Job Description P65807 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:10:18 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 385 % Identity 20% Template c2zogA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:cytosolic non-specific dipeptidase; PDBTitle: crystal structure of mouse carnosinase cn2 complexed with zn and2 bestatin Resolution 1.70 Å

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		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.							.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60														.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																		.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	F	K	L	I	L	E	K	A	K	D	Y	Q	A	D	M	T	R	F	L	R	D	M	V	A	I	P	S	E	S	C	D	.	.	.	.	.	.	E	K	R	V	V	H	R	I	K	E	E	M	E	K	V	G	F	D	K	V	E	I	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	M	G	N	V	L
Query Conservation																																		.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																		.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	L	K	A	V	F	Q	Y	I	D	E	N	Q	D	R	Y	V	K	K	L	A	E	W	V	A	I	Q	S	V	S	A	W	P	E	K	R	G	E	I	R	R	M	M	E	V	A	A	A	D	V	Q	R	L	G	G	S	V	E	L	V	D	I	G	K	Q	K	L	P	D	G	S	E	I	P	L	P	P	I	L	L
Template Known Secondary structure													T														S			B	T	T		G	G	G																		T	T														T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
		67	.	.	70	.	.	.			.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.
Query SS confidence									.	.
Query Sequence		G	Y	I	G	H	G	P	.	.	R	L	V	A	M	D	A	H	I	D	T	V	G	I	G	N	I	K	N	W	D	F	D	P	Y	E	G	M	E	T	D	E	L	I	G	G	R	G	T	S	D	Q	E	G	G	M	A	S	M	V	Y	A	G	K	I	I	K	D	L	G	L	E	D	E	Y	T	L	L	V	T	G
Query Conservation									.	.
Alig confidence									.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	K	L	G	S	D	P	Q	K	K	T	V	C	I	Y	G	H	L	D	V	Q	P	A	A	L	E	D	G	W	D	S	E	P	F	T	L	V	E	R	E	G	K	L	Y	G	R	G	S	T	D	D	K	G	P	V	A	G	W	M	N	A	L	E	A	Y	Q	K	T	G	Q	E	I	P	V	N	L	R	F	C	L
Template Known Secondary structure								T	T	S											B					G	G	G	T		S	S		T	T	S					T	T				S	T	T	T	T	T	T																	T	T				S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
		145	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.				.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.						.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200				.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.																		.	.	.	.	.																							.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.																		.	.	.	.	.																							.	.	.
Query Sequence		T	V	Q	E	E	D	C	D	G	L	C	W	Q	Y	I	I	E	.	.	.	Q	S	G	I	R	P	E	F	V	V	S	T	E	P	T	D	C	.	.	.	.	.	Q	V	Y	R	G	Q	R	G	R	M	E	I	R	I	D	V	Q	G	V	S	C	H	.	.	.	G	S	A	P	E	R	G	D	N	A	I	F	K
Query Conservation																			.	.	.																		.	.	.	.	.																							.	.	.
Alig confidence																			.	.	.																		.	.	.	.	.																							.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	G	M	E	E	S	G	S	E	G	L	D	E	L	I	F	A	Q	K	D	K	F	F	K	D	V	D	Y	V	C	I	S	D	N	Y	W	L	G	K	N	K	P	C	I	T	Y	G	L	R	G	I	C	Y	F	F	I	E	V	E	C	S	D	K	D	L	H	S	G	V	Y	G	G	S	V	H	E	A	M	T	D
Template Known Secondary structure			S		G	G	G	T		T	T								T	T	T	T	T	T	T	T										B		S	S	S	S	S																					S	S								T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.
		214	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.																																															.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	G	P	I	L	G	E	L	Q	E	L	S	Q	R	L	G	Y	D	E	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	G	K	G	T	L	T	V	S	E	I	F	F	T
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	I	S	L	M	G	C	L	V	D	K	K	G	K	I	L	I	P	G	I	N	D	A	V	A	P	V	T	D	E	E	H	A	L	Y	D	H	I	D	F	D	M	E	E	F	A	K	D	V	G	A	E	T	L	L	H	S	C	K	K	D	I	L	M	H	R	W	R	Y	P	S	L	S	L	H	G	I	E	G	A
Template Known Secondary structure							T	T	S	B		T	T	S		B		S	T	T	T	T	T	T	S											T	S	S													T		S	S		S		S	S										T	S										S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
		248				.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.
Query SS confidence			.	.	.
Query Sequence		S	.	.	.	P	S	R	C	A	V	A	D	S	C	A	V	S	I	D	R	R	L	T	W	G	E	T	W	E	G	A	L	D	E	I	R	A	L	P	A	V	Q	K	A	N	A	V	V	S	M	Y	N	Y	D	R	P	S	W	T	G	L	V	Y	P	T	E	C	Y	F	P	T	W	K	V	E	E	D	H	F	T
Query Conservation			.	.	.
Alig confidence			.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	S	G	S	G	A	K	T	V	I	P	R	K	V	V	G	K	F	S	I	R	L	V	P	D	M	I	P	E	V	V	S	E	Q	V	S	S	Y	L	S	K	K	F	A	E	L	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	P	N	K	F	K	V	Y	M	G	H	G	G	K	P	W	V	S	D	F	N	H	P	H
Template Known Secondary structure				S	S	S							S												T	T																				T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.			S																	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.										370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.
		325	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.		350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370		.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.																						.
Query SS confidence																											.																						.
Query Sequence		V	K	A	L	V	N	A	Y	E	G	L	F	G	K	A	P	V	V	D	K	W	T	F	S	T	.	N	G	V	S	I	M	G	R	H	G	I	P	V	I	G	F	G	P	G	K	E	.	P	E	A	H	A	P	N	E	K	T	W	K	S	H	L	V	T	C	A	A	M	Y	A	A	I	P	L	S	W
Query Conservation																											.																						.
Alig confidence																											.																						.
Template Conservation
Template Sequence		Y	Q	A	G	R	R	A	L	K	T	V	F	G	V	E	P	D	L	T	R	E	G	G	S	I	P	V	T	L	T	F	Q	E	A	T	G	K	N	V	M	L	L	P	V	G	S	A	D	D	G	A	H	S	Q	N	E	K	L	N	R	L	N	Y	I	E	G	T	K	M	L	A	A	Y	L	Y	E	V
Template Known Secondary structure														S	S								S	S			T											S								B		T	T			T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		394	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470