Job Description P69910 Confidence 99.93% Date Thu Jan 5 12:12:18 GMT 2012 Rank 72 Aligned Residues 365 % Identity 13% Template d1bj4a_ SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases GABA-aminotransferase-like Resolution 2.65

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		39	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80		.	.	.	.	.	.	.	.	.							90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.
Predicted Secondary structure																																												.										.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.										.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	D	V	A	F	Q	I	I	N	D	E	L	Y	L	D	G	N	A	R	Q	N	L	A	T	F	C	Q	T	W	D	D	E	N	V	H	K	L	M	D	L	S	I	.	N	K	N	W	I	D	K	E	E	.	.	.	.	.	.	Y	P	Q	S	A	A	I	D	L	R	C	V	N	M	V	A	D	L	W	H	A	P
Query Conservation																																												.										.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.																	.										.	.	.	.	.	.
Template Conservation																										.	.
Template Sequence		D	V	E	V	Y	N	I	I	K	K	E	S	N	R	Q	R	V	G	L	E	L	I	A	S	.	.	E	N	F	A	S	R	A	V	L	E	A	L	G	S	C	L	N	N	K	Y	S	E	G	Y	P	G	Q	R	Y	Y	G	G	T	E	F	I	D	E	L	E	T	L	C	Q	K	R	A	L	Q	A	Y	K	L	D
Template Known Secondary structure		T																	S					T	T	.	.													T	S	G	G	G	T							T	T			S	S	S																				T	T
Template Predicted Secondary structure																										.	.
Template SS confidence
		30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.			.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.
		112	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.											.	.	.	.	180	.
Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	P	K	N	G	Q	A	V	G	T	N	T	I	G	S	S	E	A	C	M	L	G	G	M	A	M	K	W	R	W	R	K	R	M	E	A	A	G	K	P	T	D	K	P	N	L	V	C	G	P	V	Q	I	C	W	H	K	F	A	R	Y	W	D	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	L	R	E	I	P
Query Conservation																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	Q	C	.	.	W	G	V	N	V	Q	P	Y	S	G	S	P	A	N	F	A	V	Y	T	A	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	E	P	H	G	R	I	M	G	L	D	L	P	D	G	G	H	L	T	H	G	F	M	T	D	K	K	K	I	S	A	T	S	I	F	F	E	S	M	P	Y	K
Template Known Secondary structure		T	T	T	.	.								S	S													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T		T	T								G	G	G	T			G	G	G			B		S	S		B		S						S
Template Predicted Secondary structure					.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		108	.	110			.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.													.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.
		182	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	R	P	G	Q	L	F	M	D	P	K	R	M	I	E	A	C	D	E	N	T	I	G	V	V	P	T	F	G	V	T	Y	T	G	N	Y	E	F	P	Q	P	L	H	D	A	L	D	K	F	Q	A	D	T	G	I	D	I	D	M	H	I	D	A	A	S	G	G	F	L	A	P	F	V	A	P	D	I	V	W	D
Query Conservation
Alig confidence																																						.														.	.	.	.	.	.																								.
Template Conservation																																						.														.	.	.	.	.	.																								.
Template Sequence		V	N	P	D	T	G	Y	I	N	Y	D	Q	L	E	E	N	A	R	L	F	H	P	K	L	I	I	A	G	T	S	C	Y	S	R	N	L	.	E	Y	A	R	L	R	K	I	A	D	E	N	G	.	.	.	.	.	.	A	Y	L	M	A	D	M	A	H	I	S	G	L	V	A	A	G	V	V	P	S	P	F	.
Template Known Secondary structure		B		T	T	T		S	B															S							S	S			S			.												T	T	.	.	.	.	.	.								G	G	G						T	T	S	S			G	G	.
Template Predicted Secondary structure																																						.														.	.	.	.	.	.																								.
Template SS confidence
		174	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.		210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.							.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.
		262	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	R	L	P	R	V	K	S	I	S	A	S	G	H	K	F	G	L	A	P	L	G	C	G	W	V	I	W	R	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	A	L	P	Q	E	L	V	F	N	V	D	Y	L	G	G	Q	I	G	T	F	A	I	N	F	S	R	P	A	G	Q	V
Query Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																				.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.																				.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	E	H	C	H	V	V	T	T	T	T	H	K	T	L	R	G	C	R	A	.	G	M	I	F	Y	R	K	G	V	K	S	V	D	P	A	T	G	K	E	I	L	Y	N	L	E	S	L	I	N	S	A	V	F	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	Q	G	G	P	H	N	H	A	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	G	T		S						S	S	G	G	G				S		.								S						T	T	T																	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T			S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.																				.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
					246	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.		.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.													.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		325	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	A	Q	Y	Y	E	F	L	R	L	G	R	E	G	Y	T	K	V	Q	N	A	S	Y	Q	V	A	A	Y	L	A	D	E	I	A	K	L	G	P	Y	E	F	I	C	T	G	R	P	D	E	G	I	P	A	V	C	F	K	L	K	D	G	E	D	P	G	Y	T	L	Y	D	L	S	E	R	L	R	L	R	G	W
Query Conservation
Alig confidence																																							.											.	.	.										.	.	.
Template Conservation																																							.											.	.	.										.	.	.
Template Sequence		A	G	V	A	V	A	L	K	Q	A	M	T	L	E	F	K	V	Y	Q	H	Q	V	V	A	N	C	R	A	L	S	E	A	L	T	E	L	G	.	Y	K	I	V	T	G	G	S	D	N	.	.	.	H	L	I	L	V	D	L	R	S	.	.	.	K	G	T	D	G	G	R	A	E	K	V	L	E	A	C	S	I
Template Known Secondary structure											T	T	S																								T	T	.				T	T	S	S		S	S	.	.	.	S						G	G	G	.	.	.	G	T													T	T
Template Predicted Secondary structure																																							.											.	.	.										.	.	.
Template SS confidence
		310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.		.	.	.	350	.	.	.	.	.	.				.	.	.	360	.	.	.	.	.				.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.
		405	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.			.	.	420	.	.	.	.					.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450
Predicted Secondary structure															.	.								.	.	.	.
Query SS confidence															.	.								.	.	.	.
Query Sequence		Q	V	P	A	F	T	L	G	G	E	A	T	D	.	.	I	V	V	M	R	I	M	.	.	.	.	C	R	R	G	F	E	M	D	F	A	E	L	L	L	E	D	Y	K	A	S	L	K	Y	L	S	D
Query Conservation															.	.								.	.	.	.
Alig confidence															.	.								.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	C	N	K	N	T	C	P	G	D	R	S	A	L	R	P	S	G	L	R	L	G	T	P	A	L	T	S	R	G	L	L	E	K	D	F	Q	K	V	A	H	F	I	H	R	G	I	E	L	T	L	Q
Template Known Secondary structure									T	T		S		T	T	S														T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		383	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.