Job Description P69910 Confidence 99.37% Date Thu Jan 5 12:12:18 GMT 2012 Rank 233 Aligned Residues 351 % Identity 14% Template d1ohwa_ SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases GABA-aminotransferase-like Resolution 2.30

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		53	.	.	.	.	.					.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.				.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.																									.	.	.
Query SS confidence								.	.	.	.																									.	.	.
Query Sequence		D	G	N	A	R	Q	.	.	.	.	N	L	A	T	F	C	Q	T	W	D	D	E	N	V	H	K	L	M	D	L	S	I	N	K	.	.	.	N	W	I	D	K	E	E	Y	P	Q	S	A	A	I	D	L	R	C	V	N	M	V	A	D	L	W	H	A	P	A	P	K	N	G	Q	A	V	G	T	N	T	I	G
Query Conservation								.	.	.	.																									.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.																									.	.	.																																	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																							.	.	.	.	.
Template Sequence		D	G	N	R	M	L	D	L	Y	S	Q	I	S	S	I	P	I	G	Y	S	H	P	A	L	V	K	L	V	Q	Q	P	Q	N	V	S	T	F	I	N	R	P	A	L	G	I	L	P	P	E	N	F	V	E	K	L	R	E	S	L	L	S	V	A	P	K	G	M	S	Q	.	.	.	.	.	L	I	T	M	A	C
Template Known Secondary structure		T	S						S	S					T		S	S		B	T											G	G	G										T	T	T	S			T	T								T	G	G	G	G			T	T				.	.	.	.	.					S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.
Template SS confidence
		61	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.						130	.	.	.	.	.
		126	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.		.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.												.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	S	E	A	C	M	L	G	G	M	A	M	K	W	R	W	R	K	R	M	E	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	K	P	T	D	K	P	N	L	V	C	G	P	.	V	Q	I	C	W	H	K	F	A	R	Y	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	V	E	L
Query Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	S	C	S	N	E	N	A	F	K	T	I	F	M	W	Y	R	S	K	E	R	G	Q	S	A	F	S	K	E	E	L	E	T	C	M	I	N	Q	A	P	G	C	P	D	Y	S	I	L	S	F	M	G	A	F	H	G	R	T	M	G	C	L	A	T	T	H	S	K	A	I	H	K	I	D	I	P	S	F	D	W
Template Known Secondary structure																							T	T													T	T		T	T	T	S									T	T					S	S						T			S						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		136	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.
		178	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.				200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.					220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.																					.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.																					.	.	.	.
Query Sequence		R	E	I	P	M	R	P	G	Q	L	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	D	P	K	R	M	I	E	A	C	D	.	.	.	E	N	T	I	G	V	V	P	T	F	G	V	T	Y	T	G	N	Y	E	F	.	.	.	.	P	Q	P	L	H	D	A	L	D	K	F	Q	A	D	T
Query Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.																					.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.																					.	.	.	.													.	.	.
Template Conservation																																																																															.	.	.
Template Sequence		P	I	A	P	F	P	R	L	K	Y	P	L	E	E	F	V	K	E	N	Q	Q	E	E	A	R	C	L	E	E	V	E	D	L	I	V	K	Y	R	K	K	K	K	T	V	A	G	I	I	V	E	P	I	Q	S	E	G	G	D	N	H	A	S	D	D	F	F	R	K	L	R	D	I	S	R	K	H	G	.	.	.
Template Known Secondary structure											S	S	G	G	G																										T	T										S	S	B		T	T	T		B																	T	T	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Template SS confidence
		216	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.
		235	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	I	D	I	D	M	H	I	D	A	A	S	G	G	F	L	A	P	F	V	A	P	D	I	V	W	D	F	R	L	P	R	V	K	S	I	S	A	S	G	H	K	F	G	L	A	P	L	G	C	G	W	V	I	W	R	D	E	E	A	L	P	Q	E	L	V	F	N	V	D	Y	L	G	G	Q	I	G	T	F	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.																																					.	.				.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.																																					.	.				.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	C	A	F	L	V	D	E	V	Q	T	G	G	G	S	T	G	K	F	W	A	H	E	H	W	G	L	D	D	P	A	D	V	M	T	F	S	.	.	K	K	M	.	.	.	.	M	T	G	G	F	F	H	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	F	R	P	N	A	P	Y	R	I	F
Template Known Secondary structure		.	.	.								T	T	T		S	S	T	T	S	S	S	S	G	G	G	G	G			S	S			S						.	.	G	G	G	.	.	.	.	S	S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	S		S	S	T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.																																					.	.				.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
					293	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.			.	330	.					.	.	.	.	.	.	.	.													340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.
		315	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.		.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.
Predicted Secondary structure																																	.
Query SS confidence																																	.
Query Sequence		I	N	F	S	R	P	A	G	Q	V	I	A	Q	Y	Y	E	F	L	R	L	G	R	E	G	Y	T	K	V	Q	N	A	.	S	Y	Q	V	A	A	Y	L	A	D	E	I	A	K	L	G	P	Y	E	F	I	C	T	G	R	P	D	E	G	I	P	A	V	C	F	K	L	K	D	G	E	D	P	G	Y	T	L	Y
Query Conservation																																	.
Alig confidence																																	.																												.	.	.	.								.	.	.	.
Template Conservation																																																													.	.	.	.								.	.	.	.
Template Sequence		N	T	W	L	G	D	P	S	K	N	L	L	L	A	E	V	I	N	I	I	K	R	E	D	L	L	S	N	A	A	H	A	G	K	V	L	L	T	G	L	L	D	L	Q	A	R	Y	P	Q	F	I	S	R	V	R	G	R	G	T	.	.	.	.	F	C	S	F	D	T	P	.	.	.	.	D	E	S	I	R	N
Template Known Secondary structure			S		S	S																		T	T																								T	T	T								T	T	.	.	.	.							S	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.								.	.	.	.
Template SS confidence
		352	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410					.	.	.	.	.	.	.					.	.	420	.	.	.
		394	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	L	S	E	R	L	R	L	R	G	W	Q	V	P	A	F	T	L	G	G	E	A	T	D	I	V	V	M	R	I	M	C	R	R	G	F	E	M	D	F	A	E	L	L	L	E	D	Y	K	A	S	L	K	Y
Query Conservation
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	L	I	S	I	A	R	N	K	G	V	M	L	G	.	.	.	.	.	.	.	G	C	G	D	K	S	I	R	F	R	P	T	L	V	F	R	D	H	H	A	H	L	F	L	N	I	F	S	D	I	L	A	D
Template Known Secondary structure										T	T					.	.	.	.	.	.	.			T	T	T								T	T																			T
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		424	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.								.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470