Job Description P37388 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:55:35 GMT 2012 Rank 9 Aligned Residues 481 % Identity 20% Template c2r6fA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:excinuclease abc subunit a; PDBTitle: crystal structure of bacillus stearothermophilus uvra Resolution 3.20 Å

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		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.							.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	E	M	K	N	I	T	K	T	F	G	S	V	K	A	I	D	N	V	C	L	R	L	N	A	G	E	I	V	S	L	C	G	E	N	G	S	G	K	S	T	L	M	K	V	L	C	G	I	.	.	.	.	.	.	Y	P	H	G	S	Y	E	G	E	I	I	F	A	G	E	E	I	Q	A	S	H	I	R	D	T
Query Conservation																																																			.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.
Template Sequence		I	I	V	K	G	A	.	.	.	.	.	R	A	H	N	L	K	N	I	D	V	E	I	P	R	G	K	L	V	V	L	T	G	L	S	G	S	G	K	S	S	L	A	F	D	T	I	Y	A	E	G	Q	R	R	Y	V	E	S	L	S	A	Y	A	R	Q	F	L	G	Q	X	E	K	P	D	V	D	A	I	E	G
Template Known Secondary structure								.	.	.	.	.		S	S	S			S							T	T	S							S	T	T	S	S						T	T	T											T	T	S										T	S				S						S
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.						10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.
		79	80	.	.	.	.	.					.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100						.	.	.	.	.	.						.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.										.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.																.	.	.	.	.							.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.																.	.	.	.	.							.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	R	K	G	I	A	I	.	.	.	.	I	H	Q	E	L	A	L	V	K	E	L	T	V	L	E	.	.	.	.	.	N	I	F	L	G	N	.	.	.	.	.	E	I	T	H	N	G	I	M	D	Y	D	L	M	T	L	R	C	Q	K	L	L	A	Q	V	S	L	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	S
Query Conservation									.	.	.	.																.	.	.	.	.							.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.											.					.	.	.	.	.							.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.
Template Sequence		L	S	P	A	I	S	I	D	Q	K	T	T	S	R	N	P	R	S	T	V	G	.	T	V	T	E	I	Y	D	Y	L	R	L	L	F	A	R	I	G	R	P	I	C	P	T	H	G	I	E	I	Q	S	Q	T	I	E	Q	X	V	D	R	L	L	S	Y	P	E	R	T	K	X	Q	I	L	A	P	I	D	V	V
Template Known Secondary structure									S	S	T	T	S				T	T		B			.			T	S												T				B		T	T	T			B															T	S		T	T
Template Predicted Secondary structure																							.
Template SS confidence
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.		100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
		136	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	D	T	R	V	G	D	L	G	L	G	Q	Q	Q	L	V	E	I	A	K	A	L	N	K	Q	V	R	L	L	I	L	D	E	P	T	A	S	L	T	E	Q	E	T	S	I	L	L	D	I	I	R	D	L	Q	Q	H	G	I	A	C	I	Y	I	S	H	K	L	N	E	V	K	A	I	S	D	T	I	C	V	I
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		V	D	R	I	I	I	K	D	G	I	A	A	R	L	A	D	S	L	E	T	A	L	K	L	A	D	G	K	V	V	V	D	V	I	G	E	G	E	L	L	F	S	E	K	H	A	C	P	Y	C	G	F	S	I	G	E	L	E	P	R	L	F	S	F	N	S	P	F	G	A	C	P	D	C	D	G	L	G	A	K
Template Known Secondary structure									S	T	T															T	T	S							T	T	T							S	S				T	T	T									G	G	G	G		S	S	S	T	T	T	B		T	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		204	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	E	V	D	L	D	L	V	I	P	N	D	E	L	T	L	K	E	H	A	I	A	P	W	E	P	Y	Y	P	Q	L	L	E	A	V	C	R	H	Y	G	I	P	X	D	V	P	V	K	D	L	P	K	E	Q	L	D	K	I	L	Y	G	S	G	G	E	P	I	Y	F	R	Y	T	N	D	F	G	Q	V	R	E
Template Known Secondary structure											S	S	S			B	G	G	G		S	S	S	S	S																			S	S		B	G	G	G	S													T	T					B			B		S	S	S		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		284	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	Y	I	A	F	E	G	V	I	P	N	V	E	R	R	Y	R	E	T	S	S	D	Y	I	R	E	Q	X	E	K	Y	X	A	E	Q	P	C	P	T	C	Q	G	Y	R	L	K	K	E	S	L	A	V	L	V	G	G	K	H	I	G	E	V	T	A	X	S	V	T	E	A	L	A	F	F	D	G	L	E	L	T
Template Known Secondary structure		B																					T	T						G	G	G							T	T	T	T	T	S		B		T	T	T	T	T			S	S	S		B						T	S	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		368	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	K	E	A	Q	I	A	R	L	I	L	R	E	I	R	D	R	L	G	F	L	Q	N	V	G	L	D	Y	L	T	L	S	R	S	A	G	T	L	S	G	G	E	A	Q	R	I	R	L	A	T	Q	I	G	S	R	L	T	G	V	L	Y	V	L	D	E	P	S	I	G	L	H	Q	R	D	N	D	R	L	I	A
Template Known Secondary structure								S																		T		T	T	S	B	S	S	S	B	G	G	G																T	T				S								T	T	T	T			G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		448	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.
