Job Description P06988 Confidence 99.00% Date Thu Jan 5 10:59:46 GMT 2012 Rank 3 Aligned Residues 334 % Identity 18% Template d1ky8a_ SCOP info ALDH-like ALDH-like ALDH-like Resolution 2.40

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		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	N	S	C	T	A	E	Q	Q	R	Q	L	L	M	R	P	A	I	S	A	S	E	S	I	T	R	T	V	N	D	I	L	D	N	V	K	A	R	G	D	E	A	L	R	E	Y	S	A	K	F	D	K	T	T	V	T	A	L	K	V	S	A	E	E	I	A	A	A	S	E	R	L	S	D	E	L	K	Q	A	M
Query Conservation
Alig confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	R	D	M	P	G	T	E	R	L	A	V	L	R	K	A	A	D	I	I	E	R	N	L	D	V	F	A	E	V	L	V	M	N	A	G	K	P	K	S	A	A	V	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V
Template Known Secondary structure					S																			T																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		71	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.																																			.
		89	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110							.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.		140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.																														.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.	.																														.
Query Sequence		A	V	A	V	K	N	I	E	T	F	H	T	A	Q	K	L	P	P	V	D	V	E	.	.	.	.	.	.	T	Q	P	G	V	R	C	Q	Q	V	T	R	P	V	A	S	V	G	L	Y	I	P	G	G	S	A	P	L	F	.	S	T	V	L	M	L	A	T	P	A	S	I	A	G	C	K	K	V	V	L	C	S
Query Conservation																								.	.	.	.	.	.																														.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.																							.	.	.					.
Template Conservation																																																				.	.	.
Template Sequence		K	A	A	V	D	R	L	R	L	A	E	L	D	L	K	K	I	G	G	D	Y	I	P	G	D	W	T	Y	D	T	L	E	T	E	G	L	V	R	R	E	P	L	G	V	V	A	A	I	T	P	.	.	.	F	N	Y	P	L	F	D	A	V	N	K	I	T	Y	S	F	I	Y	G	N	A	V	V	V	K	P	S
Template Known Secondary structure										G	G	G	G	G	G	T	T	T							S	T	T	S	S	T	T	T	T											S								.	.	.	S	S	S															T	T
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.	.
Template SS confidence
		117	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.				.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.
		162			.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180				.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.																			.	.	.
Query SS confidence			.	.																			.	.	.
Query Sequence		P	.	.	P	P	I	A	D	E	I	L	Y	A	A	Q	L	C	G	V	Q	D	.	.	.	V	F	N	V	G	G	A	Q	A	I	A	A	L	A	F	G	T	E	S	V	P	K	V	D	K	I	F	G	P	G	N	A	F	V	T	E	A	K	R	Q	V	S	Q	R	L	D	G	A	A	I	D	M	P	A	G	P
Query Conservation			.	.																			.	.	.
Alig confidence			.	.																			.	.	.																.	.	.	.																											.	.	.	.
Template Conservation																																									.	.	.	.																											.	.	.	.
Template Sequence		I	S	D	P	L	P	A	A	M	A	V	K	A	L	L	D	A	G	F	P	P	D	A	I	A	L	L	N	L	P	G	K	E	A	E	K	I	V	A	.	.	.	.	D	D	R	V	A	A	V	S	F	T	G	S	T	E	V	G	E	R	V	V	K	V	G	G	V	K	.	.	.	.	Q	Y	V	M	E	L	G
Template Known Secondary structure		T	T	S															T			T	T	S								G	G	G	G						.	.	.	.		T	T								S														S	S	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.																											.	.	.	.
Template SS confidence
		194	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.					.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.					.	260	.	.	.	.	.
		237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.					.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	E	V	L	V	I	A	D	S	G	A	T	P	D	F	V	A	S	D	L	L	S	Q	A	E	H	G	P	.	.	.	.	D	S	Q	V	I	L	L	T	P	A	A	D	M	A	R	R	V	A	E	A	V	E	R	Q	L	A	E	L	P	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																														.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																														.	.	.	.										.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																											.
Template Sequence		G	G	D	P	A	I	V	L	E	D	A	D	L	D	L	A	A	D	K	I	A	R	G	I	Y	S	Y	A	G	Q	R	C	D	A	I	K	L	V	L	A	E	.	R	P	V	Y	G	K	L	V	E	E	V	A	K	R	L	S	S	L	R	V	G	D	P	R	D	P	T	V	D	V	G	P	L	I	S	P	S	A
Template Known Secondary structure										T	T	S															G	G	G	G			T	T									.																	T			B	S		T	T	S	T	T		S	B				S
Template Predicted Secondary structure																																											.
Template SS confidence
		266	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.		.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.
						295	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Query SS confidence		.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Query Sequence		.	.	.	.	A	E	T	A	R	Q	A	L	N	A	S	R	L	I	V	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	D	L	A	Q	C	V	E	I	S	N	Q	Y	G	P	E	H	.
Query Conservation		.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Alig confidence		.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Template Conservation
Template Sequence		V	D	E	M	M	A	A	I	E	D	A	V	E	K	G	G	R	V	L	A	G	G	R	R	L	G	P	T	Y	V	Q	P	T	L	V	E	A	P	A	D	R	V	K	D	M	V	L	Y	K	R	E	V	F	A	P	V	A	S	A	V	E	V	K	D	L	D	Q	A	I	E	L	A	N	G	R	P	Y	G	L	D
Template Known Secondary structure															T	T												T	T															T	T	S					S				S	S								S	S										T	S	S			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		345	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.
		328	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340				.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.		.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.																						.
Query SS confidence															.	.	.																						.
Query Sequence		L	I	I	Q	T	R	N	A	R	E	L	V	D	.	.	.	S	I	T	S	A	G	S	V	F	L	G	D	W	S	P	E	S	A	G	D	Y	.	A	S	G	T	N	H	V	L	P	T	Y	G	Y	T	A	T	C	S	S	L	G	L	A	D	F	Q	K	R	M	T	V	Q
Query Conservation															.	.	.																						.
Alig confidence															.	.	.				.																		.								.	.	.	.
Template Conservation																					.																										.	.	.	.
Template Sequence		A	A	V	F	G	R	D	V	V	K	I	R	R	A	V	R	L	L	E	.	V	G	A	I	Y	I	N	D	M	P	R	H	G	I	G	Y	Y	P	F	G	G	R	K	K	S	.	.	.	.	G	V	F	R	E	G	I	G	Y	A	V	E	A	V	T	A	Y	K	T	I	V
Template Known Secondary structure																					.	S	S					T	S					T	T	S	S	S		B					T	T	.	.	.	.			S		B	S	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																					.																										.	.	.	.
Template SS confidence
		425	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.		.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.					.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.