Job Description P69910 Confidence 99.58% Date Thu Jan 5 12:12:18 GMT 2012 Rank 210 Aligned Residues 371 % Identity 12% Template c3k7yA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:aspartate aminotransferase; PDBTitle: aspartate aminotransferase of plasmodium falciparum Resolution 2.80 Å

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		35	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.							.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.		.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.																							.
Query SS confidence																																.	.	.	.	.	.																							.
Query Sequence		H	E	M	R	D	D	V	A	F	Q	I	I	N	D	E	L	Y	L	D	G	N	A	R	Q	N	L	A	T	F	C	.	.	.	.	.	.	Q	T	W	D	D	E	N	V	H	K	L	M	D	L	S	I	N	K	N	W	I	D	.	K	E	E	Y	P	Q	S	A	A	I	D	L	R	C	V	N	M	V	A	D	L
Query Conservation																																.	.	.	.	.	.																							.
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.																							.
Template Conservation
Template Sequence		E	N	I	E	V	D	N	I	L	K	T	A	R	E	F	K	E	D	T	C	E	E	K	I	N	L	S	I	G	V	C	C	N	D	D	G	D	L	H	I	F	D	S	V	L	N	A	D	K	L	V	T	E	N	Y	K	E	K	P	Y	L	L	G	N	G	T	E	D	F	S	T	L	T	Q	N	L	I	F	G	N
Template Known Secondary structure																	T	T	S	S		S	S					S		S	S		B		T	T	S	S	B																								T	T	S	S															S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
		108	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.		.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																														.
Query SS confidence																																																																														.
Query Sequence		W	H	A	P	A	P	K	N	G	Q	A	V	G	T	N	T	I	G	S	S	E	A	C	M	L	G	G	M	A	M	K	W	R	W	R	K	R	M	E	A	A	G	K	P	T	D	K	P	N	L	V	C	G	P	V	Q	I	C	W	H	K	F	A	R	Y	W	D	V	E	L	R	E	I	P	M	R	.	P	G	Q
Query Conservation																																																																														.
Alig confidence									.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.
Template Conservation									.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	S	K	Y	I	E	D	.	K	K	I	C	T	I	Q	C	I	G	G	T	G	A	I	F	V	L	L	E	F	L	K	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	N	V	E	T	L	Y	V	T	N	P	P	Y	I	N	H	V	N	M	I	E	S	R	G	F	N	L	K	Y	I	N	F	F	D	Y	N	L
Template Known Secondary structure		S		T	T	T	T	T	.	T																							T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T								S	S											T	T	T											T	T	T
Template Predicted Secondary structure									.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		89	90	.	.	.	.	.		.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.												120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
		187	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.				.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.				.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260
Predicted Secondary structure														.	.	.																		.	.	.
Query SS confidence														.	.	.																		.	.	.
Query Sequence		L	F	M	D	P	K	R	M	I	E	A	C	.	.	.	D	E	N	T	I	G	V	V	P	T	F	G	V	T	Y	T	G	.	.	.	N	Y	E	F	P	Q	P	L	H	D	A	L	D	K	F	Q	A	D	T	G	I	D	I	D	M	H	I	D	A	A	S	G	G	F	L	A	P	F	V	A	P	D	I	V	W
Query Conservation														.	.	.																		.	.	.
Alig confidence														.	.	.																		.	.	.																	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																					.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	D	I	N	Y	D	L	F	L	N	D	L	R	N	I	P	N	G	S	S	V	I	L	Q	I	S	C	Y	N	P	C	S	V	N	I	E	E	K	Y	F	D	E	I	I	E	I	V	L	H	K	K	.	.	.	.	.	.	H	V	I	I	F	D	I	A	Y	Q	G	F	G	H	T	N	L	E	E	D	V	L	L
Template Known Secondary structure		T														S		S	S								S	S		T	T	T																					.	.	.	.	.	.								S		T	T	T	S	S	S	S	T	T	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.							.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230
		261	.	.	.	.	.	.	.				.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.		280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.						.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330
Predicted Secondary structure										.	.	.												.														.	.	.	.	.																																							.
Query SS confidence										.	.	.												.														.	.	.	.	.																																							.
Query Sequence		D	F	R	L	P	R	V	K	.	.	.	S	I	S	A	S	G	H	K	F	G	L	.	A	P	L	G	C	G	W	V	I	W	R	D	E	.	.	.	.	.	E	A	L	P	Q	E	L	V	F	N	V	D	Y	L	G	G	Q	I	G	T	F	A	I	N	F	S	R	P	A	G	Q	V	I	A	Q	Y	Y	E	.
Query Conservation										.	.	.												.														.	.	.	.	.																																							.
Alig confidence										.	.	.												.														.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.																		.
Template Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	R	K	F	E	E	K	N	I	A	F	S	V	C	Q	S	F	S	K	N	M	S	L	Y	G	E	R	A	G	A	L	H	I	V	C	K	N	Q	E	E	K	K	I	V	F	N	N	L	C	F	I	V	R	K	F	.	.	.	.	.	.	.	Y	S	S	P	V	I	H	T	N	R	I	L	C	Q	L	L	N	N
Template Known Secondary structure							T	T	T										T	T	T	S			T	T	T	T									S	S																	T	T	.	.	.	.	.	.	.	T	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		231	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.								.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.
				331	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.
Query SS confidence		.	.
Query Sequence		.	.	F	L	R	L	G	R	E	G	Y	T	K	V	Q	N	A	S	Y	Q	V	A	A	Y	L	A	D	E	I	A	K	L	G	P	Y	E	F	I	C	T	G	R	P	D	E	G	I	P	A	V	C	F	K	L	K	D	G	E	D	P	G	Y	T	L	Y	D	L	S	E	R	L	R	L	R	G	W	Q	V	P	A
Query Conservation		.	.
Alig confidence		.	.																																																										.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																													.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	N	L	K	L	N	W	I	K	E	L	S	Q	L	S	Q	R	I	T	N	N	R	I	L	F	F	N	K	L	E	T	Y	Q	K	K	Y	N	L	N	Y	D	W	N	V	Y	K	K	Q	R	G	L	F	S	F	V	P	L	L	A	.	.	.	.	.	.	K	I	A	E	H	L	K	T	H	H	I	Y	I	I	N
Template Known Secondary structure																																		G	G	G	G	T					G	G	G	G	S	S			S	S					G	G	G	G	.	.	.	.	.	.	G	G	T	T	T	T	T	T	T	T					T
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		304	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.							.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.
		409	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	T	L	G	G	E	A	T	D	I	V	V	M	R	I	M	C	R	R	G	F	E	M	D	F	A	E	L	L	L	E	D	Y	K	A	S	L	K	Y	L
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.
Template Sequence		N	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	I	N	V	.	S	G	I	T	K	N	N	V	D	Y	I	A	D	K	I	C	L	S	L	S	Q	I
Template Known Secondary structure		T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				G	.	G	G			T	T
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.
Template SS confidence
		378	.												380	.	.	.		.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.