Job Description P76482 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:23:24 GMT 2012 Rank 7 Aligned Residues 246 % Identity 32% Template c2ek8A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:aminopeptidase; PDBTitle: aminopeptidase from aneurinibacillus sp. strain am-1 Resolution 1.80 Å

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		34	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	H	A	S	P	E	Q	L	E	K	T	V	R	Y	L	T	Q	T	V	H	P	R	S	A	D	N	I	D	N	L	N	R	S	A	E	Y	I	K	E	V	F	V	S	S	G	A	R	V	T	S	Q	D	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.
Template Sequence		K	R	T	D	A	E	N	M	Y	N	T	I	Q	F	L	S	Q	.	.	.	A	P	R	V	A	G	S	P	E	E	L	K	A	V	R	Y	I	E	Q	Q	F	K	S	Y	G	Y	H	V	E	V	Q	P	F	Q	F	E	G	Y	T	A	P	S	E	V	T	L	K	I	G	T	E	K	K	E	G	E	A	F	T	Y
Template Known Secondary structure		T	T														T	T	.	.	.	S				T	T	S																	T	T																	S							T	T									B	T
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.
Template SS confidence
		11	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.				.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	P	N	S	D	V	T	A	E	L	V	Y	V	G	L	G	T	T	A	D	V	A	G	K	D	L	N	G	K	I	A	L	I	Q	R	G	N	I	S	F	A	D	K	V	R	N	A	A	K	Q	G	A	K	A	V	I	I	Y	N	N	T	D	G	K	L	N	G	T	L	G	G	S	D	A	S	F	V	A	A	V
Template Known Secondary structure															T	T			T	T	T	T	T	T	S			T	T	S								S	S												T	T		S							S	S	S	S					B		S	S			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
																																		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.			.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	I	T	G	G	P	Y	K	N	I	V	A	D	Y	G	P	A	.	.	D	G	P	L	I	I	I	G	A	H	Y	D	S	A	S	S	Y	E	N	D	Q	L	T	Y	T	P	G	A	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	I	T	K	Q	E	G	D	A	L	A	A	N	L	R	A	G	E	K	I	T	A	T	V	K	V	A	G	A	E	V	K	T	L	T	S	H	N	V	I	A	T	K	K	P	D	A	N	K	K	N	T	N	D	I	I	I	I	G	S	H	H	D	S	V	E	K	.	.	.	.	.	.	.	.	A	P	G	A	N
Template Known Secondary structure																	T	T											S																			S	S	T	T																T	T	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.									.	.	.	.	.
		133	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	N	A	S	G	V	A	G	L	L	E	L	A	R	L	L	H	Q	Q	V	P	K	T	G	V	Q	L	V	A	Y	A	S	E	E	P	P	F	F	R	S	D	E	M	G	S	A	V	H	A	A	S	L	E	R	P	V	K	L	M	I	A	L	E	M	I	G	Y	Y	D	S	A	P	G	S	Q	N	Y	P	Y	P
Query Conservation
Alig confidence																																																	.																									.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																	.																									.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	D	A	S	G	V	A	V	T	L	E	L	A	R	V	M	S	K	L	K	T	D	T	E	L	R	F	I	T	F	G	A	E	E	N	G	L	I	G	S	K	K	Y	A	A	S	L	.	S	E	D	E	I	K	R	T	I	G	M	F	Q	L	D	M	V	G	S	K	D	A	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T															T	T	S			S	S								S	S	S	T	T	T	S								T	T		.																S			B	T	T	S			.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																	.																									.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.		.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310
		213	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	M	S	W	L	Y	P	D	R	G	D	F	I	A	V	V	G	R	I	Q	D	I	N	A	V	R	Q	V	K	A	A	L	L	S	S	Q	D	L	S	V	Y	S	M	N	T	P	G	F	I	P	G	I	D	F	S	D	H	L	N	Y	W	Q	H	D	I	P	A	I	M	I	T	D	T	A	F	Y	R	N	K	Q
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.																											.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.																											.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	I	M	Y	T	I	D	G	K	K	N	R	V	T	D	L	G	A	A	A	S	S	R	L	S	G	V	L	P	Y	.	.	.	.	.	.	.	G	Q	E	G	R	S	D	H	E	S	F	H	A	L	G	I	P	A	A	L	F	I	H	A	P	V	.	.	E	P	W
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T	T	S																	T	S					.	.	.	.	.	.	.					S	S	T						T	T	T										S		.	.		T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.																											.	.
Template SS confidence
														311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340								.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.			.	.	.
		293	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	H	L	P	G	D	T	A	D	R	L	N	Y	Q	K	M	A	Q	V	V	D	G	V	I	T	L	L	Y
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		Y	H	T	P	N	D	T	L	D	K	I	S	K	E	K	L	D	N	V	A	D	I	V	G	S	A	V	Y
Template Known Secondary structure		T	T	S	T	T			G	G	G	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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