Job Description P77650 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:31:22 GMT 2012 Rank 49 Aligned Residues 379 % Identity 17% Template c2hqmB_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: B: PDB Molecule:glutathione reductase; PDBTitle: crystal structure of glutathione reductase glr1 from the yeast2 saccharomyces cerevisiae Resolution 2.40 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.
Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	E	K	T	I	I	I	V	G	G	G	Q	A	A	A	M	A	A	A	S	L	R	Q	Q	G	F	T	G	E	L	H	L	F	S	D	E	R	H	L	P	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																												.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.	.
Template Sequence		K	H	Y	D	Y	L	V	I	G	G	G	S	G	G	V	A	S	A	R	R	A	A	S	Y	G	A	.	.	K	T	L	L	V	E	A	K	A	L	G	G	T	C	V	N	V	G	C	V	P	K	K	V	M	W	Y	A	S	D	L	A	T	R	V	S	H	A	N	E	Y	G	L	Y	Q	N	L	P	L	D	K	E
Template Known Secondary structure												S													T			.	.							S	S		T	T							S																					T	T	T	T		S	T	T	S			S	G	G
Template Predicted Secondary structure																												.	.
Template SS confidence
		22	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.			.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.
				43	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.		.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.																																																							.
Query SS confidence		.	.																																																							.
Query Sequence		.	.	E	R	P	P	L	S	K	S	M	L	L	E	D	S	P	Q	L	Q	Q	V	L	P	A	N	W	W	Q	E	N	N	V	H	L	H	S	G	V	T	I	K	T	L	G	R	D	T	R	E	L	V	L	T	N	G	.	E	S	W	H	W	D	Q	L	F	I	A	T	G	A	A	A	R	P	L	P	L	L	D
Query Conservation		.	.																																																							.
Alig confidence		.	.																																																							.
Template Conservation
Template Sequence		H	L	T	F	N	W	P	E	F	K	Q	K	R	D	A	Y	V	H	R	L	N	G	I	Y	Q	K	N	L	E	K	E	K	V	D	V	V	F	G	W	A	R	F	N	K	D	G	N	V	E	V	Q	K	R	D	N	T	T	E	V	Y	S	A	N	H	I	L	V	A	T	G	G	K	A	I	F	P	E	N	I	P
Template Known Secondary structure		G																														T	T												T	T	S							T	T	S																						T	T	S	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	L	G	E	R	C	F	T	L	R	H	A	G	D	A	A	R	L	R	E	V	L	Q	P	E	R	S	V	V	I	I	G	A	G	T	I	G	L	E	L	A	A	S	A	T	Q	R	R	C	K	V	T	V	I	E	L	A	A	T	V	M	G	R	N	A	P	P	P	V	Q	R	Y	L	L	Q	R	H	Q	Q	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																																																								.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																																																								.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	G	F	E	L	G	T	D	S	D	G	F	F	R	L	E	E	Q	P	K	K	V	V	V	V	G	A	G	Y	I	G	I	E	L	A	G	V	F	H	G	L	G	S	E	T	H	L	V	I	R	G	E	T	V	L	R	.	K	F	D	E	C	I	Q	N	T	I	T	D	H	Y	V	K	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	T	G	G	G	S	B										S			S							S	S													T	T								S	S	S	S	S		T	.	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																																																								.
Template SS confidence
									180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.		.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.
		200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.				.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250				.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.																																	.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.																																	.	.	.
Query Sequence		G	V	R	I	L	L	N	N	A	I	E	H	V	V	D	G	E	K	V	.	.	.	E	L	T	L	Q	S	G	E	T	L	Q	A	D	V	V	I	Y	G	I	G	I	S	A	N	E	Q	L	A	R	E	A	N	.	.	.	L	D	T	A	N	G	I	V	I	D	E	A	C	R	T	C	D	P	A	I	F	A	G
Query Conservation																					.	.	.																																	.	.	.
Alig confidence																					.	.	.																																	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	I	N	V	H	K	L	S	K	I	V	K	V	E	K	N	V	T	D	K	L	K	I	H	M	N	D	S	K	S	I	D	D	V	D	E	L	I	W	T	I	G	R	K	S	H	L	G	M	G	S	E	N	V	G	I	K	L	N	S	H	D	Q	I	I	A	D	E	Y	Q	N	T	N	V	P	N	I	Y	S	L
Template Known Secondary structure		T					T	T																			T	T	S							S						S								S		G	G	G	T	T			B		T	T	S		B				T	T		B		S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		252	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.
		274	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.					.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																											.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	D	V	A	I	T	R	L	D	N	G	A	L	H	R	C	E	S	W	E	N	A	N	N	Q	A	Q	I	A	A	A	A	M	L	G	L	P	L	P	L	L	.	.	.	.	P	P	P	W	F	W	S	D	Q	Y	S	D	N	L	Q	F	I	G	D	M	R	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																											.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	D	V	V	G	K	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	L	T	P	V	A	I	A	A	G	R	K	L	S	N	R	L	F	G	P	E	K	F	R	N	D	K	L	D	Y	E	N	V	P	S	V	I	F	S	H	P	E	A	G	S	I	G	I	S	E	K	E	A	I	E	K	Y	G	K	E	N	I	K	V
Template Known Secondary structure		G	G	G	T	T	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			S		G	G	G	T	T						T	T								S	S																		G	G	G
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		333	.	.	.	.	.	.										340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.
											338	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.			.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.		.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.																			.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.																			.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	W	L	C	R	G	N	P	E	T	Q	K	A	I	W	F	N	L	Q	N	G	V	L	I	G	A	V	T	L	N	.	.	Q	G	R	E	I	R	P	I	R	K	W	I	Q	S	G	K	T	F	.	D	A	K	L	L	I	D	E	N	I	A	L	K	S
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.																			.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.																			.
Template Conservation
Template Sequence		Y	N	S	K	F	T	A	M	Y	Y	A	M	L	S	E	K	S	P	T	R	Y	K	I	V	C	A	G	P	N	E	K	V	V	G	L	H	I	V	G	D	S	S	A	E	I	L	Q	G	F	G	V	A	I	K	M	G	A	T	K	A	D	F	D	N	C	V	A	I	H	P	T	S	A	E
Template Known Secondary structure									G	G	G	G	G		S	S												T	T	T	T									S	T	T														T	T		B						T	S				S	S		S	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		404	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.