Job Description P65807 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:10:18 GMT 2012 Rank 24 Aligned Residues 345 % Identity 16% Template c2v8gD_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: D: PDB Molecule:beta-alanine synthase; PDBTitle: crystal structure of beta-alanine synthase from2 saccharomyces kluyveri in complex with the product beta-3 alanine Resolution 2.5 Å

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		15	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.															.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.			.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.
Query Sequence		K	D	Y	Q	A	D	M	T	R	F	L	R	D	M	V	A	I	P	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	S	C	D	E	K	R	V	V	H	R	I	K	E	E	M	E	K	V	G	F	D	K	V	E	I	D	P	M	G	N	V	L	G	Y	I	G	H	G	P	.	.	R	L	V	A	M
Query Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.															.	.
Template Conservation																																																												.
Template Sequence		G	R	L	N	Q	T	I	L	E	T	G	S	Q	F	G	G	V	A	R	W	G	Q	E	S	H	E	F	G	M	R	R	L	A	G	T	A	L	D	G	A	M	R	D	W	F	T	N	E	C	E	S	L	G	C	K	V	K	V	.	D	K	I	G	N	M	F	A	V	Y	P	G	K	N	G	G	K	P	T	A	T
Template Known Secondary structure		T													T	T						S	S	S	T	T								T	T	S																T	T	T						.	B	T	T	S									T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure																																																												.
Template SS confidence
		33	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90		.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	A	H	I	D	T	V	G	I	G	N	I	K	N	W	D	F	D	P	Y	E	G	M	E	T	D	E	L	I	G	G	R	G	T	S	D	Q	E	G	G	M	A	S	M	V	Y	A	G	K	I	I	K	D	L	G	L	E	D	E	Y	T	L	L	V	T	G	T	V	Q	E	E	D	C	D	G	L	C	W	Q	Y
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	S	H	L	D	T	Q	P	E	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	K	Y	D	G	I	L	G	V	L	A	G	L	E	V	L	R	T	F	K	D	N	N	Y	V	P	N	Y	D	V	C	V	V	V	W	F	N	E	E	G	A	R	F	A	R	S	C	T
Template Known Secondary structure									S	S	B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S	T	T																	T	T				S	S								S			S		S	S	S	S		T	T
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		112	.	.	.	.	.	.	.	120	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		159	160	.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	I	E	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	I	R	P	E	F	V	V	S	T	E	P	T	D	C	Q	V	Y	R	G	Q	R	G	R
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	S	S	V	W	S	H	D	L	S	L	E	E	A	Y	G	L	M	S	V	G	E	D	K	P	E	S	V	Y	D	S	L	K	N	I	G	Y	I	G	D	T	P	A	S	Y	K	E	N	E	I	D	A	H	F	E	L	H	I	E	Q	G	P	I	L	E	D	E	N	K	A	I	G	I	V	T	G	V	Q	A	Y
Template Known Secondary structure							T	T	S	S							T		B		S	S		S	S			B								T	T				S	B		S	S	T	T	T	S			S										S	S					T	T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		188	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.			.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.
Query SS confidence																			.	.
Query Sequence		M	E	I	R	I	D	V	Q	G	V	S	C	H	G	S	A	P	.	.	E	R	G	D	N	A	I	F	K	M	G	P	I	L	G	E	L	Q	E	L	S	Q	R	L	G	Y	D	E	F	L	G	K	G	T	L	T	V	S	E	I	F	F	T	S	P	S	R	C	A	V	A	D	S	C	A	V	S	I	D	R	R
Query Conservation																			.	.
Alig confidence																			.	.																									.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																													.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	W	Q	K	V	T	V	H	G	V	G	A	H	A	G	T	T	P	W	R	L	R	K	D	A	L	L	M	S	S	K	M	I	V	A	A	S	E	I	A	Q	R	H	.	.	.	.	.	.	.	N	G	L	F	T	C	G	I	I	D	A	K	P	Y	S	V	N	I	I	P	G	E	V	S	F	T	L	D	F	R
Template Known Secondary structure															T	T	T			G	G	G																						T	.	.	.	.	.	.	.	T												S			T	T				S
Template Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.								.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
		266	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	T	W	G	E	T	W	E	G	A	L	D	E	I	R	A	L	P	A	V	Q	K	A	N	A	V	V	S	M	Y	N	Y	D	R	P	S	W	T	G	L	V	Y	P	T	E	C	Y	F	P	T	W	K	V	E	E	D	H	F	T	V	K	A	L	V	N	A	Y	E	G	L	F	G	K	A	P	V	V	D	K	W
Query Conservation
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	P	S	D	D	V	L	A	T	M	L	K	E	A	A	A	E	F	D	R	L	I	K	I	N	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	A	L	S	Y	E	S	E	T	L	Q	V	S	P	A	V	N	F	H	E	V	C	I	E	C	V	S	R	S	A	F	A	Q	F	K	K	D	Q	V	R	Q	I	W
Template Known Secondary structure			S	S																			T	T			T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T																																		S		G	G	G
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.											.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.
		346	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	F	S	T	N	G	V	S	I	M	G	R	H	G	I	P	V	I	G	F	G	P	G	K	E	P	E	A	H	A	P	N	E	K	T	W	K	S	H	L	V	T	C	A	A	M	Y	A	A	I	P	L	S	W
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		S	G	A	G	H	D	S	C	Q	T	A	P	H	V	P	T	S	M	I	F	I	P	S	K	D	G	L	S	H	N	Y	Y	E	Y	S	S	P	E	E	I	E	N	G	F	K	V	L	L	Q	A	I	I	N	Y
Template Known Secondary structure			S	S			T					T	T	T	S										G	G	G			S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		393	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.