Job Description P76482 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:23:24 GMT 2012 Rank 11 Aligned Residues 252 % Identity 27% Template c2ootA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:glutamate carboxypeptidase 2; PDBTitle: a high resolution structure of ligand-free human glutamate2 carboxypeptidase ii Resolution 1.64 Å

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		34	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80		.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	H	A	S	P	E	Q	L	E	K	T	V	R	Y	L	T	Q	T	V	H	P	R	S	A	D	N	I	D	N	L	N	R	S	A	E	Y	I	K	E	V	F	V	S	S	G	A	R	.	V	T	S	Q	D	V	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.																												.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.
Template Sequence		D	E	L	K	A	E	N	I	K	K	F	L	Y	N	F	T	Q	.	.	.	I	P	H	L	A	G	T	E	Q	N	F	Q	L	A	K	Q	I	Q	S	Q	W	K	E	F	G	L	D	S	V	E	L	A	H	Y	D	V	L	L	S	Y	P	N	K	T	H	P	N	Y	I	S	I	I	N	E	D	G	N	E	I	F
Template Known Secondary structure																	S	S	.	.	.	S				T	T	S																		T		S																T	T	S									T	T	S
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.
Template SS confidence
		63	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.				80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	T	S	L	F	E	P	P	P	P	G	Y	E	N	V	S	D	I	V	P	P	F	S	A	F	S	P	Q	G	M	P	E	G	D	L	V	Y	V	N	Y	A	R	T	E	D	F	F	K	L	E	R	D	M	K	I	N	C	S	G	K	I	V	I	A	R	Y	G	K	V	F	R	G	N	K	V	K	N	A	Q	L
Template Known Secondary structure					S	S					T	T		T	T		S					S				T				B										T	T												T	S					T	T									S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	G	A	K	G	V	I	L	Y	S	D	P	A	D	Y	F	A	P	G	V	K	S	Y	P	D	G	W	N	L	P	G	G	G	V	Q	R	G	N	I	L	N	L	N	G	A	G	D	P	L	T	P	G	Y	P	A	N	E	Y	A	Y	R	R	G	I	A	E	A	V	G	L	P	S	I	P	V	H	P	I	G	Y
Template Known Secondary structure		T	T		S														T	T			B	T	T	S	S	S	B			T	T											T	T			S	T	T	S	T	T	S				T	T						G	G	G		S	S			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																																																				88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.			.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	T	G	G	P	Y	K	N	I	V	A	D	Y	G	P	A	.	.	D	G	P	L	I	I	I	G	A	H	Y	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	D	A	Q	K	L	L	E	K	M	G	G	S	A	P	P	D	S	S	W	R	G	S	L	K	V	P	Y	N	V	G	P	G	F	T	G	N	F	S	T	Q	K	V	K	M	H	I	H	S	T	N	E	V	T	R	I	Y	N	V	I	G	T	L	R	G	A	V	E	P	D	R	Y	V	I	L	G	G	H	R	D
Template Known Secondary structure									T	T	B		B	B			S	S	G	G	G			S	S	S	S					B	S	S	B		G	G	G	T	T							B																			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		116	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.						150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190
Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.
Query SS confidence																																				.	.	.	.	.
Query Sequence		S	A	S	S	Y	E	N	D	Q	L	T	Y	T	P	G	A	D	D	N	A	S	G	V	A	G	L	L	E	L	A	R	L	L	H	.	.	.	.	.	Q	Q	V	P	K	T	G	V	Q	L	V	A	Y	A	S	E	E	P	P	F	F	R	S	D	E	M	G	S	A	V	H	A	A	S	L	E	R	P	V	K	L
Query Conservation																																				.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.																															.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																									.
Template Sequence		S	W	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	G	G	I	D	P	Q	S	G	A	A	V	V	H	E	I	V	R	S	F	G	T	L	K	K	E	G	W	R	P	R	R	T	I	L	F	A	S	W	D	A	E	E	F	G	L	L	G	S	T	E	W	A	E	E	N	.	S	R	L	L	Q	E	R	G	V	A
Template Known Secondary structure			S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		T	T	T	T																				T	T				S									S		G	G	G	T	S											.
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																									.
Template SS confidence
		380	.	.											.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.		.	440	.	.	.	.	.	.	.	.
		191	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.																.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	I	A	L	E	M	I	G	Y	Y	D	S	A	P	G	S	Q	N	Y	P	Y	P	A	M	S	W	L	Y	P	D	R	G	D	F	I	A	V	V	G	R	I	Q	D	I	N	A	V	R	Q	V	K	A	A	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	S	S	Q	D	L	S	V	Y	S	M
Query Conservation																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	I	N	A	D	S	S	I	E	G	N	Y	T	L	R	V	D	C	T	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	M	Y	S	L	V	H	N	L	T	K	E	L	K	S	P	D	E	G	F	E	G	K	S	L	Y	E	S	W	T	K	K	S	P	S	P	E	F	S
Template Known Secondary structure						S		S	B	S		S	S								G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G										T	S	B			S	T	T		T	T	S	B									S	B		S	S	S	T
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		449	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.
		256	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.		.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.							.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
Predicted Secondary structure																						.																													.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.																													.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	T	P	G	F	I	P	G	I	D	F	S	D	H	L	N	Y	W	Q	H	.	D	I	P	A	I	M	I	T	D	T	A	F	Y	R	N	K	Q	Y	H	L	P	G	D	T	A	D	R	L	.	.	.	.	.	.	N	Y	Q	K	M	A	Q	V	V	D	G	V	I	T	L	L	Y	N
Query Conservation																						.																													.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.															.														.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.
Template Sequence		G	M	P	R	I	S	K	L	G	S	G	N	D	F	E	V	F	F	Q	R	L	G	I	A	S	G	R	A	R	Y	T	K	N	G	Y	.	P	L	Y	H	S	V	Y	E	T	Y	E	L	V	E	K	F	Y	D	P	M	F	K	Y	H	L	T	V	A	Q	V	R	G	G	M	V	F	E
Template Known Secondary structure		T		B			B				S	S	S	T							T	T															.	T	T	T	T	S	T	T										T		T	T
Template Predicted Secondary structure																																					.
Template SS confidence
		508	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.		.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.