![]() |
|
![]() |
  | Insertion relative to template |
  | Deletion relative to template |
  | Catalytic residue from the CSA |
  | |
Detailed help on interpreting your alignment |
  |   | 8 | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | |||||||||||
Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | R | L | D | G | K | C | A | I | I | T | G | A | G | A | G | I | G | K | E | I | A | I | T | F | A | T | A | G | A | S | V | V | V | S | D | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | I | N | A | D | A | A | N | H | V | V | D | E | I | Q | Q | L | G | G | Q | A | F | A | C | R | C | D | I | T | S | E | Q | E | L | S |
Template Sequence |   | P | V | E | K | Q | T | A | V | V | S | G | S | . | G | N | V | A | L | Y | C | V | Q | K | L | L | H | L | N | V | K | V | L | T | L | S | D | S | N | G | Y | V | Y | E | P | N | G | F | T | H | E | N | L | E | F | L | I | D | L | K | E | E | K | K | G | R | I | K | E | Y | L | N | H | S | S | T | A | K | Y | F | P |
Template Known Secondary structure |   | G | G | G | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | . | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | T | T | G | G | G | G | G | G | T | S | S | ![]() | ![]() | S | ||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 227 | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | |
  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 77 | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Secondary structure |   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | A | L | A | D | F | A | I | S | K | L | G | K | V | D | I | L | V | N | N | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Sequence |   | N | E | K | P | W | G | V | P | C | T | L | A | F | P | C | A | T | Q | N | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Known Secondary structure |   | S | T | T | S | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | T | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 306 | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |
Download: | Text version |
No model constructed - rank, confidence too low
Phyre is for academic use only
Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server | ||||||||
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX] | ||||||||
  | ||||||||
|
|