Job Description P65807 Confidence 99.16% Date Thu Jan 5 12:10:18 GMT 2012 Rank 68 Aligned Residues 340 % Identity 15% Template c2glfB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:probable m18-family aminopeptidase 1; PDBTitle: crystal structure of aminipeptidase (m18 family) from thermotoga2 maritima Resolution 2.80 Å

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		18	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.														.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.				.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.
Query SS confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.
Query Sequence		Q	A	D	M	T	R	F	L	R	D	M	V	A	I	P	S	E	S	C	D	E	K	R	V	V	H	R	I	K	E	E	M	E	K	V	G	F	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	V	E	I	D	P	M	G	N	V	L	G	Y	I	G	H	G	P	.	.	.	R	L	V	A	M	D	A	H
Query Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.
Alig confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	E	E	I	E	A	F	S	K	E	Y	X	E	F	X	S	K	A	K	T	E	R	X	T	V	K	E	I	K	R	I	L	D	E	S	G	F	V	P	L	E	D	F	A	G	D	P	X	N	X	T	V	Y	A	V	N	R	G	K	A	I	A	A	F	R	V	V	D	D	L	K	R	G	L	N	L	V	V	A	H
Template Known Secondary structure																	T	T		S	S															T	T				G	G	G			S		T	T	S							S	S	S	S									S		G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		15	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.
		82	.	.	.	.	.	.	.	90				.	.	.	.	.	.	.			.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.								.	.
Query SS confidence											.	.	.								.	.
Query Sequence		I	D	T	V	G	I	G	N	I	.	.	.	K	N	W	D	F	D	P	.	.	Y	E	G	M	E	T	D	E	L	I	G	G	R	G	T	S	D	Q	E	G	G	M	A	S	M	V	Y	A	G	K	I	I	K	D	L	G	L	E	D	E	Y	T	L	L	V	T	G	T	V	Q	E	E	D	C	D	G	L	C	W
Query Conservation											.	.	.								.	.
Alig confidence											.	.	.								.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	D	S	P	R	L	D	F	K	P	N	P	L	I	E	D	E	Q	I	A	L	F	K	T	H	Y	Y	G	G	I	K	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	H	W	L	S	I	P	L	E	I	H	G	V	L	F	K	N	D	G	T	E	I	E	I
Template Known Secondary structure																	S	S	S										S	S			G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	T	T	S											T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		95	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150
		157	.	.	160	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	Y	I	I	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	S	G	I	R	P	E	F	V	V	S	T	E	P	T	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	Q	V	Y	R	G	Q	R	G	R	M	E	I	R	I	D
Query Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	I	G	D	K	P	E	D	P	V	F	T	I	P	D	L	L	P	H	L	D	K	E	D	A	K	I	S	E	K	F	K	G	E	N	L	X	L	I	A	G	T	I	P	L	S	G	E	E	K	E	A	V	K	T	N	V	L	K	I	L	N	E	X	Y	G	I	T	E	E	D	F	V	S	G	E	I	E	V	V
Template Known Secondary structure				S	S	S	T	T	S			B							T	T	T							T	T	S	S	S		G	G	G											T	T		S	S																			G	G	G	G	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		151	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230
		194	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.			.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.
Predicted Secondary structure																	.	.
Query SS confidence																	.	.
Query Sequence		V	Q	G	V	S	C	H	G	S	A	P	E	R	G	D	.	.	N	A	I	F	K	M	G	P	I	L	G	E	L	Q	E	L	S	Q	R	L	G	Y	D	E	F	L	G	K	G	T	L	T	V	S	E	I	F	F	T	S	P	S	R	C	A	V	A	D	S	C	A	V	S	I	D	R	R	L	T	W	G	E	T
Query Conservation																	.	.
Alig confidence																	.	.																			.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	A	F	S	P	R	E	V	G	X	D	R	S	L	I	G	A	Y	G	Q	D	D	R	I	C	A	Y	T	A	L	R	A	L	L	S	.	.	.	.	.	A	N	P	E	K	S	I	G	V	I	F	F	D	K	E	E	I	G	S	D	G	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	G	A	K	A	R	F
Template Known Secondary structure										S	S	S							T	T																	.	.	.	.	.				S	S								S	S	G	G	G	T	S		S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		231	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.						.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.												.	.	290	.	.	.	.
		272	.	.	.	.	.	.	.															280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.												.	.	300	.	.	.	.	.	.	.			.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Query Sequence		W	E	G	A	L	D	E	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	A	L	P	A	V	Q	K	A	N	A	V	V	S	M	Y	N	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	R	P	S	W	T	G	L	V	Y	.	.	P	T	E	C	Y	F	P	T	W	K	V	E	E	D	H	F	T
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	L	K	A	L	R	Q	I	L	K	X	Q	G	A	K	D	S	E	F	V	L	D	E	V	L	E	N	T	S	V	I	S	G	D	V	C	A	A	V	N	P	P	Y	K	D	V	H	D	L	H	N	A	P	K	L	G	Y	G	V	A	L	V	K	Y	T	G	A	R	G	K	Y	S	T	N	D	A	H	A	E	F
Template Known Secondary structure													T	T		S	S											S														G	G	G	G	G	G	S		G	G	G				T	T	S						S				S	T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		295	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.
		325	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.						.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.
Query Sequence		V	K	A	L	V	N	A	Y	E	G	L	F	G	K	A	P	V	V	D	K	W	T	.	.	.	.	.	F	S	T	N	G	V	S	I	M	G	R	H	G	I	P	V	I	G	F	G	P	G	K	E	P	E	A	H	A	P	N	E	K	T	W	K	S	H	L	V	T	C	A	A	M	Y	A	A	I	P	L	S	W
Query Conservation																								.	.	.	.	.
Alig confidence													.											.	.	.	.	.																						.
Template Conservation													.																																					.
Template Sequence		V	A	R	V	R	K	V	L	N	E	Q	.	G	V	I	W	Q	V	A	T	L	G	K	V	D	Q	G	G	G	G	T	I	A	K	F	F	A	E	R	G	S	D	V	I	D	X	G	P	.	A	L	L	G	X	H	S	P	F	E	I	S	S	K	A	D	L	F	E	T	Y	V	A	Y	R	S	L	X	E	K	L
Template Known Secondary structure												T	.	T								S	S	S	T	T	S						T						T	T	T									.			B	S	T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure													.																																					.
Template SS confidence
		375	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.		.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.		.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.