																																							216	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	D	G	Q	H	I	G	T	R	D	A	A	G	M	S	E	D	D	I	I	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	L	K	S	X	R	D	L	G	N	T	L	I	V	V	E	H	D	E	D	T	X	L	A	A	D	Y	L	I	D	I	G	P	G	A	G	I	H	G	G	E	V	V	A	A	G	T	P	E	E	V	X	N	D	P	N	S	L	T	G	Q	Y	L	S	G	K	K	F	I	P	I	P	A	E	R	R	R	P	D	G
Template Known Secondary structure								T	T	T															S		S							S	S	S	G	G	G			S							T	T	T	T	T	T		T	T		T	T						T	S	S						S	S						S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		528	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.
																																																																				237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	M	V	G	R	E	L	T	A	L	Y	P	N	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	W	L	E	V	V	G	A	R	E	H	N	L	K	N	V	S	V	K	I	P	L	G	T	F	V	A	V	T	G	V	S	G	S	G	K	S	T	L	V	N	E	V	L	Y	K	A	L	A	Q	K	L	H	R	A	K	A	K	P	G	E	H	R	D	I	R	G	L	E	H	L	D	K	V	I	D	I	D	Q	S
Template Known Secondary structure											S	S	S			S							S	S	S						B		T	T	S	S						T	T	T																		S		S					G	G	G		S							S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		608	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.
		251	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	H	T	T	G	D	E	I	L	R	I	E	H	L	T	A	W	H	P	V	N	R	H	I	K	R	V	N	D	V	S	F	S	L	K	R	G	E	I	L	G	I	A	G	L	V	G	A	G	R	T	E	T	I	Q	C	L	F	G	V	W	P	G	Q	W	E	G	K	I	Y	I	D	G	K	Q	V	D	I	R	N
Query Conservation
Alig confidence																							.	.	.																																									.
Template Conservation																							.	.	.																																									.
Template Sequence		P	I	G	R	T	P	R	S	N	P	A	T	Y	T	G	V	F	D	D	I	R	.	.	.	D	V	F	A	S	T	N	E	A	K	V	R	G	Y	K	K	G	R	F	S	F	N	V	K	G	G	R	C	E	A	C	H	G	D	G	I	I	K	I	E	.	X	H	F	L	P	D	V	Y	V	P	C	E	V	C	H
Template Known Secondary structure			S		S	S	T	T								T							.	.	.					T	S						T	T			T	T	T	T		T	T	S	T	T	T	B		T	T	T	T	T		S						.		S	S	S								T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.																																									.
Template SS confidence
		688	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.				.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.		.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.
		331	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		C	Q	Q	A	I	A	Q	G	I	A	M	V	P	E	D	R	K	R	D	G	I	V	P	V	M	A	V	G	K	N	I	T	L	A	A	L	N	K	F	T	G	G	I	S	Q	L	D	D	A	A	E	Q	K	C	I	L	E	S	I	Q	Q	L	K	V	K	T	S	S	P	D	L	A	I	G	R	L	S	G	G	N
Query Conservation
Alig confidence					.	.	.	.	.									.	.	.	.																					.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.	.									.	.	.	.																					.	.	.	.
Template Sequence		G	K	R	.	.	.	.	.	Y	N	R	E	T	L	E	V	.	.	.	.	T	Y	K	G	K	N	I	A	E	V	L	D	X	T	V	E	D	A	L	D	.	.	.	.	F	F	A	S	I	P	K	I	K	R	K	L	E	T	L	Y	D	V	G	L	G	Y	X	K	L	G	Q	P	A	T	T	L	S	G	G	E
Template Known Secondary structure		T			.	.	.	.	.	B		T	T	G	G	G		.	.	.	.		B	T	T	B							T	S	B							.	.	.	.		T		S														T	T		S	S	S	B	T	T			G	G	G
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.									.	.	.	.																					.	.	.	.
Template SS confidence
		764	.	.						.	.	.	770	.	.	.	.					.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.					.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830
		411	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.				.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.							.	480	.
Predicted Secondary structure															.	.	.																																																								.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.																																																								.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	Q	K	A	I	L	A	R	C	L	L	L	N	.	.	.	P	R	I	L	I	L	D	E	P	T	R	G	I	D	I	G	A	K	Y	E	I	Y	K	L	I	N	Q	L	V	Q	Q	G	I	A	V	I	V	I	S	S	E	L	P	E	V	L	G	L	S	D	R	V	L	V	M	.	.	.	.	.	.	H	E	G
Query Conservation															.	.	.																																																								.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.																																																.								.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																	.
Template Sequence		A	Q	R	V	K	L	A	A	E	L	H	R	R	S	N	G	R	T	L	Y	I	L	D	E	P	T	T	G	L	H	V	D	D	I	A	R	L	L	D	V	L	H	R	L	V	D	N	G	D	T	V	L	V	I	E	H	N	L	D	V	I	K	T	.	A	D	Y	I	I	D	L	G	P	E	G	G	D	R	G	G
Template Known Secondary structure												S	S				S									T	T	T	T																			T	T														T	T	.		S							S	S	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																																																	.
Template SS confidence
		831	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.		.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		482	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.												.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	L	K	A	N	L	I	N	H	N	L	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	E	Q	V	M	E	A	A	L	R	S	E	H	H	V	E
Query Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	I	V	A	V	G	T	P	E	E	V	A	E	V	K	E	S	H	T	G	R	Y	L	K	P	I	L	E	R	D	R	A	R	X	Q	A	R	Y	E
Template Known Secondary structure		S						S						T		T	T																							T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.