Job Description P03018 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:57:53 GMT 2012 Rank 11 Aligned Residues 299 % Identity 24% Template d1w36b1 SCOP info P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases Tandem AAA-ATPase domain Resolution 3.1

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		13	.	.	.	.	.	.	20	.		.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.									.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.																											.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.
Query SS confidence											.																											.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.
Query Sequence		K	Q	R	E	A	V	A	A	P	.	R	S	N	L	L	V	L	A	G	A	G	S	G	K	T	R	V	L	V	H	R	I	A	W	L	M	.	.	.	.	.	.	.	.	S	V	E	N	C	S	P	Y	S	I	M	A	V	T	F	T	N	K	A	A	A	E	M	R	H	R	I	G	Q	L	M	G	.	.	.	.
Query Conservation											.																											.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.
Alig confidence											.																											.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	T	L	D	P	L	R	L	P	L	Q	G	E	R	L	I	E	A	S	A	G	T	G	K	T	F	T	I	A	A	L	Y	L	R	L	L	L	G	L	G	G	S	A	A	F	P	R	P	L	T	V	E	E	L	L	V	V	T	F	T	E	A	A	T	A	E	L	R	G	R	I	R	S	N	I	H	E	L	R	I
Template Known Secondary structure						G	G	G				S	S								T	T	S															T	T		S	S	S	S	S		S	S				G	G	G						S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
																																			80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	Q	G	G	M	W	V	G	T	F	H	G	L	A	H	R	L	L	R	A	H	H	M	D	A	N	L	P	Q	D	F	Q	I	L	D	S	E	D	Q	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	C	L	R	E	T	T	D	N	P	L	Y	E	R	L	L	E	E	I	D	D	K	A	Q	A	A	Q	W	L	L	L	A	E	R	Q	M	D	E	A	A	V	F	T	I	H	G	F	C	Q	R	M	L	N	L	N	A	F	E	S	G	M	L	F	E	Q	Q	L	I	E	D	E	S	L	L	R	Y	Q	A	C	A
Template Known Secondary structure					S	S				S											S																G	G	G		S															T					T			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
																											120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.													.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	R	L	L	K	R	L	I	K	A	M	N	L	D	E	K	Q	W	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	R	Q	A	M	W	Y	I	N	S	Q	K	D	E	G	L	R	P	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	F	W	R	R	H	C	Y	P	L	P	R	E	I	A	Q	V	V	F	E	T	W	K	G	P	Q	A	L	L	R	D	I	N	R	Y	L	Q	G	E	A	P	V	I	K	A	P	P	P	D	D	E	T	L	A	S	R	H	A	Q	I	V	A	R	I	D	T	V	K	Q	Q	W	R	D	A	V	G	E	L	D	A
Template Known Secondary structure									T	T														S	S									T	T	T	T	S	S	S					S	S				T	T																				T	T	S			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.
																																																											157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	H	I	Q	S	Y	G	N	P	V	E	Q	T	W	Q	K	V	Y	Q	A	Y	Q	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	I	E	S	S	G	I	D	R	R	K	F	N	R	S	N	Q	A	K	W	I	D	K	I	S	A	W	A	E	E	E	T	N	S	Y	Q	L	P	E	S	L	E	K	P	R	H	P	L	F	E	A	I	D	Q	L	L	A	E	P	L	S	I	R	D	L	V	I	T	R	A	L	A	E	I	R	E	T	V	A	R
Template Known Secondary structure					S	S	S		S	T										T			S	S				S							T	T	S	S											S		T						T	T	S				S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		246	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
		180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.			.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240			.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.																																				.	.
Query SS confidence																												.	.																																				.	.
Query Sequence		A	C	D	R	A	G	L	V	D	F	A	E	L	L	L	R	A	H	E	L	W	L	N	K	P	H	.	.	I	L	Q	H	Y	R	E	R	F	T	N	I	L	V	D	E	F	Q	D	T	N	N	I	Q	Y	A	W	I	R	L	L	A	G	D	T	.	.	G	K	V	M	I	V	G	D	D	D	Q	S	I	Y	G
Query Conservation																												.	.																																				.	.
Alig confidence																												.	.																																				.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	K	R	R	R	G	E	L	G	F	D	D	M	L	S	R	L	D	S	A	L	R	S	E	S	G	E	V	L	A	A	A	I	R	T	R	F	P	V	A	M	I	D	E	F	Q	D	T	D	P	Q	Q	Y	R	I	F	R	R	I	W	H	H	Q	P	E	T	A	L	L	L	I	G	D	P	K	Q	A	I	Y	A
Template Known Secondary structure							T																	S	T	T													S						S	G	G	G														T	T		T	T									G	G	G				G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		342	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.
		256	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	R	G	A	Q	V	E	N	I	Q	R	F	L	N	D	F	P	G	A	E	T	I	R	L	E	Q	N	Y	R	S	T	S	N	I	L	S	A	A	N	A	L	I	E	N	N	N	G	R	L	G	K	K	L	W	T	D	G	A
Query Conservation
Alig confidence																			.	.
Template Conservation																			.	.
Template Sequence		F	R	G	A	D	I	F	T	Y	M	K	A	R	S	E	V	H	.	.	A	H	Y	T	L	D	T	N	W	R	S	A	P	G	M	V	N	S	V	N	K	L	F	S	Q	T	D	D	A	F	M	F	R	E	I	P	F	I	P
Template Known Secondary structure		G	G	T															.	.									T	T	S														S	S	S	S	T	T	S	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																			.	.
Template SS confidence
		422	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.			.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.