![]() |
|
![]() |
  | Insertion relative to template |
  | Deletion relative to template |
  | Catalytic residue from the CSA |
  | |
Detailed help on interpreting your alignment |
  |   | 436 | . | . | . | 440 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 450 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 460 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 470 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 480 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 490 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 500 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 510 | . | ||||
Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | H | D | I | Q | K | N | A | D | G | S | W | T | A | N | G | H | M | P | L | E | D | L | V | Q | Y | V | P | L | P | L | D | . | . | . | . | E | K | R | E | Y | H | T | I | A | G | L | L | M | E | Y | L | Q | R | I | P | K | P | G | E | E | V | Q | V | G | D | Y | L | L | K | T | L | Q | V | E | S | H | R | V | Q | K |
Template Sequence |   | D | E | I | V | Q | R | E | D | G | S | W | L | V | D | G | X | V | S | L | D | R | F | R | E | F | F | E | L | E | A | P | L | P | G | E | A | G | G | N | I | H | T | L | A | G | V | X | L | Y | Q | L | G | R | V | P | S | V | T | D | R | F | E | W | N | G | F | S | F | E | V | V | D | X | D | R | T | R | V | D | K |
Template Known Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | B | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | S | T | T | G | G | G | S | B | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 341 | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 370 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 380 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 390 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 400 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 410 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 420 |
  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 512 | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | V | Q | I | I | P | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Sequence |   | I | L | V | Q | R | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Known Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 421 | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |
Download: | Text version | FASTA pairwise alignment | 3D Model in PDB format |
Phyre is for academic use only
Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server | ||||||||
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX] | ||||||||
  | ||||||||
|
|