Job Description P37388 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:55:35 GMT 2012 Rank 8 Aligned Residues 353 % Identity 20% Template c2ygrD_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: D: PDB Molecule:uvrabc system protein a; PDBTitle: mycobacterium tuberculosis uvra Resolution 3.40 Å

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		125	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.		.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.			.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.
Predicted Secondary structure													.																												.	.
Query SS confidence													.																												.	.
Query Sequence		K	L	L	A	Q	V	S	L	S	I	S	.	P	D	T	R	V	G	D	L	G	L	G	Q	Q	Q	L	V	E	I	A	K	A	L	N	K	Q	V	R	.	.	L	L	I	L	D	E	P	T	A	S	L	T	E	Q	E	T	S	I	L	L	D	I	I	R	D	L	Q	Q	H	G	I	A	C	I	Y	I	S	H	K
Query Conservation													.																												.	.
Alig confidence													.																												.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	F	L	L	D	V	G	L	E	Y	L	S	L	S	R	A	A	A	T	L	S	G	G	E	A	Q	R	I	R	L	A	T	Q	I	G	S	G	L	V	G	V	L	Y	V	L	D	E	P	S	I	G	L	H	Q	R	D	N	R	R	L	I	E	T	L	T	R	L	R	D	L	G	N	T	L	I	V	V	E	H	D
Template Known Secondary structure							T	T		T	T	S		T	T	S	B	G	G	G																T	T				S								T	T	T	T																											B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		482	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.
		202	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.							.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.				.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.																			.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.																			.	.	.
Query Sequence		L	N	E	V	K	A	I	S	D	T	I	C	V	I	.	.	.	.	.	.	R	D	G	Q	H	I	G	T	R	D	A	A	G	M	S	E	D	D	.	.	.	I	I	T	M	M	V	G	R	E	L	T	A	L	Y	P	N	E	P	H	T	T	G	D	E	I	L	R	I	E	H	L	T	A	W	H	P	V	N	R
Query Conservation																.	.	.	.	.	.																			.	.	.
Alig confidence						.										.	.	.	.	.	.																			.	.	.																																				.	.	.	.
Template Conservation						.																																																																								.	.	.	.
Template Sequence		E	D	T	I	.	E	H	A	D	W	I	V	D	I	G	P	G	A	G	E	H	G	G	R	I	V	H	S	G	P	Y	D	E	L	L	R	N	K	D	S	I	T	G	A	Y	L	S	G	R	E	S	I	E	I	P	A	I	R	R	S	V	D	P	R	R	Q	L	T	V	V	G	A	R	E	H	N	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						.		T		S						S	S	S	S	G	G	G			S														S	S									T	S							S	S						T	T	S									S	T	T	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure						.																																																																								.	.	.	.
Template SS confidence
		562	.	.	.		.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.
		273	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.			.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350
Predicted Secondary structure																																			.	.
Query SS confidence																																			.	.
Query Sequence		H	I	K	R	V	N	D	V	S	F	S	L	K	R	G	E	I	L	G	I	A	G	L	V	G	A	G	R	T	E	T	I	Q	.	.	C	L	F	G	V	W	P	G	Q	W	E	G	K	I	Y	I	D	G	K	Q	V	D	I	R	N	C	Q	Q	A	I	A	Q	G	I	A	M	V	P	E	D	R	K	R	D	G
Query Conservation																																			.	.
Alig confidence		.	.	.	.																														.	.										.																			.	.
Template Conservation		.	.	.	.																																									.																			.	.
Template Sequence		.	.	.	.	L	R	G	I	D	V	S	F	P	L	G	V	L	T	S	V	T	G	V	S	G	S	G	K	S	T	L	V	N	D	I	L	A	A	V	L	A	N	R	L	.	N	G	A	R	Q	V	P	G	R	H	T	R	V	T	G	L	D	Y	.	.	L	D	K	L	V	R	I	D	Q	S	P	I	G	R	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.			S							S	S	S							S	T	T	S	S								T									T	.	S								S	S						G	G	G	.	.										S		S		S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																									.																			.	.
Template SS confidence
						637	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.		.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.			.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		351
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	R	S	N	P	A	T	Y	T	G	V	F	D	K	I	R	T	L	F	A	A	T	N	E	A	K	V	R	G	Y	K	P	G	R	F	S	F	N	V	K	G	G	R	C	E	A	C	T	G	D	G	T	I	K	I	E	M	N	F	L	P	D	V	Y	V	P	C	E	V	C	Q	G	A	R	Y	N	R	E	T	L
Template Known Secondary structure		T	T		S						T											T	S					T	T	T			G	G	G	S		T	T	S	T	T	T	B		S	S	S	T	T	S	S							S	S	S								T	T	T	T	S		S	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.
					352	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.				.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.																																																																									.	.	.
Query SS confidence		.	.	.																																																																									.	.	.
Query Sequence		.	.	.	V	P	V	M	A	V	G	K	N	I	T	L	A	A	L	N	K	F	T	G	G	I	S	Q	L	D	D	A	A	E	Q	K	C	I	L	E	S	I	Q	Q	L	K	V	K	T	S	S	P	D	L	A	I	G	R	L	S	G	G	N	Q	Q	K	A	I	L	A	R	C	L	L	L	N	.	.	.	P	R
Query Conservation		.	.	.																																																																									.	.	.
Alig confidence		.	.	.																	.	.	.	.																																																					.	.	.
Template Conservation																					.	.	.	.
Template Sequence		E	V	H	Y	K	G	K	T	V	S	E	V	L	D	M	S	I	E	E	.	.	.	.	A	A	E	F	F	E	P	I	A	G	V	H	R	Y	L	R	T	L	V	D	V	G	L	G	Y	V	R	L	G	Q	P	A	P	T	L	S	G	G	E	A	Q	R	V	K	L	A	S	E	L	Q	K	R	S	T	G	R	T
Template Known Secondary structure		T			B	T	T	B							T	S	B				.	.	.	.					S	T	T														S	S		S	S	S	B	T	T			G	G	G	S														S	S	S				S	S
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.
Template SS confidence
		790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.					.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.
		426	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.							.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																							.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	L	I	L	D	E	P	T	R	G	I	D	I	G	A	K	Y	E	I	Y	K	L	I	N	Q	L	V	Q	Q	G	I	A	V	I	V	I	S	S	E	L	P	E	V	L	G	L	S	D	R	V	L	V	M	.	.	.	.	.	.	H	E	G	K	L	K	A	N	L	I	N	H	N	L	T	Q
Query Conservation																																																							.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																															.								.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.
Template Sequence		V	Y	I	L	D	E	P	T	T	G	L	H	F	D	D	I	R	K	L	L	N	V	I	N	G	L	V	D	K	G	N	T	V	I	V	I	E	H	N	L	D	V	I	K	T	.	S	D	W	I	I	D	L	G	P	E	G	G	A	G	G	G	T	V	V	A	Q	G	T	P	E	D	V	A	A
Template Known Secondary structure							S	S	S	T	T																				T																.		S							S	S	S	T	T	S		S						S						T	T
Template Predicted Secondary structure																																															.
Template SS confidence
		866	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910		.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.