Job Description P06988 Confidence 98.59% Date Thu Jan 5 10:59:46 GMT 2012 Rank 20 Aligned Residues 337 % Identity 16% Template c2hg2A_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:aldehyde dehydrogenase a; PDBTitle: structure of lactaldehyde dehydrogenase Resolution 2.20 Å

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		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	N	S	C	T	A	E	Q	Q	R	Q	L	L	M	R	P	A	I	S	A	S	E	S	I	T	R	T	V	N	D	I	L	D	N	V	K	A	R	G	D	E	A	L	R	E	Y	S	A	K	F	D	K	T	T	V	T	A	L	K	V	S	A	E	E	I	A	A	A	S	E	R	L	S	D	E	L	K	Q	A	M
Query Conservation
Alig confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		W	E	A	L	P	A	I	E	R	A	S	W	L	R	K	I	S	A	G	I	R	E	R	A	S	E	I	S	A	L	I	V	E	E	G	G	K	I	Q	Q	L	A	E	V	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V
Template Known Secondary structure					S																			T																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.																																			.
		89	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.			.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.			.	.
Predicted Secondary structure																				.	.																																																									.	.
Query SS confidence																				.	.																																																									.	.
Query Sequence		A	V	A	V	K	N	I	E	T	F	H	T	A	Q	K	L	P	P	.	.	V	D	V	E	T	Q	P	G	V	R	C	Q	Q	V	T	R	P	V	A	S	V	G	L	Y	I	P	G	G	S	A	P	L	F	S	T	V	L	M	L	A	T	P	A	S	I	A	G	C	K	K	V	V	L	C	S	P	.	.	P	P
Query Conservation																				.	.																																																									.	.
Alig confidence																				.	.																											.	.																													.	.
Template Conservation																																																.	.
Template Sequence		A	F	T	A	D	Y	I	D	Y	M	A	E	W	A	R	R	Y	E	G	E	I	I	Q	S	D	R	P	G	E	N	I	L	L	F	K	R	A	L	G	V	T	T	G	I	L	P	.	.	W	N	F	P	F	F	L	I	A	R	K	M	A	P	A	L	L	T	G	N	T	I	V	I	K	P	S	E	F	T	P	N
Template Known Secondary structure													T	T	T	T	T									S	S	T	T											S								.	.	S	S	S															T	T									T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																																.	.
Template SS confidence
		106	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.			.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180					.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.
Query Sequence		I	A	D	E	I	L	Y	A	A	Q	L	C	G	V	Q	D	.	.	.	.	V	F	N	V	G	G	A	Q	A	I	A	A	L	A	F	G	T	E	S	V	P	K	V	D	K	I	F	G	P	G	N	A	F	V	T	E	A	K	R	Q	V	S	Q	R	L	D	G	A	A	I	D	M	P	A	G	P	S	E	V	L
Query Conservation																		.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.																.	.	.	.																												.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.																												.	.
Template Sequence		N	A	I	A	F	A	K	I	V	D	E	I	G	L	P	R	G	V	F	N	L	V	L	G	R	G	E	T	V	G	Q	E	L	A	G	.	.	.	.	N	P	K	V	A	M	V	S	M	T	G	S	V	S	A	G	E	K	I	M	A	T	A	A	K	N	I	.	.	T	K	V	C	L	E	L	G	G	K	A	P
Template Known Secondary structure														T			T	T	S						S		T	T	T								.	.	.	.		T	T								S														T	T	T	.	.
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.																												.	.
Template SS confidence
		184	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.					.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.			.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.					.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	I	A	D	S	G	A	T	P	D	F	V	A	S	D	L	L	S	Q	A	E	H	G	.	.	.	.	P	D	S	Q	V	I	L	L	T	P	A	A	D	M	A	R	R	V	A	E	A	V	E	R	Q	L	A	E	L	P	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																									.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.											.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																							.
Template Sequence		A	I	V	M	D	D	A	D	L	E	L	A	V	K	A	I	V	D	S	R	V	I	N	S	G	Q	V	C	N	C	A	E	R	V	Y	V	Q	.	K	G	I	Y	D	Q	F	V	N	R	L	G	E	A	M	Q	A	V	Q	F	G	N	P	A	E	R	N	D	I	A	M	G	P	L	I	N	A	A	A	L	E	R
Template Known Secondary structure						T	T	S														T	G	G	G	G	T	S	S	S	S								.																	T			B			T	T	T		S	S		S	B				S	S
Template Predicted Secondary structure																																							.
Template SS confidence
		258	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.		.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.
			295	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.		.	.	330	.
Predicted Secondary structure		.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Query SS confidence		.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Query Sequence		.	A	E	T	A	R	Q	A	L	N	A	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	L	I	V	T	K	D	L	A	Q	C	V	E	I	S	N	Q	Y	G	P	E	H	.	L	I	I	Q
Query Conservation		.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Alig confidence		.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template Conservation
Template Sequence		V	E	Q	K	V	A	R	A	V	E	E	G	A	R	V	A	F	G	G	K	A	V	E	G	K	G	Y	Y	Y	P	P	T	L	L	L	D	V	R	Q	E	M	S	I	M	H	E	E	T	F	G	P	V	L	P	V	V	A	F	D	T	L	E	D	A	I	S	M	A	N	D	S	D	Y	G	L	T	S	S	I	Y
Template Known Secondary structure													T												S	S	S										S			T	T	S	G	G	G	S	S				S	S								S	S										S	S	S			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		337	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.
		332	.	.	.				.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.
Query SS confidence						.	.	.
Query Sequence		T	R	N	A	.	.	.	R	E	L	V	D	S	I	T	S	A	G	S	V	F	L	G	D	W	S	P	E	S	A	G	D	Y	A	S	G	T	N	H	V	L	P	T	Y	G	Y	T	A	T	C	S	S	L	G	L	A	D	F	Q	K	R	M	T	V	Q
Query Conservation						.	.	.
Alig confidence						.	.	.									.																								.	.	.	.
Template Conservation																	.																								.	.	.	.
Template Sequence		T	Q	N	L	N	V	A	M	K	A	I	K	G	L	K	.	F	G	E	T	Y	I	N	R	E	N	F	E	A	M	Q	G	F	H	A	G	W	R	K	.	.	.	.	S	G	I	G	G	A	D	G	K	H	G	L	H	E	Y	L	Q	T	Q	V	V	Y
Template Known Secondary structure																	.	S	S					S	S						T	T	S		B					T	.	.	.	.	T			S		B	S							T	T
Template Predicted Secondary structure																	.																								.	.	.	.
Template SS confidence
		417	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.		.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.					.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.