Job Description P06988 Confidence 98.21% Date Thu Jan 5 10:59:46 GMT 2012 Rank 37 Aligned Residues 336 % Identity 18% Template c3qanB_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: B: PDB Molecule:1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase 1; PDBTitle: crystal structure of 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase from2 bacillus halodurans Resolution 1.95 Å

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		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	N	S	C	T	A	E	Q	Q	R	Q	L	L	M	R	P	A	I	S	A	S	E	S	I	T	R	T	V	N	D	I	L	D	N	V	K	A	R	G	D	E	A	L	R	E	Y	S	A	K	F	D	K	T	T	V	T	A	L	K	V	S	A	E	E	I	A	A	A	S	E	R	L	S	D	E	L	K	Q	A	M
Query Conservation
Alig confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		W	R	N	V	N	P	E	E	R	A	N	I	L	V	K	A	A	A	I	I	R	R	R	K	H	E	F	S	A	W	L	V	H	E	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	P	W	K	E	A	D	A	D	T
Template Known Secondary structure			T	T	S																			T														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		89	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	130	.	.	.	.
		89	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.			.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.		.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.																																										.
Query SS confidence																	.	.																																										.
Query Sequence		A	V	A	V	K	N	I	E	T	F	H	T	A	Q	K	.	.	L	P	P	V	D	V	E	T	Q	P	G	V	R	C	Q	Q	V	T	R	P	V	A	S	V	G	L	Y	I	P	G	G	S	A	P	L	F	S	T	V	L	M	.	L	A	T	P	A	S	I	A	G	C	K	K	V	V	L	C	S	P	P	P	I
Query Conservation																	.	.																																										.
Alig confidence																	.	.																														.	.	.										.
Template Conservation																																																.	.	.
Template Sequence		A	E	A	I	D	F	L	E	Y	Y	A	R	Q	M	I	E	L	N	R	G	K	E	I	L	S	R	P	G	E	Q	N	R	Y	F	Y	T	P	M	G	V	T	V	T	I	S	P	.	.	.	W	N	F	A	L	A	I	M	V	G	T	A	V	A	P	I	V	T	G	N	T	V	V	L	K	P	A	S	T	T	P
Template Known Secondary structure																			T	T		B						T	T																			.	.	.	S	T	T	T	T													T	T									T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.
Template SS confidence
		135	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180				.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.							.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	D	E	I	L	Y	A	A	Q	L	.	.	.	.	.	.	C	G	V	Q	D	V	F	N	V	G	G	A	Q	A	I	A	A	L	A	F	G	T	E	S	V	P	K	V	D	K	I	F	G	P	G	N	A	F	V	T	E	A	K	R	Q	V	S	Q	R	L	D	G	A	A	I	D	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation												.	.	.	.	.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.																											.	.	.	.			.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																						.	.	.	.																											.	.	.	.
Template Sequence		V	V	A	A	K	F	V	E	V	L	E	D	A	G	L	P	K	G	V	I	N	Y	V	P	G	S	G	A	E	V	G	D	Y	L	V	D	.	.	.	.	H	P	K	T	S	L	I	T	F	T	G	S	K	D	V	G	V	R	L	Y	E	R	A	A	V	V	.	.	.	.	R	P	G	Q	N	H	L	K	R	V
Template Known Secondary structure															T			T	T	S								T	T	T	T							.	.	.	.		T	T								S														S		.	.	.	.		T	T			S
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.																											.	.	.	.
Template SS confidence
		212	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.					.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.					.	.	.	.	.	.	280	.	.	.
		232	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.				270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																								.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																								.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	P	A	G	P	S	E	V	L	V	I	A	D	S	G	A	T	P	D	F	V	A	S	D	L	L	S	Q	A	E	H	G	P	D	S	Q	V	I	.	.	.	L	L	T	P	A	A	D	M	A	R	R	V	A	E	A	V	E	R	Q	L	A	E	L	P	R	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																								.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																								.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	V	E	M	G	G	K	D	T	V	V	V	D	R	D	A	D	L	D	L	A	A	E	S	I	L	V	S	A	F	G	F	S	G	Q	K	C	S	A	G	S	R	A	V	I	H	K	D	V	Y	D	E	V	L	E	K	T	V	A	L	A	K	N	L	T	V	G	D	P	T	N	R	D	N	Y	M	G	P	V	I
Template Known Secondary structure															T	T	S															G	G	G	G		S	T	T									T	T	T													T	T			B	S		T	T	S	T	T		S	B				S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		284	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.
											296	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	T	A	R	Q	A	L	N	A	S	R	L	I	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	K	D	L	A	Q	C	V	E	I	S	N	Q	Y	G	P	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	E	K	A	F	E	K	I	M	S	Y	I	E	I	G	K	K	E	G	R	L	M	T	G	G	E	G	D	S	S	T	G	F	F	I	Q	P	T	I	I	A	D	L	D	P	E	A	V	I	M	Q	E	E	I	F	G	P	V	V	A	F	S	K	A	N	D	F	D	H	A	L	E	I	A	N	N	T	E	Y	G
Template Known Secondary structure		S																T	T	S											S	S	S										S			T	T	S	G	G	G	T	S				S	S								S	S									T		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		364	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.
		327		.	.	330	.	.	.	.	.				.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.			.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380		.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.									.	.	.																													.	.																		.
Query SS confidence			.									.	.	.																													.	.																		.
Query Sequence		H	.	L	I	I	Q	T	R	N	A	.	.	.	R	E	L	V	D	S	I	T	S	A	G	S	V	F	L	G	D	W	S	P	E	S	A	G	D	Y	A	S	.	.	G	T	N	H	V	L	P	T	Y	G	Y	T	A	T	C	S	S	.	L	G	L	A	D	F	Q	K	R	M	T	V	Q	E
Query Conservation			.									.	.	.																													.	.																		.
Alig confidence			.									.	.	.									.																				.	.			.	.	.	.												.
Template Conservation																							.																								.	.	.	.
Template Sequence		L	T	G	A	V	I	T	R	N	R	A	H	I	E	Q	A	K	R	E	F	H	.	V	G	N	L	Y	F	N	R	N	C	T	G	A	I	V	G	Y	H	P	F	G	G	F	.	.	.	.	K	M	S	G	T	D	S	K	A	G	G	P	D	Y	L	A	L	H	M	Q	A	K	T	V	S	E
Template Known Secondary structure		S							S												S		.		S					S	S		S					T	T	T	S		B				.	.	.	.		T	T	B	S				B	T	S	T	T	T	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																							.																								.	.	.	.
Template SS confidence
		444	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.		.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.					.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.