![]() |
|
![]() |
  | Insertion relative to template |
  | Deletion relative to template |
  | Catalytic residue from the CSA |
  | |
Detailed help on interpreting your alignment |
  |   | 139 | 140 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 | . | . | . | |||||
Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | G | F | T | M | Y | G | K | T | A | G | V | I | G | T | G | K | I | G | V | A | M | L | R | I | L | K | G | F | G | M | . | R | L | L | A | F | D | P | Y | P | S | A | A | A | L | E | L | G | V | E | Y | V | D | L | P | T | L | F | S | . | E | S | D | V | I | S | L | H | C | P | L | T | . | . | . | P | E | N | Y | H |
Template Sequence |   | R | V | E | I | K | N | N | I | C | V | V | L | G | S | G | G | A | A | R | A | V | L | Q | Y | L | K | D | N | F | A | K | D | I | Y | V | V | T | R | N | P | . | . | . | . | . | E | K | E | F | K | V | I | S | Y | D | E | L | S | N | L | K | G | D | V | I | I | N | C | T | P | K | G | M | Y | P | K | E | G | E | S |
Template Known Secondary structure |   | T | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | T | . | . | . | . | . | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | T | T | S | T | T | T | T | |||||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 210 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 | . | . | . | . | |||||
  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 214 | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | L | L | N | E | A | A | F | E | Q | M | K | N | G | V | M | I | V | N | T | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Sequence |   | P | V | D | K | E | V | V | . | . | . | A | K | F | S | S | A | V | D | L | I | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Known Secondary structure |   | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | T | T | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 291 | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |
Download: | Text version |
No model constructed - rank, confidence too low
Phyre is for academic use only
Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server | ||||||||
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX] | ||||||||
  | ||||||||
|
|