Y	G	W	D	V	T	D	A	R	K	I	W	C	F	G	P	D	G	N	G	P	N	L	V	I	D	Q	T	K	A	V	Q	Y	L	H	E	I	K	D
Template Known Secondary structure		S																					T	T	S	S		T	T	S																					T	T						S	T	T	T	S	S								S	S		T	T	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		582	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.
																																																												393	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	R	K	Q	E	P	Y	E	N	V	T	L	D	V	E	E	Q	H	Q	G	S
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	V	V	A	A	F	Q	W	A	T	K	E	G	P	I	F	G	E	E	M	R	S	V	R	V	N	I	L	D	V	T	L	H	A	D	A	I	R	G	G	G	Q	I	I	P	T	M	R	R	A	T	Y	A	G	F	L	L	A	D	P	K	I	Q	E	P	V	F	L	V	E	I	Q	C	P	E	Q	A	V	G	G
Template Known Secondary structure													S		T	T	T	S					S												S	S																							S																	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		662	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.
		415	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.		.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Predicted Secondary structure																						.
Query SS confidence																						.
Query Sequence		V	M	Q	A	L	G	E	R	K	G	D	L	K	N	M	N	P	D	G	K	.	G	R	V	R	L	D	Y	V	I	P	S	R	G	L	I	G	F	R	S	E	F	M	T	M	T	S	G	T	G	L	L	Y	S	T	F	S	H	Y	D	D	V	R	P	G	E	V
Query Conservation																						.
Alig confidence																						.
Template Conservation
Template Sequence		I	Y	S	V	L	N	K	K	R	G	Q	V	V	S	E	E	Q	R	P	G	T	P	L	F	T	V	K	A	Y	L	P	V	N	E	S	F	G	F	T	G	E	L	R	Q	A	T	G	G	Q	A	F	P	Q	M	V	F	D	H	W	S	T	L	G	S	D	P	L
Template Known Secondary structure							T	T	T	T										S	S	S	S										G	G	G		T	T									T	T	T			B												S	S		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		743	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.