Job Description P77650 Confidence 99.88% Date Thu Jan 5 12:31:22 GMT 2012 Rank 104 Aligned Residues 293 % Identity 16% Template c1w4xA_ PDB info PDB header:oxygenase Chain: A: PDB Molecule:phenylacetone monooxygenase; PDBTitle: phenylacetone monooxygenase, a baeyer-villiger2 monooxygenase Resolution 1.7 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.																										.	.	.
Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	E	K	T	I	I	I	V	G	G	G	Q	A	A	A	M	A	A	A	S	L	R	Q	Q	G	F	T	G	E	L	H	L	F	S	D	E	R	H	L	P	Y	E	R	P	P	L	S	K	S	M	L	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	D	S
Query Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																												.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.	.
Template Sequence		E	E	V	D	V	L	V	V	G	A	G	F	S	G	L	Y	A	L	Y	R	L	R	E	L	G	R	.	.	S	V	H	V	I	E	T	A	G	D	V	G	G	V	W	Y	W	N	R	Y	P	G	A	R	C	D	I	E	S	I	E	Y	C	Y	S	F	S	E	E	V	L	Q	E	W	N	W	T	E	R	Y	A	S
Template Known Secondary structure		S										S													T	T		.	.							S	S	S	S	S		T								T	T		B		S	S		T	T	T	S	S			S												B	S	S		B
Template Predicted Secondary structure																												.	.
Template SS confidence
		15	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40			.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.
		57	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.			.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.					90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130
Predicted Secondary structure																				.	.																.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.																.	.	.	.
Query Sequence		P	Q	L	Q	Q	V	L	P	A	N	W	W	Q	E	N	N	V	H	.	.	L	H	S	G	V	T	I	K	T	L	G	R	D	T	R	.	.	.	.	E	L	V	L	T	N	G	E	S	W	H	W	D	Q	L	F	I	A	T	G	A	A	A	R	P	L	P	L	L	D	A	L	G	E	R	C	F	T	L	R	H
Query Conservation																				.	.																.	.	.	.
Alig confidence																				.	.																.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	P	E	I	L	R	Y	I	N	F	V	A	D	K	F	D	L	R	S	G	I	T	F	H	T	T	V	T	A	A	A	F	D	E	A	T	N	T	W	T	V	D	T	N	H	G	D	R	I	R	A	R	Y	L	I	M	A	S	G	Q	L	S	V	P	Q	L	P	N	F	P	G	L	K	D	F	A	G	N	L	Y
Template Known Secondary structure																T	T	G	G	G	G				S										T	T	T	T							T	T															S										T	T	G	G	G			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		93	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.
		131	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	G	D	A	A	R	L	R	E	V	L	Q	P	E	R	S	V	V	I	I	G	A	G	T	I	G	L	E	L	A	A	S	A	T	Q	R	R	C	K	V	T	V	I	E	L	A	A	T	V	M	G	R	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	T	G	N	W	P	H	E	P	V	D	F	S	G	Q	R	V	G	V	I	G	T	G	S	S	G	I	Q	V	S	P	Q	I	A	K	Q	A	A	E	L	F	V	F	Q	R	T	P	H	F	A	V	P	A	R	N	A	P	L	D	P	E	F	L	A	D	L	K	K	R	Y	A	E	F	R	E	E	S	R	N	T
Template Known Secondary structure			G	G	G			S	S					B	T									S														B	S							S	S											B											T	T										T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		173	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.
																																																																			184	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	P	P	P	V	Q	R	Y	L	L	Q	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	G	G	T	H	R	Y	Q	G	P	K	S	A	L	E	V	S	D	E	E	L	V	E	T	L	E	R	Y	W	Q	E	G	G	P	D	I	L	A	A	Y	R	D	I	L	R	D	R	D	A	N	E	R	V	A	E	F	I	R	N	K	I	R	N	T	V	R	D	P	E	V	A	E	R	L	V	P	K	G	Y	P
Template Known Secondary structure		S	S	S	S							S		T	T	T	S																	S	G	G	G	G	G	S	S	T	T	T	T	T																					S	S								S			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		253	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.
																195	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.			.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	H	Q	Q	A	G	V	R	I	L	L	.	.	N	N	A	I	E	H	V	V	D	G	E	K	V	E	L	T	L	Q	S	G	E	T	L	Q	A	D	V	V	I	Y	G	I	G	I	S	A	N	E	Q	L	A	R	E	A	N	L	D	T	A	N	G	I	V
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.													.	.	.							.
Template Conservation																																									.	.	.							.
Template Sequence		F	G	T	K	R	L	I	L	E	I	D	Y	Y	E	M	F	N	R	D	N	V	H	L	V	D	T	L	S	A	P	I	E	T	I	T	P	R	G	V	.	.	.	R	T	S	E	R	E	.	Y	E	L	D	S	L	V	L	A	T	G	F	D	A	L	T	G	A	L	F	K	I	D	I	R	G	V	G	N	V	A
Template Known Secondary structure		S	S	S	S						S	S					T	T	S	T	T						T	T	T	S							S	S			.	.	.			S	S			.				S											T	T					T	S					G	G	G		B
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.							.
Template SS confidence
		333	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.				.	.	.	.	.	.		.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.
		259	260	.	.												.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	D	E	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	R	T	C	D	P	A	I	F	A	G	G	D	V	A	I	T	R	L	D	N	G	A	L	H	R	C	E	S	W	E	N	A	N	N	Q	A	Q	I	A	A	A	A	M
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	K	E	K	W	A	A	G	P	R	T	Y	L	G	L	S	T	A	G	F	P	N	L	F	F	I	A	.	.	.	.	.	.	G	P	G	S	P	S	A	L	S	N	M	L	V	S	I	E	Q	H	V	E	W	V	T	D	H	I
Template Known Secondary structure						T	T	T	S				B	T	T	T	B		T	T	S	T	T				S	S	.	.	.	.	.	.		T	T	S	S	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		409	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.							.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.