Job Description P69910 Confidence 99.54% Date Thu Jan 5 12:12:18 GMT 2012 Rank 220 Aligned Residues 328 % Identity 16% Template c2eo5A_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:419aa long hypothetical aminotransferase; PDBTitle: crystal structure of 4-aminobutyrate aminotransferase from sulfolobus2 tokodaii strain7 Resolution 1.90 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		53	.	.	.	.	.	.	60	.	.						.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.
Query Sequence		D	G	N	A	R	Q	N	L	A	T	.	.	.	.	.	F	C	Q	T	W	D	D	E	N	V	H	K	L	M	D	L	S	I	N	K	N	W	I	D	K	E	E	Y	P	Q	S	A	A	I	D	L	R	C	V	N	M	V	A	D	L	W	H	A	P	A	P	K	N	G	Q	A	V	G	T	N	T	I	G	S	S
Query Conservation												.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.																							.																											.	.	.	.
Template Conservation																																							.																											.	.	.	.
Template Sequence		D	G	N	K	Y	L	D	F	T	S	G	I	G	V	N	N	L	G	W	P	S	H	P	E	V	I	K	I	G	I	E	Q	M	Q	K	L	A	.	H	A	A	A	N	D	F	Y	N	I	P	Q	L	E	L	A	K	K	L	V	T	Y	S	P	G	N	.	.	.	.	F	Q	K	K	V	F	F	S	N	S	G	T
Template Known Secondary structure		T	S						S	S	G	G	G	G	T	T	T	T		B	S														T	T	S		.			S		S		S																S	S		S	.	.	.	.	S								S	S
Template Predicted Secondary structure																																							.																											.	.	.	.
Template SS confidence
		40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.		.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.					.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.
		128	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.		.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.														.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190
Predicted Secondary structure																																				.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.
Query SS confidence																																				.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.
Query Sequence		E	A	C	M	L	G	G	M	A	M	K	W	R	W	R	K	R	M	E	A	A	G	K	P	T	D	K	P	N	L	V	C	G	P	.	V	Q	I	C	W	H	K	F	A	R	Y	W	D	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	L	R	E	I	P	M	R	P	G	Q	L	F	M	D	.	.	.
Query Conservation																																				.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.							.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.
Template Sequence		E	A	I	E	A	S	I	K	V	V	K	N	T	G	R	K	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	I	A	F	L	G	G	F	H	G	R	T	F	G	S	I	S	L	T	A	S	K	A	V	Q	R	S	I	V	G	P	F	M	P	G	V	I	H	V	P	Y	P	.	N	P	Y	R	N	P	W	H	I
Template Known Secondary structure													T	T	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T					S	S									S		G	G	G	G		S	S					T	T								.		S	S	S		T	T
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.
Template SS confidence
		115	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.												.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.		.	.	.	.	.	.	180	.	.
															191	.	.	.	.	.	.	.	.	200						.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.						220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	K	R	M	I	E	A	C	D	E	.	.	.	.	.	N	T	I	G	V	V	P	T	F	G	V	T	Y	T	G	N	Y	E	F	.	.	.	.	.	P	Q	P	L	H	D	A	L	D	K	F	Q	A	D	T	G	I	D	I	D	M	H	I	D	A	A	S	G
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																		.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	G	Y	E	N	P	S	E	L	V	N	R	V	I	E	F	I	E	D	Y	I	F	V	N	L	V	P	P	E	E	V	A	G	I	F	F	E	P	I	Q	G	E	G	G	Y	V	I	P	P	K	N	F	F	A	E	L	Q	K	L	A	K	K	Y	G	.	.	.	.	.	.	I	L	L	V	D	D	E	V	Q	M
Template Known Secondary structure			T	T	T																T					T			G	G	G								S	S	B	T	T	T	T	S	B				T	T													T	.	.	.	.	.	.								T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		183	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.							.	.	.	250	.	.	.	.	.	.
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	F	L	A	P	F	V	A	P	D	I	V	W	D	F	R	L	P	R	V	K	S	I	S	A	S	G	H	K	F	G	L	A	P	L	G	C	G	W	V	I	W	R	D	E	E	A	L	P	Q	E	L	V	F	N	V	D	Y	L	G	G	Q	I	G	T	F	A	I	N	F	S	R	P	A	G	Q	V	I	A	Q
Query Conservation
Alig confidence			.	.																														.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.																														.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	.	.	L	G	R	T	G	K	L	F	A	I	E	N	F	N	T	V	P	D	V	I	T	L	A	K	A	L	G	G	G	.	I	M	P	I	G	A	T	I	F	R	K	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	F	K	T	F	G	G	N	A	L	A	C	A	I	G
Template Known Secondary structure		T	.	.	T	T	T	T	S	S	S	S	G	G	G	G	G	T				S						G	G	G	G	T	T	.	T	S									G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure			.	.																														.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		257			.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.		.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.
		328	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	Y	E	F	L	R	L	G	R	E	G	Y	T	K	V	Q	N	A	S	Y	Q	V	A	A	Y	L	A	D	E	I	A	K	L	G	P	Y	E	F	I	C	T	G	R	P	D	E	G	I	P	A	V	C	F	K	L	K	D	G	E	D	P	G	Y	T	L	Y	D	L	S	E	R	L	R	L	R	G	W	Q	V	P
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.	.	.																							.								.	.	.	.	.	.									.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.																							.								.	.	.	.	.	.									.	.	.	.
Template Sequence		S	K	V	I	D	I	V	.	.	.	.	.	K	D	L	L	P	H	V	N	E	I	G	K	I	F	A	E	E	L	Q	G	L	A	.	D	D	V	R	G	I	G	.	.	.	.	.	.	L	A	W	G	L	E	Y	N	.	.	.	.	E	K	K	V	R	D	R	I	I	G	E	S	F	K	R	G	L	L	L	L
Template Known Secondary structure									.	.	.	.	.																			T	T	S	S	.	S						T	.	.	.	.	.	.	T							S	.	.	.	.															T	T
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.																							.								.	.	.	.	.	.									.	.	.	.
Template SS confidence
		321	.	.	.	.	.	.						.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.		350	.	.	.	.	.	.							.	.	.	360	.	.	.	.					.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.
		408	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	F	T	L	G	G	E	A	T	D	I	V	V	M	R	I	M	C	R	R	G	F	E	M	D	F	A	E	L	L	L	E	D	Y	K	A	S	L	K	Y	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	P	A	G	R	S	A	I	R	V	I	P	P	L	V	I	S	E	E	E	A	K	Q	G	L	D	I	L	K	K	V	I	K	V	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.			T	T	T								T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
									385	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.